高粱抽穗期基因ma1和ma3的分子进化及抽穗期的q

《高粱抽穗期基因ma1和ma3的分子进化及抽穗期的q》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。

1、高粱抽穗期基因Ma1和Ma3的分子进化及抽穗期的Q第一章文献综述1.1高粱基因组学研究进展在分子标记应用早期，RFLP标记在鉴别调控高粱重要农艺性状的相关基因区域，遗传多样性分析和比较基因组学作图等方面都起了非同凡响的作用。最早报道的高梁分子遗传连锁图谱就是由Hulbert等（1990)构建的图长度为283cM的含有36个RFLP标记和8个连锁群（LG)的遗传连锁图。随着高粱分子标记的逐步开发和应用，SSR标记越来越多地被应用到育种工作中。与其他种类的分子标记相比，SSR标记具有重复性好，多态性高，操作快速简单等特点。起初，高粱SSR标记的开发主要是通过构建高粱基因文库，用S

2、SR探针杂交和蹄选阳性克隆然后测序的方法(ConditandHubbell1991)<.但是这种方法既繁琐，花费又大。所以Broino等（1997)利用探针扫描高粱基因组文库和搜寻数据库的方法发现了13对SSR引物，其中的7对被整合到一张他们用同样的群体构建的高粱RFLP分子遗传谱图的5个连锁群中。在2000年，Kong等利用寡聚核苷酸探针扫描51个高粱基因组文库的方法检测到了38对SSR引物，并用它们鉴定了包括一个重组自交系的亲本(BTx623XIS3620C)在内的18个高粱品种的基因型，把其中31对在两亲本之间有差异的标记整合到他们已构建的RFLP分子遗传图谱中,

3、有效地填补了空白间隙。同年，Bhattramakki等(2000)也是利用搜寻BAC文库和数据库的方法开发了313对SSR标记，并发表了一张长度为1406cM的其中整合有147对SSR标记和323对RFLP标记的分子遗传图谱。在这张图谱的每个连锁群中，SSR标记的数量从8个到30个不等，有效覆盖了连锁图的75%,为以后的高粱分子肓种工作做出了巨大贡献。然后他们将其中136对SSR标记整合在Menz等（2002)利用亲本为BTx623XIS3620C的重组自交系群体构建的长为1713cM的高密度分子遗传图谱中。这张图谱至今也堪称经典，对高粱基因组学的深入研究有着重要的意义。..

4、1.2调控高粱抽穗期的基因的研究进展高粱是短日照作物，光周期对高粱的抽穗期有较大影响（卢庆善等，2005)。现认为至少有6个基因位点通过调节高粱对光周期的敏感度来调控高粱的抽穗期，分别是MaiM5份栽培品种和3份近缘野生品种）可以在北京抽穗的高粱品种种植于中国农业大学上庄实验站(上庄40°N,116°E)，记录抽穗日期。同年冬季,我们将在北京套袋自交收种后得到的H)7份高粱品种（104份栽培品种和3份近缘野生品种)种植于中国农业大学海南实验站(三亚]8°N，109°E)并记录抽穗日期（附表1)。抽穗日期以在一行种植的10株单株中有5株开始抽穗时

5、的日期为准。..2.2结果与分析在本研宄中，我们将Mij基因组序列分为基因上游区域（起始密码子上游1856bp),基因编码区（从起始密码子至终止密码子共7320bp,包括4个外显子和3个内含子）和基因下游区域(终止密码子下游889bp)进行分析。如表2-1所示，在242份栽培高粱品种的基因组序列中，我们共发现了221个单核昔酸多态位点（SNP)和117个插入缺失多态位点（In-Del)。几乎近一半的SNP存在于基因上游区域，内含子和外显子次之，基因下游区域最少。而In-Dd则大部分存在于内含子，外显子和基因上游区域次之，基因下游区域最少。而在9份野生高粱品种的Tl/a』基因组

6、序列中，我们共发现了106个单核苷酸多态位点（SNP)，有近一半的SNP存在于内含子区域，基因上、下游区域次之，外显子最少（附表6)。Childs等（1997)的研究结果表明，Mzj基因的第三个外显子上的一个腺噪呤的缺失突变会引起转录移码，导致转录提前终止，不能合成具有正常生物活性的光敏色素B,因此含有基因的植株表现为对光周期不敏感而开花提早。在本研究使用的全部材料中，只发现了6份（gee,g58m,g44in,g38m,gcpandgsl86)含有inoetal.,1997；Kongetal.,2000；Bhattramakkietal.，2000;Schlossetal.

7、,2002；Srinivasetal.,2008；Srinivasetal.,2009)、sam系列（Lietal.，2009)和SB系列（Yonemaruetal.,2009).其中Fs系列中共含有均勾覆盖高粱10条染色体的286对标记，因此我们先使用这286对标记进行初步引物蹄选，然后根据染色体上多态性标记空缺的位置，补充蹄选相应的sam系列和SB系列标记（朱梦娇，2014)。最终尽量保证每条染色体上有10对左右的引物均匆分布，每两对引物的物理距离在7000kb左右。结论本研究以Hiro-lxEar