毛竹gras转录因子家族全基因组分析及pescr和pescl3的功能研究

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1、分类号S722.3密级公开UDC学位论文毛竹GRAS转录因子家族全基因组分析及PeSCR和PeSCL3的功能研究Genome-wideAnalysisofGRASFamilyandFunctionalAnalysisofPeSCRandPeSCL3fromPhyllostachysedulis董丽莉指导教师姓名高志民申请学位级别硕士专业名称林木遗传育种研究方向竹藤、花卉分子育种论文提交日期2015年5月论文答辩日期2015年6月学位授予日期2015年7月答辩委员会主席评阅人北京·中国林业科学研究院学位论

2、文毛竹GRAS转录因子家族全基因组分析及PeSCR和PeSCL3的功能研究学位论文作者董丽莉指导教师姓名高志民研究员申请学位级别硕士专业名称林木遗传育种研究方向竹藤、花卉分子育种论文答辩日期2015年6月18日中国·北京DissertationfortheDegreeGenome-wideAnalysisofGRASFamilyandFunctionalAnalysisofPeSCRandPeSCL3fromPhyllostachysedulisCandidate:DongLiliSupervisor:

3、ProfessorGaoZhiminAcademicDegreeAppliedfor:MasterSpeciality:ForestGeneticsandTreeBreedingDateofDefence:June,2015Degree-conferring-institution:ChineseAcademyofForestry独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，论文，除了文中特别加标注和致谢的地方外中不包含其他人已经发表或撰写过

4、的研究成果，也不包含为获得本研究生培养单位或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：１日期：王年６月王４日＾雨５学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解中国林业科学研究院有关保留、使用学位论文的规定，中国林业科学研究院有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权中国林业科学研究院可Ｗ将学位论文的、全部或部分内容编入有关数据库进行检

5、索，可采用影印缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名；等雨巧导师签名：丈０巧年６月２＊６日八（；与＾月文＾日学位论文作者毕业联系方式工作单位：联系电话：电子邮件：通讯地址、邮编：摘要GRAS转录因子是植物特有的一类转录因子，在植物发育和信号转导方面，如根发育、顶端分生组织维持、侧生分生组织发育、赤霉素信号传导以及光敏色素A信号传导等，均具有重要作用。竹类植物生长速度快，用途广，是最具潜力的绿色资源之一，

6、其生长发育倍受关注。本文以毛竹（Phyllostachysedulis）为研究对象，在对全基因组GRAS转录因子家族数量、基因结构、功能预测分析的基础上，对PeSCR和PeSCL3基因进行了深入研究，以期为揭示它们在毛竹生长发育中的功能奠定基础，为竹子的分子育种提供理论参考依据。主要研究结果如下：1.通过生物信息学方法，从毛竹基因组数据库中获得了59条基因序列预测编码GRAS转录因子，对基因结构、氨基酸组成、蛋白基序以及系统进化等进行了系统分析。结果表明，毛竹中的GRAS转录因子分别属于AtSCL4/7

7、（1个）、HAM（13个）、AtSCR（4个）、DLT（2个）、AtSCL3（4个）、DELLA（2个）、AtPAT1（13个）、AtSHR（4个）和LISCL（10个）九个亚家族，每个亚家族含有保守基序，意味着具有特异的功能。但是在现有的毛竹基因组中未发现AtLAS亚家族的成员。2.采用qPCR方法对基因的表达模式进行了检测，结果表明：除了PeGRAS-41和PeGRAS-55基因没有检测到外，其余57个基因的表达呈现不同的模式。相对于其他成员的表达量，HAM亚家族成员PeGRAS-10和PeGRAS

8、-12的表达丰度差异明显（p<0.01），而且在茎中表达量最高，推测其可能在毛竹茎发育过程中起重要作用。AtSCR亚家族成员PeGRAS15-18在根中表达最弱，说明AtSCR亚家族在毛竹中不仅参与根的发育，还可能参与其他组织的发育。AtPAT1亚家族PeGRAS-39只在茎和鞘中表达，而且鞘中的表达量远远高于茎，表明该基因可能在鞘的发育中发挥着重要作用。AtPAT1亚家族成员PeGRAS-43在叶中的表达量最高，这与AtPAT1调控光敏色