野生茄子(solanum torvum)抗黄萎病相关基因stove1的克隆与分析

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1、638植物生理学通讯第42卷第4期,2006年8月野生茄子(Solanumtorvum)抗黄萎病相关基因StoVe1的克隆与分析1,*1,*11221,**史仁玖殷 王忠陈敏黄权生黄乐平杨清12南京农业大学生命科学学院,南京210095;新疆农业科学院核生物技术研究所,乌鲁木齐830000提要采用RT-PCR和RACE技术从野生茄子中扩增克隆到一个抗黄萎病相关基因,命名为StoVe1,其cDNA全长3400bp,含有3153bp的完整开放阅读框,编码1051个氨基酸,该基因编码的蛋白序列与刚果野茄、类番茄和番茄Ve1编码的氨基酸序列同源性分别为82%、81%和80%,且有很

2、高的功能区段保守性。将该cDNA全长序列提交GenBank,登陆号为DQ020574。半定量PCR表明该基因为组成型表达,在根中表达最多,叶中最少。关键词野生茄子;StoVe1基因;克隆;表达CloningandAnalysisofFull-lengthcDNAofStoVe1GenefromSolanumtorvum1,*1,*11221,**SHIRen-Jiu,YINYue,WANGZhong,CHENMin,HUANGQuan-Sheng,HUANGLe-Ping,YANGQing12CollegeofLifeSciences,NanjingAgricultural

3、University,Nanjing210095,China;InstituteofNuclearBiotechnology,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,Urumqi830000,ChinaAbstractThefull-lengthcDNAofageneassociatedwithverticilliumwiltdiseaseresistance,namedStoVe1,wasamplifiedandclonedfromJapaneseSolanumtorvumbyRT-PCRandRACE.ThecDNAcontained

4、3400bpwithanopenreadingframe(ORF)of3153bpandencoded1053aminoacidresidues.Thededucedaminoacidsequenceshowed82%homologytoSaVe1fromSolanumaethiopicum,81%homologytoSlVe1fromSolanumlycopersicoidesand80%homologytoVe1fromLycopersiconperuvianumandalsohighlyconserveddomainsoffunction.Thisgenehasbee

5、nregisteredinGenBankwithaccessionnumberDQ020574.Semi-quantitiveRT-PCRanalysisindicatedthatStoVe1expressionwasdifferentinroots,stemsandleaves,andricherinroots,poorinleaves.KeywordsSolanumtorvum;StoVe1gene;cloning;expression黄萎病(verticilliumwilt)是一种由大丽轮枝菌torvum)来自日本,对黄萎病具有极强的抗性。试(Verticillium

6、dahliae)和黑白轮枝菌(Verticillium验根据番茄Ve1、刚果野茄(Solanumaethiopicum)albo-atrum)引起的植物维管束病害,在世界各地SaVe1的cDNA全长序列比对结果设计引物,通引起许多重要经济作物如陆地棉(Gossypium过RT-PCR及5'、3'-RACE扩增得到了野生茄子抗hirsutum)、茄子(Solanummelongena)、番茄黄萎病基因的cDNA序列,并对该基因进行了组(Lycopersiconesculentum)、马铃薯(Solanum织表达分析。tuherosum)、甘蓝(Brassicaoleracea

7、)、油菜材料与方法(Brassicanapus)、白菜(Brassicachinensis)、辣椒(Capsicumfrutescens)等黄萎病(张启刚等1998),野生茄子(Solanumtorvum)由我校园艺学院朱严重影响了这些作物的产量与产品品质,全球每月林先生提供。植株栽种于温室中,于旺盛生长年因黄萎病危害所造成的经济损失高达10亿多美期取幼嫩侧枝茎段用作离体培养,以再生组培苗元,克隆抗黄萎病基因并将之应用于育种可能是为试验材料。解决上述问题的有效途径。总RNA的提取按照北京天为时代公司目前,有关茄科植

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