松辽黑猪nr6a1和vrtn基因多态性与肋骨数的关联分析

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1、分类号：S828单位代码：10193密级：公开学号：2012577硕士学位论文松辽黑猪NR6A1和VRTN基因多态性与肋骨数的关联分析TheassociationofpolymorphismsofNR6A1geneandVRTNgenewiththenumberofribinSongliaoBlackSwine作者姓名：张文克学位类别：农学硕士专业名称：动物遗传育种与繁殖研究方向：数量遗传与动物育种指导教师：张树敏研究员所在学院：动物科学技术学院2015年3月独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是本人在导师指导下，独立进行研究所取得的成果。尽我所

2、知，除文中特别加以标注和致谢所列内容外，论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得吉林农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文所有内容若有不实之处，本人愿意承担一切相关法律责任和后果。学位论文作者签名：签字日期：年月日关于学位论文使用授权的声明1、本人完全了解吉林农业大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生在校攻读学位期间所完成的论文及相关成果的知识产权属吉林农业大学所有，并同意将本论文的版权授权给吉林农业大学，学校有权保

3、留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。2、本人（同意/不同意，务必打印后填写）吉林农业大学将本论文版权授权给不同媒体进行电子出版、多媒体出版、网络出版以及其他形式出版（涉密学位论文解密后应遵守此协议）。3、本人声明毕业后若发表在攻读研究生学位期间完成的论文及相关的学术成果，必须以吉林农业大学作为第一署名单位。学位论文作者签名：签字日期：年月日指导教师签名：签字日期：年月日摘要在生产过程中发现松辽黑猪群体中的不同个体之间存在肋骨数量的差异。结合松辽黑猪的选育历史，为了解析松辽黑猪群体中肋骨

4、数的差异，本研究以松辽黑猪为试验对象群体，选用杜长大三元杂交猪为试验对照群体，分别采集了173头松辽黑猪和283头杜长大三元杂交猪的背最长肌组织样本为试验材料，提取基因组DNA，并且按采样顺序记录了肋骨数表型值。分别选取与脊椎数量显著相关的NR6A1和VRTN为候选基因，运用PCR-RFLP和基因分型技术，筛选候选基因的多态位点，并进一步与肋骨对数表型值进行相关分析，以期为松辽黑猪在品种内选育和提高多肋品系提供比较理想的分子标记和理论依据。本研究取得结果如下：NR6A1基因的相关研究区域在杜长大三元杂交群体中不存在基因多态性，但在松辽黑猪群体中存在基

5、因多态性，在目的片段184bp处存在A>G突变；VRTN基因的相关研究区域在杜长大三元杂交群体和松辽黑猪群中存在基因多态性，在目的片段112bp处存在一个大约289bp的插入突变；验证了NR6A1基因目的片段的NciI酶切位点在杜长大三元杂交群体内存在选择清除效应，NR6A1基因目的片段的NciI酶切位点在松辽黑猪群体内存在AA、AG、GG三个基因型，且该酶切位点在松辽黑猪群体内处于Hardy-Weinberg平衡状态，遗传多态性处于中度多态；VRTN基因目的片段的ins/ins、ins/-和-/-三种基因型在杜长大三元杂交群体和松辽黑猪群体内均存在

6、，该插入突变位点在杜长大三元杂交群体和松辽黑猪群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态，遗传多态性处于中度多态；NR6A1基因的184A>G位点松辽黑猪个体的肋骨数表型变异现象不存在关联性，VRTN基因112bp位点的插入突变与杜长大三元杂交猪和松辽黑猪的肋骨数表型变异现象存在一定的关联性，因此该插入突变位点很有可能成为松辽黑猪在品种内选育和提高多肋品系的理想分子标记。关键词：松辽黑猪，NR6A1基因，VRTN基因，多态性，肋骨数IAbstractIntheproductionprocess,foundthattherearedifferenc

7、esinthenumberofribofdifferentindividualinthegroupsofSongliaoBlackSwine.CombinedwiththebreedinghistoryofSongliaoBlackSwine,inordertoanalysisthatthedifferenceofribnumbersinthegroupsofSongliaoBlackSwine,thisresearchtakestheSongliaoBlackSwineastheexperimentalobjectgroupsandthehybri

8、dizationpigofLandrace-Yorkshire-Durocastheexperimental