lncrna在前列腺增生性炎性萎缩向前列腺癌恶性转化过程中差异表达的初步研究

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1、分类号：密级：UDC：学号：416523212194南昌大学硕士研究生学位论文LncRNA在前列腺增生性炎性萎缩向前列腺癌恶性转化过程中差异表达的初步研究DifferentiallyExpressionofLongnon-codingRNAsintheMalignantTransformationfromProliferativeInflammatoryAtrophytoProstateCarcinoma:AnPreliminaryStudy郝超培养单位（院、系）：南昌大学第一附属医院指导教师姓名、职称：王共先教授申

2、请学位的学科门类：医学学科专业名称：外科学（泌尿外）论文答辩日期：2015年6月答辩委员会主席：评阅人：2015年6月学位论文独创性声明一、学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得南昌大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名（手写）：签字日期：年月日二、学位论文版

3、权使用授权书本学位论文作者完全了解南昌大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权南昌大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编本学位论文。同时授权北京万方数据股份有限公司和中国学术期刊（光盘版）电子杂志社将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》和《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》中全文发表，并通过网络向社会公众提供信息服务，同意按“章程”规定享受相关权益。学位论文作者

4、签名（手写）：导师签名（手写）：签字日期：年月日签字日期：年月日论文题目姓名学号论文级别博士□硕士□院/系/所专业E_mail备注：□公开□保密（向校学位办申请获批准为“保密”，年月后公开）I摘要摘要目的：利用微阵列基因芯片技术检测前列腺癌（PCa）、前列腺增生性炎性萎缩（PIA）和癌旁非癌组织中差异表达的mRNA和lncRNA。观察前列腺恶性转化过程中基因表达的动态变化，进而发现可能存在的前列腺非可控性炎症至恶性癌变过程中的特征分子网络，为PIA→PCa发病模式提供分子层面的新证据，以期为临床前列腺癌的预防、诊疗，

5、以及发病机制提供新理论及新方案。方法：收集2013年8月至2014年8月我院前列腺切除术后临床组织标本共20例，通过改进标本获取方式，运输途径，破碎方法三方面因素，建立从离体组织标本提取高质量总RNA的方法。随后在此方法基础上，通过冰冻切片结合手工显微切割技术在同一前列腺组织标本中分离出PCa、PIA及癌旁非癌组织各区域的纯净细胞群。采用lncRNA+mRNA表达谱芯片分析三者间的基因表达差异（生物学重复3次），通过生物信息学的方法筛选出具有显著表达差异的mRNA和lncRNA，并对结果进行Pathway分析等初步的

6、生物信息学分析，反向Cis-预测lncRNA的靶基因，在发生显著变化的炎症和/或癌症通路上建立lncRNA与靶基因的基因网络图。结果：1.前列腺癌根治术后获取的离体组织标本，在30min内放入液氮冻存，经液氮研磨或冰冻切片均可以提取到高质量的总RNA（RIN>7.5）。2.手工显微切割获取的组织，可通过Trizol法提取到满足高通量微阵列技术要求的高质量RNA，但H&E染色会降低RNA的完整性。3.基因表达谱芯片的结果显示：人前列腺癌组织与癌旁非癌组织对照相比，有2610个mRNA表达有差异，其中上调689个，下调1

7、921个；同时有2176个lncRNA表达有差异，其中上调688个，下调1488个。人前列腺增生性炎性萎缩组织与癌旁非癌组织相比，有592个mRNA表达有差异，其中上调183个，下调409个；同时有575个lncRNA表达有差异，其中上调160个，下调415个。人前列腺癌组织与前列腺增生性炎性萎缩组织相比，有1007个mRNA表达有差异，其中上调115个，下调892个；有773个lncRNA表达有差异，其中上调II摘要105个，下调668个。在3种组织类型的共同比较中，有113个mRNA的表达存在显著线性差异，其中上

8、调8个，下调105个；有106个lncRNA的表达也存在显著线性差异，其中上调11个，下调95个。4.Pathway分析显示，差异基因显著富集在了22条信号通路上，其中有9条通路与炎症和/或癌症密切相关，这些通路在疾病的进展中发生了显著的变化。结论：1.冰冻切片并H&E染色结合“排除法”手工显微切割技术，可经济、有效地鉴定分离出目的细胞亚群，且