土壤微生物多样性研究方法

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1、应用生态学报2004年5月第15卷第5期CHINESEJOURNALOFAPPLIEDECOLOGY，May2(XM，15(5):899〜904土壤微生物多样性研究方法W家杰出年基金资助项111(40125004).3通讯联系人.2002-02-20收箱,2003-07-15接受.I.2331钟文辉蔡祖聪C1屮国科学院南杂土壤研究所，南M21(X)08;2南京师范大学化学与环境科学学院，南*210097)【摘要】概述了研究土壤微虫物多样性的主耍方法.传统上，土壤微虫物群落的分析依赖于培养技术，使用各种培养基最人限度地培养各种微生物群体，们仍只能培养和分

2、离出一小部分土壤微生物群落.使用Biolog分析、磷脂脂肪酸分析和核酸分析等方法，可研究和衣征那些现办:还不能够被培养的土壤微生物，从而获取关于土壤微生物群落多样性的史多和史完整的倍息.关键词土壤微生物多样性Biolog磷脂脂肪酸核酸分析文章编号1001-9332(2004)05-0899-06中图分类号S15413文献标识码A1211Methodsforstudyingsoilmicrobialdiversity.ZHONGWcnhui，CAIZucong(InstituteofSoilScience，Chi22neseAcademyofScienc

3、e,Nanjing210008,Cliina;CollegeofChemistryandEnvironmeritalScience,NanjingNormalUniversify，Nanjing210097,China).2Chin.J.Appl.Ecol.,2004,15(5):899〜904•Thispapergaveareviewonthemainmethodsforstudyingsoilmicrobialdiversity.Traditionally，theanalysisofsoilmicrobialcommunitiesreliedonc

4、ulturingtechniques，usingavarietyofculturcmedia.However，onlyasmallfractionofthesoilmicrobialcommunityhasbeenculturedandisolatedwiththisapproach.OthermethodssuchasBiologGNanalysis,phospholipidsfattyacidsanalysisandnucleicacid2basedanalysiscanbeusedtostudyandcharacterizesoilmicrobe

5、swhichcurrentlycannotbecultured，andtogetmoreandcompleteinformationaboutsoilmicrobialcommunity.KeywordsSoil，Microbialdiversity，Biolog，FLFA，Nucleicacid2bascdanalysis.1引言生物多样性包括物种多样性、遗传(基因)多样性和生态系统多样性.土壤微牛物多样性钮括在柄息地中微牛物分类群的多样性和也微生物分类群内的遗传多样性，以及包括群落结构的变异性、相互作用的复杂性、营养水平(tropiclevel)和

6、共位群(guild)数跫(功能多样性)在rt的生态多样性.其中遗传多样性讨认为记遗传信息在微生物聚集地或群落屮的和分布，反映微虫物群落屮总的遗传潜力.功能多样性则是指发生在一个群落屮的碳源利用校式或作用过程数1331.土壤微虫物多样性的研究方法人体上可分为W类:一类足用于分析土壤中可培养的微生物群落;另一类足用丁"分析土壤的整个微生物群落.第一类分析方法基于微生物分离菌(isolates)的形态判别、微物分离傳在BiologGN微滴定板巾的反应和微牛.物分离闲的脂肪酸屮酯撒FAMEprofiles)等.后一类分析方法不需要培养微牛.物，毡括群落水平的生

7、理特性(CLPP)分析(如在BiologGN微滴定板屮的反脚分析)、磷脂脂肪酸(phospholipidfattyacids,PLFA)方法和核酸分析(nucleicacid2basedanalysis)方法等.2琼脂培养基培养方法这足用于估计微生物多样性的传统A法.琼脂培养基培养方法足在琼脂培养基平板上接种培养，可作以下用途：跟踪蚱宙分枣Qrnnnl成劝能州的微牛物粉话.你评价亦祕平板上的微生物群落的组成.在活一种惜况下，需从琼脂平板上将谢落分离出来，丼对分离谢进行鉴记.由所得到的分类组或分类群的分布情况可了解群落的结构.培养葆的成份影响微生物的生长

8、状况，故培养基的选择讨强烈影响所得谢落的多样性［34,641•菌落形成申.位(CFU)的数吊: