小麦抽穗期基因tahdm605精细作图

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1、密级：论文编号:中囯农业科学院学位论文小麦抽穗期基因精细作图FinemappingofheadingdategeneTaHdM605inhexaploidwheat(Triticumaestivumh.)博士研究生:刘国祥指导教师：刘旭研究员孔秀英研究员申请学位类别：理学博士专业：生物化学与分子生物学研究方向：植物分子生物学与基因工程培养单位：作物科学研究所中国农业科学晓研究生院2015年3月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研

2、究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间：>3A年r月知曰关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名:时间：>ir年5月知曰导师签名:时间：％//年，月；^曰中国农业科学院博士

3、学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目小麦抽穗期基因精细作图生物化学与分子植物分子生物学论文作者刘国样专业研究方向生物学与基因工程指导教师刘旭孔秀英培养单位（研究所、中心）作物科学研究所硕（博）姓名职称单位专业签名导师硕导口评博导口硕导口阅博导口人硕导口博导口答辩硕导口中国科学院遗传与生物化学与主张爱民研究员博导口发育生物学研究所分子生物学4席硕导口中国科学院遗传与生物化学与张爱民研究员博导口发育生物学研究所分子生物学硕导口中国科学院遗传与生物化学与张相岐研究员博导口发育生物学研究所分子生物学4-答硕导口中国农业大学农业作物遗传刘志勇教授博导口与技术学院

4、育种辩硕导口中国农业大学农业作物遗传倪中福教授博导口与技术学院育种委硕导口中国农业科学院生生物化学与黄荣峰研究员博导口物技术研究所分子生物学员硕导口中国农业科学院作生物化学与傅永福研究员/博导口物科学研究所分子生物学^m/i~硕导口中国农业科学院作生物化学与程治军研究员博导口物科学研究所分子生物学tiyy会议记录（秘书）豕i超时间：2015-05-20上午8:30地点：中国农业科学院重点工程楼论文答辩时间地点220室Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationFinemappin

5、gofheadingdategeneTaHdM605inhexaploidwheat(TriticumaestivumL.)Ph.D.Candidate：GuoxiangLiuSupervisor：Prof.XuLiuProf.XiuyingKongMajor：BiochemistryandMolecularBiologySpecialty:PlantmolecularbiologyandgeneengineeringMonth2015摘要适宜的抽穗期是保证作物高产稳产的重要前提，因此挖掘抽穗期相关基因并对其功能进行解析，不但可以为培育具有适应不同生态环境

6、的小麦新品种提供候选基因，而且可以增加对小麦抽穗调控机理的理解和认识。小麦抽穗期突变体M605是从小麦偃展4110（YZ4110）EMS突变体库中筛选出的一个特晚抽穗的突变体，其携带一隐性基因TaHdM605。我们前期的研究已将TaHdM605定位于小麦3DL染色体上。基因的精细作图是基因图位克隆的基石。本文利用小麦基因组序列信息及比较基因组学的原理对小麦抽穗期基因TaHdM605所在区段进行了共线性分析，利用序列比对分析的结果开发了大量新的分子标记，绘制了小麦抽穗期基因TaHdM605精细遗传图谱。利用TaHdM605两侧的分子标记barc42和cfd1

7、52的序列分别BLAST水稻、高粱、大麦和短柄草的基因组序列，通过序列的比对分析，将TaHdM605基因锁定在水稻的LOC_Os01g66190-LOC_Os01g67360、高粱Sb03g042010-Sb03g042770、大麦3H染色体480Mb-510Mb和短柄草Bradi2g57170-Bradi2g57710区间内，共线性分析表明该区段在不同物种中具有比较好的共线性关系。通过序列的比对分析，在此区间内共开发了1046对SSR分子标记，发现8对连锁的分子标记，其中最近的分子标记M310距离目标基因0.8cM。利用新近发表的小麦中国春3B染色体序列

8、和粗山羊草基因组序列草图又开发了766对对新的SSR分子标记，发现