利用捕获测序技术筛选影响鸡血清igy含量的候选基因

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2、ｖ诚磅一荷褒讀＾－沪仁如／‘技參哭：六？２２５００９导教师姓名陈国宏教授，扬州大学，江苏扬州，二背＇？＾Ｕ赵桂苹研究员－，中国农业科学院，北京，１００１９３．＂、Ａ申请学位级别：击学科专业名称：动物遗传育种与繁殖：．＿時每￣．＇２０１５；２０．论文提交Ｈ期：年５月论文答辩日期１５年５月２３日＿＿＿＿＿＾ｗ－Ｊ学位授予单粒扬州欠学学位授予日期；户；２０１５年６月３０日－＞＊＇＇－－、－：。一；郑元林教授？－．答辩委员会主席：＞．／每＜ｆ，．、＊’七；．本地矜端：舍心＾巧義＾

3、％巧衣冷己，喪，馬＾？策巧＾方方弯结蠻兴，编凌雑鳥＂＂．．．．．占？之义＾二＾义、礙誤Ｖ蓋父知论文资助项目现代农业产业技术体系建设专项资金ＣＡＲＳ－４２）（项目ＥａｒｍａｒｋｅｄｆｕｎｄｆｏｒＣｈｉｎａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅＲｅｓｅａｒｃｈＳｙｓｔｅｍ－Ｇｒａｎｔｎｏ．ＣＡＲＳ４２（）刘满：利用巧获测序技术筛选影响鸡血清Ｉ巧含量的候选基因［利用捕获测序技术筛选影响鸡血清ＩｇＹ含量的候选基因中文摘要一抗病性状的功能基因筛选和鉴患直是现代家禽育种研究的热点。前期研究中，已利

4、用６０ＫＳＮＰＢｅａｄ浊ｉｐ技术，通过全基因组关联分析（ＧＷＡ巧筛选到了与鸡免疫性状相关显著关联位点及重要区域，在此基础上，对与血清免疫球蛋白ＹｄｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎＹ，ＩｇＹ）含量显著相关的染色体区域进行了重测序分析。Ｗ５６日齡北京油鸡（样本数７２８只）和白来航鸡（样本数５２５只）为素材，分别选择ＩｇＹ含量极高和极低个体各４０个，组成两品种、高低表型各４个处理组，每个处理随机等量（ｌＯＯｎｇ心Ｌ）混成分为４个重复，每个重复（池）包含１０个个体。筛选分布于１１，１６和１９Ｈ条染色体上共３．３Ｍ的候选目

5、标区域，运用捕获芯片、Ｓｏｌｅｘａ高通量测序等技术进行测序分析。共获得单碱基变异３５１５４个，经注释，其中基因型为纯合的碱基变异为２８８６２个，杂合的单碱基变异６２９２个ＣＤＳ区的同义突变ＳＮＰ１０４５个，得到，引起氨基酸发生变化的错义突变有２１９０个，位于基因上的ＳＮＰ有１８３３２个８２９ｅｌ位点，。筛选到个Ｉｎｄ其中绝大部分位于ｍＲＮＡ区域。随机挑选四个基因乃？／Ｍ７义公巧防厶＾扮ＰＷ及乂及以，运用ＰＣ民－ＮＰＳａｎｇｅｒ法进行混池测序得到２４个Ｓ，包含二代测序结果中的２１个ＳＮＰ位点，证实捕获测序ＳＮＰ结果

6、可靠。对２个Ｉｎｄｅｌ进行验证，其中１６号染色体上公基因上的９个碱基（ＣＣＡＣＴＧＣＣＡ）的缺失是在两品种高表型组共有的Ｉｎｄｅｌ突变，与捕获测序结果一致。对公ｆＶ基西Ｉｎｄｅｌ所在的内含子５的多态性进行检测，结果表明，在进行捕获测序的北京油鸡和白来航鸡样本中，该Ｉｎｄｅ（）ｌ区域存在兰种基因型，即野生型９个碱基全部存在，ＡＡ型、突变型巧个碱基其中兰个发生突变，ＢＢ型）、缺失型（９个碱基全部缺失，ＣＣ型），但基巧型ＩｇＹ均值间呈现ＡＡ＜ＢＢＡＡ＜ＣＣ的变化．，但差异并不显著（Ｐ＞００５），，两个品种具有相同的变化

7、趋势。在窩度选育的白来航鸡马立克氏病易感品系Ｂ１９单倍型（３７只）的基因型全部为ＡＡ型，抗病品系Ｂ２１单倍型（３４只）的基因型全部为ＢＢ型，基因型频率各为１００％。ＭＨＣ５／７基巧影响１类抗原分子与抗原化结合的特异性，本研究发现的９ｂｐ碱基的突变可能引起的Ｗ变剪接或者基因表达差异，继而改变鸡血清ＩｇＹ抗体的生成及马立克氏病的抗病性。Ｉ／／关键词：鸡Ｙ含量公ＭＣ立克氏病；血清ｇ；捕获测序；：马？扬州大学硕±学位论文ＳｃｒｅｅｎｉｎｇＣａｎｄｉｄａｔｅＧｅｎｅｓＡｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈＣｈｉｃｋｅ

8、ｎＳｅｒｕｍＩＹｇＣｏｎｔｅｎｔｂｙＴａｒｅｔｅｄＲｅｓｅｅｎｃｉｎｇｑｕｇＡｂｓｔｒａｃｔＴｈｅｓｃｒｅｅｎｉｎｇａｎｄｉｄｅｎｔｉ行ｃａｔｉｏｎｏｆｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ