酵母功能诊断法FASAY在肿瘤P53基因突变检测中的应用

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1、复旦大学硕士学位论文酵母功能诊断法(FASAY)在肿瘤p53基因突变检测中的应用姓名:戈万忠申请学位级别:硕士专业:遗传学指导教师:霍克克20030528复旦大学硕士学位论文ABSTRACTThisthesisconsistsoftwoparts:1·Screeningthep53mutationsinhumantumorsbyusingtheyeastfunctionalassay(FASAY)Thedevelopmentofalifethreateningtumorisamultistepprocess,andthemutat

2、ionofp53tnnlorsuppressorgeneisidentifiedinalmosthalfofthehumantumors.Toscreenthep53mutationinhumantumors,weestablishedayeast-basedmethod,whichCOJ/assessthep53statusbythetranscriptionofADE2reportergeneinSaccharomycescerevisiae.Wedetectedthemutationofp53in1of19HCCsample

3、sand0of9braintumorsamplesbythismethod.Inaddition,Bysequencingthep53eDNA,wefindtwop53mutationsin157and249codonwhichbelongtothemutationhotspotinHCC,andthreeframshiflmutations(codon62,124,264)notreportedinHCC.Therelationshipsbetweenp53mutationandHCCCanhelpUStounderstandt

4、hediseasemechanism.Keywords:yeastfunctionalassay,HCC,p53mntaion2.ThepurificationofArp2/3complexinSaccharomycescerevisiaebytandemaffinitypurification(TAP)andMALDI-TOFThetandemaffinitypurification(TAP)methodisageneralprocedureofproteincomplexpurification,whichcanallowef

5、ficientandreliablerecoveryofproteinspresentatlowcellularlevelundernativeconditions.Withthedevelopmentoflnassspectrometry,ithasbecomeanimportantnewtoolforproteincomplexcharacterizationandproteomeexploration.First,wepurifiedtheArp2/3proteincomplexbythismethodinSaccharom

6、ycescerevisiae,secondlNweconstructedseveralyeaststrainsthatcontaintheTAPtag,thiswillhelpUStopurifytheseproteincomplexesinthefuture.Keywords:Tandemaffinitypurification(TAP),MALDI·TOEArp2/3complex2复日大学硕士学{奇:论文第一部分酵母功能诊断法(FASAY)在肿瘤p53基因突变检测中的应用前言1.P53基因结构和功能1979年,Lane和Le

7、vine等在SV40(猿猴病毒1转化的细胞中发现一种分子量约为53KDa,和SV40太T抗原共沉淀的一种蛋白,根据其分子量大小命名为p53蛋白‘1,“。最初认为P53基因是癌基因,是一个细胞周期中正的调控因子;但后来对它的遗传学上和功能上研究证明野生型p53基因是一个肿瘤抑制基因‘”。人类的p53基因是一段20kb的DNA,定位于17号染色体的短臀上17p13.1(4)。这个基因由11个外显子组成,第一个外显子不编码蛋白,定位于离外显子2和11有8—10kb远的地方。人类的P53蛋白由393个氨基酸组成,包括四个主要的结构域幔6'

8、7)。在N端是转录澈活结构域(1—42AA),中间部分是序列特异性的DNA结合结构域(102—292AA),C端区包括一个寡聚化结构域(323—356AA)和一个调控结构域(363—393AA),如图1-1。转录激活结构域N末端的42个氨基酸组成,

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