基于rna-seq技术的柴胡转录组分析

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1、分类可Ｑ７５６学号誦。９１Ｉ（ｙ山、巧裘葦大聲全日制硕±学位论文基于ＲＮＡ－Ｓ巧技术的柴胡转录组分析姓名：杜江指导教师：牛娜教授学科专业：生ｔｉ化学与分子生物学赛Ｖ培养单位；生命科学学院中国？山西？太谷二〇—五年六月ＳｈａｎｘｉＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＭａｓｔｅｒＤｅｒｅｅＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎｇＡｎａｌｙｓｉｓｏｎｔｈｅＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＢｕ－ｐｌｅｕｒｉＲａｄｉｘｔｈｒｏｕｈＲＮＡＳｅｇｑＪｉａｎＤｕｇＳｕｐｅｒｖｉｓｅｒ：Ｐｒｏｆ．Ｙａ

2、ｎｂｉｎＮｉｕｇＭａｏｒ：化ｏｃｈｅｍｉｓｔｒａｎｄＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｊｙｇｙＲｅｓｅａｒｃｈＦｉｅｌｄ：ＰｌａｎｔＢｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙａｎｄＭｏｌｅｃ山化巧ｏｌｏｇｙＴａｉｕＳｈａｎｘｉＣｈｉｎａｇＪｕｎｅ．２０１５学位论文原创性声明本人郑重声明：所提交的学位论文，是在导师指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文研究做出过重要贡献的个人和集体，均已在文中从明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承

3、担。／＾日作者签為（亲笔）：：杉年＾月２！学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学枚有关保留、使用学位论文的规定。即学位论文的知识产权属山西农业大学；同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的原件、复印件和电子版；允许论文被查阅和借阅；本人授权山西农业大学可＾乂将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可似采用影印、缩印或担描等复制手段保存、疋编学位论文。作者签違（亲装Ｖ７＾巧年月＾曰ＩＩ导师签遂（亲笔ｈ换冰＞｜Ｊ：年月么名曰＾目录ｍｓ１一第章文献综述２１２．柴胡概述１１．柴胡的地

4、理分布及生态环境２１．２化学成分２１．２．１皂昔类２１．２．２挥发油类２１２３．．黄丽类３１．２．４多糖类３１２５．．其他３１．３药理作用３１．、．３１抗病毒抗炎作用３１．．３２解热作用３１．３．３保肝作用３１．３．４抗肿瘤作用３１．４柴胡皂昔类成分的生物合成途径４２．高通量测序技术研究进展５一２．１第代测序技术５２丄１化学降解法５２丄２ＤＮＡ链末端合成终止法５２．２第二代测序技术６２．２．１４５４测序技术６２．２．２ＳＯＬｉＤ巧７！１序技术２．

5、２．３Ｓｏｌｅｘａ测Ｉ序法８Ｈ代测９２．３第序技术２．３．１并行单分子合成测序技术１０２．３．２单分子即时合成测序技术１０２．３．３纳米孔单分子技术１１２．３．４基于ＦＲＥＴ的测序技术１１２．３．５半导体测序技术１１２．４髙通量测序技术的应用１４２．４．１全基因组从头测序１４２．４．２全基因组的重测序１４ｓ２．４．３小ＲＮＡ测序１４２．４．４降解组测序１４２．４．５染色质免疫共沉淀测序１４２４６．．基因组ＤＮＡ甲基化分析１４２．４．７转录组测序１４３．转录组测序１５３．

6、１１５转录组概念３．２转录组研究方法１５３２１ＤＮＡｍｉｃ．．基因巧片技术（ｒｏａｒｒａｙ）１５３．２．２表达序列标签技术（ＥｘｐｒｅｓｓＳｅｑｕｅｎｃｅＴａｇｓ，ＥＳＴ）１５３ｉ．２．３基因表法系歹ｊ的分析技术（ＳｅｒｉａｌａｎａｌｓｉｓｏｆｅｎｅｅｘｒｅｓｓｉｏｎＳＡＧＥ）１５ｙ，ｇｐ３．２．４大规模平行的额！１序技术（Ｍａｓｓｉｖｅｌｙａｒａｌｌｅｌｓｉｎａｔｕｒｅｓｅｕｅｎｃｉｎ，ＭＰＳＳ）＂１５ｐｇｑｇ－３．２．５ＲＮＡ测ｓｅｕｅｎｃＲＮＡ序技术（ＲＮＡｑｉｎｇ，Ｓｅｑ）１５３

7、－．２．５．１ＲＮＡＳｅｑ原理及基本步骤１５３－．２．５．２ＲＮＡＳｅｑ技术优势１６４．研究目的和意义１７５．拟进行的技术路线１８第二章试验材料与方法１９１．试验材料１９１．１试验材料１９１．２主要试验试剂及试验仪器１９２．试验方法１９２．１柴胡总ＲＮＡ提取方法１９２２总ＲＮＡ样２０．品检测２．３ＣＤＮＡ文库的制备２０３．柴胡转录组数据处理２０３．１数据过滤２０３．２序列拼接２０４．柴胡转录组数据分析２０４１ｓ了．