拟南芥转录因子GRAS家族基因群响应渗透和干旱胁迫的初

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1、植物学报ChineseBulletinofBotany2009,44(3):290-299,www.chinbullbotany.comdoi:10.3969/j.issn.1674-3466.2009.03.005.研究报告.拟南芥转录因子GRAS家族基因群响应渗透和干旱胁迫的初步探索1,3†2†2222221*2*郭华军,焦远年,邸超,姚冬霞,张盖华,郑雪,刘岚,张群莲,郭蔼光,苏震123西北农林科技大学生命科学学院,杨凌712100;中国农业大学生物学院,北京100193;山西农业大学农学院,太谷030801摘要GRAS家族是一类植物特有的转录调控因子,已有报道

2、表明该家族基因在植物生长发育和光信号转导过程中具有重要作用。目前在拟南芥(Arabidopsisthaliana)基因组中已鉴定了33个GRAS家族基因。利用功能基因组学和生物信息学手段,通过基因芯片数据挖掘和基因功能预测,对拟南芥GRAS家族基因在渗透和干旱胁迫过程中的应答模式进行了初步探索,提出了一类响应渗透胁迫和干旱胁迫的拟南芥GRAS家族基因。以SCL13为例,利用基因芯片相关性和GO分析,对其在渗透胁迫信号转导过程中可能的调控机制进行了预测和分析。这一研究将为阐明GRAS家族基因参与水分胁迫的分子机制提供新的思路,同时也为植物抗逆分子育种提供候选基因。关键词

3、干旱胁迫,表达谱分析,GRAS家族基因,渗透胁迫,SCL13郭华军,焦远年,邸超,姚冬霞,张盖华,郑雪,刘岚,张群莲,郭蔼光,苏震(2009).拟南芥转录因子GRAS家族基因群响应渗透和干旱胁迫的初步探索.植物学报44,290-299.转录因子也称反式作用因子,是能够与真核基因启物抗逆及在高等植物改良上的应用均证明其在基因的表动子区域中顺式作用元件发生特异性相互作用的DNA达调控以及高等植物的整个生命过程中都起着关键作结合蛋白,通过它们之间以及与其它相关蛋白之间的相用。通过遗传学和分子生物学研究,表明许多转录因子互作用,激活或抑制转录。在转录水平上与DNA发生及其基因

4、家族在响应外界环境胁迫时起重要调控作用。相互作用的蛋白质分子中,最具有多样性的便是转录因改变这些转录因子的表达可以大大提高植物的抗性,说子。植物感受外界干旱、高盐、激素、病害及体内明转录水平调控是保护植物免受外界环境影响的一个重细胞发育等信号,通过一系列传递(钙含量变化、第二信要调控机制。在转录水平调控基因表达可以影响许多使、磷酸化和脱磷酸化等)激发转录因子(即反式作用因生命活动过程,不同的基因表达常常通过不同的转录因子),反式作用因子与顺式作用元件结合后,激活RNA聚子来控制,因此转录因子成为许多科学家研究的重点。合酶转录复合物,从而启动基因的转录表达,最后通过基植

5、物各类转录因子的作用主要与抗逆性和生长发育调控因产物的作用对外界信号在生理生化等方面作出适合的有关(MartinandPaz-Ares,1997;Chenetal.,2002;Singh调节反应(Chenetal.,2002;Singhetal.,2002;etal.,2002;ChenandZhu,2004;GuoandEcker,2004;Davulurietal.,2003;Matysetal.,2003;ChenandBroun,2004;Chenetal.,2005;Etheridgeetal.,2005;Zhu,2004;Broun,2004;Gray,2

6、005;Guoetal.,2005;Gray,2005;Kurataetal.,2005;Braam,2005;Kurataetal.,2005;Tsunoyama,2005;QuandZhu,Tsunoyama,2005;Maizel,2006;NardmannandWerr,2006;NardmannandWerr,2007;Balazadehetal.,2007;Tranetal.,2007;Balazadehetal.,2008)。从转2008)。转录因子与植物生长发育和形态建成、与植录层面上来说,同一种胁迫可能会同时激活多条途径(多个收稿日期:2008-11

7、-25;接受日期:2009-01-22基金项目:国家自然科学基金(No.90817006)†共同第一作者。*通讯作者。E-mail:zhensu@cau.edu.cn;guoaiguang@yahoo.com.cn郭华军等:拟南芥转录因子GRAS家族基因群响应渗透和干旱胁迫的初步探索291转录因子)。例如低温、干旱可以诱导拟南芥2007;Laajanenetal.,2007;Leeetal.,2008;Fodeet(Arabidopsisthaliana)的CBF1(Stockingeretal.,1997)al.,2008;Gallagherand

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