受根结线虫侵染的烟草根际细菌群落特征及南方根结线虫伴生细菌多样性研究

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1、傳士蚵究摩依铪夂题目丨特征及南方根结线虫伴：■学院（所、中心）研究生姓名曹毅学号————■—”、：‘■、：‘：：；—￠“■：■■；：■：■■；‘“⋯“：通■：■；；：化‘‘—啊⋯‘⋯‘‘“‘：；、；，一：一、：一；■■■■：■‘：、，：？‘？；―；■：；■■广；■’■论文独创性声明及使用授权本论文是作者在导师指导下取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研宄成果，不存在剽窃或抄袭行为。与作者一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说

2、明并表示了谢意。现就论文的使用对云南大学授权如下：学校有权保留本论文（含电子版），也可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文；学校有权公布论文的全部或部分内容，可以将论文用于查阅或借阅服务；学校有权向有关机构送交学位论文用于学术规范审查、社会监督或评奖；学校有权将学位论文的全部或部分内容录入有关数据库用于检索服务。内部或保密的论文在解密后应遵循此规定）研究生签名：导师签名期摘要摘要根结线虫（—是世界范围内最具危害的植物病原，可侵染如粮食、烟草、蔬菜、水果等几乎所有栽培作物，是当前农作物可持续生产的

3、主要限制因子之一。根结线虫在根际环境中完成其主要生活史和侵染循环，处于同一生态位的根结线虫、根际微生物和楦物存在紧密的互作关系。本论文揭示了自然条件下感染根结线虫和健康烟草根际细菌的多样性、构成特征及其主要环境影响因子。此外，还对南方根结线虫不同生活史阶段伴生细菌的组成和多样性进行研究，主要结果如下：大尺度地理生境下烟草根际细菌群落结构、多样性和优势菌群从我国个省市个植烟区采集份根际土壤样品（其中感染根结线虫的烟草根际土壤份，健康根际土壤份，其他植物根际土壤份），采用罗氏测序平台对根际土壤细菌的—

4、区扩增子进行高通量测序，对获得的条序列进行数据处理和分析，比较了不同地区烟草根际细菌菌群结构、组成和多样性，分析了烟草根际土壤优势菌群。结果表明：（烟草根际菌群主要由细菌域的变形菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门，候选门、等个门和分类地位未知的细菌组成，其中以酸杆菌门、变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门和候选门为主。不同地理来源的烟草根际土壤样品细菌组成种类及数量类似，但相对丰度差异较大。（不同地区烟草根际细菌多样性（多样性）差异明显，同一地区样本间菌群组成较相似（多样性）。（、、、

5、等个属的细菌类群构成了烟草根际微生物的优势种群（相对丰度〉。环境和土壤理化性质的相互作用决定了烟草根际细菌群落对不同地理来源，土壤、有机质、主要矿物元素等个理化因子与根际土壤细菌菌群的相关性分析发现：（不同地理来源样品的根际土壤细菌菌群组成差异明显，且根际土壤菌群的聚类与地理来源有较好的相关性。（土壤与地理来源、细菌组成具有相关性；其他理化因子与地理来源、细菌组成无明显相关性。结果表明，环境因子，如地理格局和土壤值等可能通过相互作用决定了烟草根际细菌在空间尺度上的构成，而相互作用取决于环境的不同。

6、摘要根结线虫侵染对烟草根际细菌菌群的影响通过比较感染根结线虫和健康烟草根际细菌的组成和多样性，发现患病和健康烟草根际细菌菌群间的多样性、多样性和根际优势菌群的分布存在一定差异，表明线虫侵染在一定程度上影响了寄主植物根际细菌菌群。进一步对患病和健康根际菌群共存模式（—进行分析，发现感染根结线虫和健康烟草根际细菌中显著关联共存菌群的种类和数量明显不同。在健康烟草根际土壤细菌中有分属于个门的个细菌类群共存，共存的菌群主要分布于个类群）、个类群）、个类群）和个类群；在感染根结线虫的烟草根际土壤中有分属于个

7、门的个细菌类群共存，共存类群在增加为个，和分别减少个和个，同时个类群）、个类群）和个类群）只在患病烟草根际土壤共存。利用不同统计检验方法对患病和健康根际细菌菌群的比较分析发现，、与根结线虫患病显著相关。对根结线虫侵染和土壤理化因子的相关性分析显示，单一土壤理化因子与是否感染根结线虫没有相关性。进一步以样品是否感染根结线虫为响应变量，地域为随机效应，各项理化指标为固定效应，构建广义线性混合模型评估土壤理化因子和是否感染根结线虫的关系，结果显示当用大量营养元素（、、和有机质）和作固定效应时，钾的含量与

8、是否感染根结线虫具有显著负相关；当用微量营养元素（，，，做固定效应时，铜和锰含量与是否感染根结线虫具有显著负相关。当用有机营养元素和无机营养元素做固定效应时，钾的含量与是否感染根结线虫具有显著负相关。上述结果表明，以土壤钾含量为主的土壤理化因子和生物因素的交互作用影响了烟草根结线虫病的发生。不同生活史阶段南方根结线虫伴生细菌多样性利用高通量测序技术对不同生活史阶段（卵块、雌虫和二龄幼虫）南方根结线虫的伴生菌多样性进行研究，结果表明变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和拟杆菌门细菌为南方根结