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1、人类基因体计划7/15/20211人类基因体计划Thesequenceofthehumangenome人类基因体计划(续)7/15/20212人类基因体计划7/15/20213人类基因体计划人类基因体计划(HumanGenomeProject,HGP)1985年美国能源部（DOE）健康总署和环境部门提出1987年启动1988年9月美国国家卫生院（NIH）建立专门机构1988年Celera公司加入基因定序研究2001年2月宣布人类基因舆图完成→完成人类DNA中30亿个硷基的排序→辨识出人类DNA中30,000个基因→生物技术进入人类基因图谱后世代(Post-genomicera)7/1
2、5/20214人类基因体计划人类基因体计划(续)7/15/20215人类基因体计划人类基因体计划7/15/20216人类基因体计划已完成排序的大基因体1995-2002About35bacterialgenomes;细菌0.5-5Mb;hundredsto2000genes1996AprilYeast(Saccharomycescerevisiae)12Mb,5,500genes酵母1998Dec.-Worm(Caenorhabditiselegans)97Mb,19,000genes线虫2000March-Fly(Drosophilamelanogaster)137Mb,13,50
3、0genes果蝇2000Dec.-Mustard(Arabidopsisthaliana)125Mb,25,498genes阿拉伯芥2000JuneHuman(Homosapiens)1stroughdraft2001Feb15/16Human,“workingdraft＂人类3000Mb,35,000~40,000genes已完成排序的大基因体CBL@NCU7/15/20217人类基因体计划Sequencedeukaryoticgenomes7/15/20218人类基因体计划人类基因体的定序概况人类基因体计划在草图完成主要的突破人类遗传图谱的完成定序技术进步任意定序方式(shotg
4、un)EST的发展其他物种定序的完成最困难的部分异染色丝(Heterochromatin)重复性的序列(repetitivesequence)重复区段(duplicate)7/15/20219人类基因体计划霰弹枪法决定全基因体序列由上而下的策略需做基因库(library)与定序两种人才决定图谱(mapping)是的速率决定步骤霰弹枪法决定全基因体序列做完基因库后,只需定序人才增加定序仪,即可增加定序的速率单一步骤,可平行处理7/15/202110人类基因体计划具争议性的CraigVenter表现序列标帜(expressedsequencetag,EST)以霰弹枪法决定微生物的全基因体
5、序列以霰弹枪法决定果蝇与人的全基因体序列Picturetakenfromhttp://www.time.com/time/poy2000/mag/venter.html7/15/202111人类基因体计划人类基因体的基本特性人类基因体初估3200Mb，可找到30000多个基因基因的密度约为每12~15Mb出现一个基因在染色体富含G，C的地方，通常基因较多在3.2Gb的基因体中，2.95Gb为真染色丝(euchromatin)超过一半的基因体都是一些重复性的序列估计有1.4×106个SNP在染色体中节及末端附近有许多从染色体其他处甚至其他染色体复制来的区段(duplicate)基因大小
6、平均为30kb，差异很大7/15/202112人类基因体计划人类基因体的基本特性人类基因的复杂性高，不需以增加基因数量来进化蛋白质的复杂性较高一个基因产生多个蛋白质产物基因的调控方式较精致人类基因数量可能被低估人类基因的intron较长有些地方尚未定序完成－异染色丝区基因预测软件是根据已知的基因为基础预测序列中含有基因之可能性，对于一些完全未知的基因则无法侦测7/15/202113人类基因体计划人类基因体及基他已定序生物的比较负责基本生命现象的基因仍占多数人类在演化上并未增加太多新的domain人类在每个蛋白质家族中的数量较其他动物多7/15/202114人类基因体计划人类基因序列能
7、给我们什么信息人类基因体包含约三十一亿六千四百七十万个（3,164,700,00）核甘酸硷基（A,C,T,G）一般的基因平均含有三千个硷基，但其大小变异很大，最大的人类基因是dystrophin，含有二百四十万个硷基基因总数估计在30,000至35,000之间，这比以前估计的在80,000至140,000之间少，原因是以前是根据富含基因区域基因数推延所估计，相对于现在是基因富含区与基因贫乏区所组合而成所有的人类中，几乎是所有的（99.9%）的核甘酸硷基是完
