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时间:2019-05-10
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1、DepartmentofMicrobiologyFuquanHoo人类基因组概要OutlineofHumanGenome有科学史以来的过去几百年中,人们对于人类基因组的认识大多限于染色体和个别基因的认识。真正对于人类基因组有“整体序列水平”的认识是在人类基因组计划完成之后。因此,我们要讨论人类基因组就不得不先谈一谈“人类基因组计划”(HumanGenomeProject,HGP)1.什么是人类基因组计划?HGP是研究人类基因组(及相关的大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇及拟南芥基因组)的、宏大的跨国科研计划,它可与阿波罗计划媲美。HGP在20
2、世纪80年代中期提出,自1990年正式开始,计划用15年时间,耗资30亿美元,完成人类基因组的测序和基本注释,完成4套图谱:遗传图谱、物理图谱、序列图谱及基因图谱。一.人类基因组计划美国马萨诸塞州的Cambridge基因组研究中心的WhiteheadInstitute英国剑桥的SangerCenter美国密苏里的WashingtonUniversity美国加州的DOE联合基因组研究所美国得州的BaylorCollegeOfMedicine美国的一些其它单位中国、德国、法国、日本2.哪些国家和单位参加了HGP?3.谁的DNA被用来测序?
3、在构建文库实验室附近刊登了为HGP捐献DNA的广告,选择了不同人种的健康捐献者。采集样品经匿名处理:取样实验室撕去所有样品标记,记以随机号码,交样品处理室。样品处理室再撕去原标记并重新标记。最终使用的每一样品大约收集了5~10个样本。捐献者与DNA样品之间不再有任何联系,所以捐献者的身份是不被知道的。而Celera的测序样本来自5个人:分别属于西班牙裔、亚洲裔、非洲裔、美洲裔和高加索裔(2男3女),是从21个志愿者样本中挑选的。最后公布的序列图谱中还标记了140万个SNP位点,因此,它不是某一个确定人物的图谱,而是“人类”的图谱。4.
4、HGP的目标determinethesequencesofthe3billionchemicalbasepairsthatmakeuphumanDNA,identifyallthegenesinhumanDNA,storethisinformationindatabases,improvetoolsfordataanalysis,transferrelatedtechnologiestotheworldpublicaddresstheethical,legal,andsocialissues(ELSI)thatmayarisefrom
5、theproject.两个“人类基因组计划”前面提到的由多个国家合作进行的计划,称为“国际合作”计划。这个计划是由国家拨款资助,自1990年开始,轰轰烈烈干了整8年,做了大量艰苦、细致的工作,也使得测序方法得到相当的完善,大规模自动化测序仪已经出现,不用做遗传图和物理图的“鸟枪法测序”技术于1995年在流感嗜血杆菌中获得成功.1998年有一个私人公司Celera突然宣布,要用3年时间抢在“国际合作组织”之前完成人类基因组测序计划,并将人类基因专利注册。私人公司的介入,引入了竞争机制,迫使“公共合作组织”不得不加大投资、加快速度。结果两
6、个计划都在2001年完成了“草图”。TheHGPconsortiumpublisheditsworkingdraftinNature409(15February).CelerapublishesitsworkingdraftinScience(16February).“草图”(DraftGenomeSequence)意味着什么?“草图”还不是完成图,还有1000多个“缺口”,缺口主要集中在异染色质区域。目前,没有一个真核生物的基因组被测序到100%。有一些区域-通常是高度重复区域-用当今的技术很难或根本不可能被克隆或测序。但是,公布的
7、草图中,90%~93%常染色质区域(富含基因区)已经被测序。2003年,人类基因组计划完成它的“完成图”,98%以上的基因编码区已被测序,精度达99.99%,至此,人类基因组计划宣告它的完成。这一年,正值JamesWatsonandFrancisCrick发表DNA双螺旋结构50周年。人类基因组计划的完成为50周年庆典送了一份大礼!Nature和Science分别发表了专文,介绍了人类基因组计划在2001~2003这两年中又取得的进展及人类基因组学今后的发展方向。基因组的完成图1.BarbaraR.JasnyandLeslieRobe
8、rts:Introduction,ScienceApr112003:277。2.FrancisS.Collins,MichaelMorgan,AristidesPatrinos:TheHumanGenomeProject
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