水茄(solanum torvum)stubcc基因的克隆及功能初步分析

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1、密级:论文编号:中囯农亚科学院学位论文水煎如/tw/w)基因的克隆及功能初步分析TheCloningandInitialFunctionAnalysisofStUBCcgeneinSolanumtorvum硕士研宄生:刘炎霖指导教师:连勇研宄员申请学位类别:农学硕士专业:蔬菜学研究方向:蔬菜遗传育种培养单位:蔬菜花卉研宄所研宄生院2015年5月密级:论文编号:中国农业科学院学位论文水茄(Solanumtorvum)StUBCc基因的克隆及功能初步分析TheCloningandInitialFunctionAnalysisofStUBCcgeneinSo

2、lanumtorvum硕士研究生:刘炎霖指导教师:连勇研究员申请学位类别:农学硕士专业:蔬菜学研究方向:蔬菜遗传育种培养单位:蔬菜花卉研究所研究生院2015年5月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationTheCloningandInitialFunctionAnalysisofStUBCcgeneinSolanumtorvumM.S.Candidate:LiuYanlinSupervisor:ProfessorLianYongMajor:VegetableScienceSpe

3、cialty:VegetableGeneticsandbreedingMay2015独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研宄工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研宄成果,也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:t时间:年f月y曰关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定,g卩:中国农业科学院有权保留送交论文的复印

4、件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研宄生签名:q时间:■年圹月s日导师签名:时间:年t月曰中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目水茄(So/anwmtonwn)及C/BCc基因的克隆及功能初步分析论文作者刘炎霖专业蔬菜学研究方向蔬菜遗传育种指导教师连勇培养单位(研究所)蔬菜花卉研究所硕(博)姓名职称单位专业签名导师评硕导口博导口人硕导口I答辩主席博导口硕导口中国农业大学农学与张振贤教授蔬菜学博导口生物技

5、术学院硕导口中国农业大学农学与张振贤教授蔬菜学博导口生物技术学院硕导口耿三省研究员北京市农林科学院蔬菜学博导口答硕导口中国农业科学院蔬菜张宝玺研究员蔬菜学博导口花卉研究所辩硕导口中国农业科学院蔬菜王孝宣研究员蔬菜学博导口花卉研究所緣委硕导口中国农业科学院蔬菜李颖副研究员生物信息学博导口花卉研究所员硕导口博导口硕导口博导口会议记录(秘书)张映论文答辩时间地点2015年5月25日,蔬菜花卉研究所东小楼茄科314会议室摘要茄子黄萎病是危害茄子的主要土传病害之一,它会引起茄子减产造成重大经济损失。栽培种茄子材料中没有有效的抗黄萎病茄子资源,高抗材料均为野生种。

6、茄子近缘野生种水茄(Solanumtorvum)具有较强的抗黄萎病能力,几乎接近免疫的程度,从水茄中克隆与黄萎病抗性相关的基因,对改善茄子抗病性具有重要价值。本研究以课题组前期构建的黄萎病菌侵染下水茄的抑制差减文库(SSH)为基础,对其中的159条差异序列重新进行序列比对,挑取可能与抗病相关的序列进行差异表达验证及表达模式分析。利用RACE技术克隆可能与抗病相关的候选ESTs的基因全长,并利用VIGS方法对克隆得到的全长基因进行功能初步分析。主要研究结果如下:1.利用qRT-PCR方法分析从SSH-cDNA文库中挑取的12条可能与抗病相关的泛素(4条)

7、、激素(4条)和抗病蛋白(4条)的ESTs序列,验证其在黄萎病菌侵染下不同时间点的差异表达性,分析表达模式。结果表明,12条ESTs在黄萎病菌侵染下的表达量与对照相比不同。在侵染2h内,每条EST在黄萎病菌处理的相对表达量与对照相差不大;侵染4h后,表达量都高于对照,上调表达。2.采用RACE技术克隆获得了水茄StUBCc基因全长序列,对其进行功能初步分析。序列分析显示StUBCc基因全长756bp,开放阅读框为459bp,编码152个氨基酸,具有UBCc基因家族结构域。同源性分析发现StUBCc基因与葡萄的泛素结合酶E2-2(UBC2)的同源性最高,

8、达99%。系统进化树结果显示水茄中该基因编码的蛋白与葡萄聚在同一分支,亲缘关系最近,其次为拟南

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