根结线虫土壤微生物多样性研究

《根结线虫土壤微生物多样性研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号密级公开编号碎士研究噠嗲傈儉式题目根结线虫土壤微生物多样性研究学院所、中心）一省部共建国家重点实验室培育基地专业名称微生物学研宄生姓名张俊学号导师姓名刘亚君职称副研究员年月M.S.DISSERTATIONMicrobialdiversityofsoilinfectedbyMeloidogynespp.ByJun-zhangDirectedbyAssoc.Prof.LiuYa-junYunnanUniversity,Kunming,P.R.China资助项目论文独创性声明及使用授权本论文是作者在导师指导下取得的研究成果。除了文中

2、特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，不存在剽窃或抄袭行为。与作者一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。现就论文的使用对云南大学授权如下：学校有权保留本论文（含电子版），也可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文；学校有权公布论文的全部或部分内容，可以将论文用于查阅或借阅服务；学校有权向有关机构送交学位论文用于学术规范审査、社会监督或评奖学校有权将学位论文的全部或部分内容录入有关数据库用于检索服务。内部或保密的论文在解密后应遵循此规定）云南大学硕士学位论文摘要

3、根结线虫是一类植物寄生性线虫，会引起植物根形成根结，并更容易让植物感染其他病害，造成我国农业损失惨重。而根结线虫病的发生与作物根际微生物有密不可分的关系。本文以根结线虫病害土壤为研宄对象，用高通量测序方法研宄根结线虫不同病害程度土壤的微生物群落结构和动态演变规律，挖掘不同时间、地点的优势菌群，为探索预防根结线虫危害作物新策略提供理论基础。结果如下：、比较分析根结线虫病害土壤的细菌群落结构。主要优势细菌门主要有变形菌门、绿弯菌门、泉古菌门、放线菌门。主要优势细菌科有、、、、、。主要优势细菌属有、、、。与元谋其他土壤相比，元谋病重土壤中

4、变形菌门、放线菌门所占比例增加，泉古菌门、、、和所占比例降低。根结线虫的种群密度影响了土壤细菌种类，健康土壤比患病土壤含有更多的细菌种类，病重土壤比病轻土壤含有更丰富的细菌种类。随着根结线虫的种群密度变化，有较大变化的细菌种类是变形菌门、放线菌门、、、、。、比较分析了根结线虫病害土壤不同时段细菌群落结构。玉溪土壤的优势细菌门有变形菌门、泉古菌门、放线菌门、绿弯菌门。优势细菌科有、、、、、。优势细菌属有、、、、。随着时间变化，根结线虫种群密度降低，细菌种类更丰富，泉古菌门、、所占比例降低，而绿弯菌门增加。根结线虫数目的变化程度影响着细

5、菌种类和所占比例。、比较分析根结线虫病害土壤的真菌群落结构。优势真菌门主要有子囊菌门、云南大学硕士学位论文接合菌门、担子菌门。优势真菌科有、、、。优势真菌属有、、、、。随着根结线虫种群密度增加，真菌种类更加丰富，子囊菌门、、、和柳印伙此冊？所占比例增加。在根结线虫数目较少的土壤中、和所占比例较大。、通过分离纯化培养，我们得到株细菌、株放线菌和株真菌。对得到的细菌、放线菌和真菌测定根结线虫校正致死率。分别挑选出每份土壤中校正致死率较高的株细菌，株放线菌和株真菌，提取，扩增，送到华大基因测序，测序后进行比对。共鉴定了株真菌、株放线菌和株

6、细菌。真菌属于子囊菌门下的曲霉属和木霉属。放线菌属于链霉菌属。两株细菌属于变形菌门下旳不动杆菌属。其他的细菌属于厚壁菌门下的芽孢杆菌属。本论文的创新点有：运用宏基因组学技术，比较研究了随时间变化，根结线虫患病土壤的细菌群落结构的变化。运用宏基因组学技术，比较研究了根结线虫患病土壤和健康土壤的真菌群落结构的异同点。关键词：根结线虫；根际细菌；真菌；宏基因组学；种群多样性变化云南大学硕士学位论文，，，，，，云南大学硕士学位论文，一，，，，云南大学硕士学位论文目录第一章微生物群落结构和多样性研宄进展宏基因组宏基因组学的提出宏基因组学的缺点

7、研究微生物群落结构和多样性的方法限制性片段长度多态性分析法变性梯度凝胶电泳高通量测序宏基因组学的应用发现生物催化剂发现亲斤基因在医学方面的应用发现有价值的化合物‘：研究微生物群落结构和多样性本研究的目的和意义第二章不同土壤样品文库的构建测序及基本数据分析实验材料实验器材与主要试剂实验器材主要生化试剂主要分子生物学试剂与试剂盒实验步骤与方法提取土壤总琼脂糖凝胶电泳检测区的扩增云南大学硕士学位论文产物的回收纯化测序质控报告数据拆分拼接截取长度过滤去嵌合体序歹丨实验结果提取质量检测弥勒和元谋样品基本数据结果质控报告图谱宏基因组测序原始数据

8、信息测序的原始数据信息数据质量信息玉溪样品基本数据结果质控报告图谱宏基因组测序原始数据信息测序的原始数据信息数据质量信息元谋样品基本数据结果质控报告图谱宏基因组测序原始数据信息测序的原始数据信肩数据质量信息第三章细菌种群多样性比较分析