生物代谢网络的混合petri网建模与分析

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1、Ｉ＇，■＊－Ｔ？天津科技大学研究生学位论文申请硕±学位）（生物代谢网络的纔合Ｐｅｔｒｉ网建模与分析ＭＯＤＥＬＩＮＧＡＮＤＡＮＡＬＹＺＩＮＧＯＦＴＨＥＢＩＯＬＯＧＩＣＡＬＭＥＴＡＢＯＬＩＣＮＥＴＷＯＲＫＢＡＳＥＤＯＮＨＹＢＲＩＤＰＥＴＲＩＮＥＴ■■，：，—－？？ｆ．．．．．■？■，？？？Ｖ－、ｖ；＇＇■．Ｖ－－．ｈ■．？、，＇－？■ｒＶ？？，；．’＇’＇＿：．．－＇．＇乂＇：；；一＇中心；专业名称：计算机应用技术

2、指导教师：李孝忠教授是別．．＇＾研究生姓名；王龙．＾读：申请学位级别：工学硕±沪．二Ｖ巧Ｖ论文提交％如＇日期：２０１５年１２月：’－－Ｖ＇，．Ｖ；，．／＇节這‘一．．＇‘心Ｖ．？－．．．．．心．．‘：分类号：ＴＰ３９１学校代码：１００５７密级：研究生学号：１３８３４００５生物代谢网络的混合Ｐｅｔｒｉ网建模与分析ＭｏｄｅｌｉｎａｎｄＡｎａｌｚｉｎｇｆｔｈｅＢｉｏｌｏｉｃａｌＭｅｔａｂｏｌｉｃＮｅｔｗｏｒｋＢａｓｅｄｇｙｏｇｏｎＨｂｒｉｄＰｅｔｒｉＮｅｔｙ专业名称：计算机应用技术指导教师姓名：李孝忠教授

3、研究生姓名；王龙申请学位级别：工学硕±论文提交日期：２０１５年口月论文课题来源：国家自然科学基金项目学位授予单位；天津科技大学天津科技大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究工作所取得的成果。除文中特别加Ｗ标注引用的内容外，本论文不包括任何其他个人或集体已经发表或撰写的成果内容，也不包括为获得天津科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。对本文研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中Ｗ明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签名：日期；年ｊ月／ｙ曰知识产权和专利权保护

4、声明本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师具体指导下并得到相关研究经费支持下完成的，其数据和研究成果归属于导师和作者本人，知识产权单位属天津科技大学；所涉及的创造性发明的专利权及使用权完全归天津科技大学所有。本人保证毕业后，Ｗ本论文数据和资料发表论文或使用论文工作成果时署名第一单位仍然为天津科技大学。。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担作者签名：曰期；巧６年化日／３月学位论文版权使用授极书、本学位论文作者完全了解学校有关保留使用学位论文的规定，同意学校俱留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，同意公布论文的全部或部分内容，允许论文被査

5、阅和借阅。本人授权天津科技大学可Ｗ将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。＂Ｖ’’保密（请在方框内打）Ｉ，；年解密后适用本授权书。本学位论文属于＂＂不保密ｎ／请在方框内打Ｖ）。？＾作者签名：ｉＪｂ日期必年月／犯导臓名／么：０期：乂年ｉ餅曰木摘要生物代谢一一网络中众多反应的途直是生命科学研究的基础领域之，对化物代谢径、作用、原理等进行透卿研究，对生物学、医学甚至是制药学等等各种领域都有着，如果能够直观地表现出来重要的意义。生物代谢过程微观、复杂，将为代谢网络的研究提供极大便利一

6、一。如何直观、准确的建立化物代谢网络的模型直是个难点与研究焦点。传统的生物建模方法存在适用范围窄、无法对代谢网络更为微小的反应过程建模、局限于仅有单个反应方程或者能够线性相加的数个方程的建模、与代谢网络结构契合度低等缺陷。基于对该些缺陷的改进，Ｗ及对生物代谢网络建模分析的特殊需求，本文进行了生物代谢网络的混合Ｐｅｔｒｉ网建模研究，具体研究工作有Ｗ下几点：１Ｐｅｔｒｉ网在建模领域的理论发展历程进行了总结ｅｔ（）对，并对国内外使用Ｐｒｉ网理论对生化领域进行建模分析的研究现状做了归纳，概述了研究生化网络、代谢网络的众多理论、思路、方法Ｗ及对Ｐｅｔｒｉ网理论的优化扩展。？

7、Ｐ一口ｅｔｒｉ网进行建模分析。提出了个生物代谢Ｎ络ＨＰＮ建模的详细建）使用混合模步骤，使用该建模少骤，能够实现在缺乏生物代谢相关理论知识、生化试验环境与条件的情况下进行生化建模。并綾酸循环为实例，依照提出的建模步骤建立了混ｅ＊，使用建模软件ＳＮＯＯＰＹ２合Ｐｔｒｉ网系统模型．０对建立的模型进行仿真模拟与分析。证实了该理论的正确性与可行性。３ｅ一在王綾酸循环混合Ｐｔｒｉ网的基