高邮鸭vldlr基因的序列分析及其多态性与生长和屠宰性状的相关性研究

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1、分类号学＾ＭＺ１２５０２ＵＤＣ密级媛叫义葦祖ＹＡＮＱＺ巧ＱＵＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ含硕去学佐冷文（专业型）高邮鸭ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多态性与生长和屠宰性状的相关性研究赵南南２２５００９指导教师姓名，拐州大学，泣，：张汤杰教授苏扬州申请学位级别：硕壬学科专业名称：兽医硕壬论文提交日期：２０１５年４月论文答辩日期：２０１５年６月学位授予单位：扬州大学学位授予日期：２０１５年６月答辩委员会主席：高玉时论文评阅人：许小琴欧阳红生．２０

2、１５年６月高邮鸭ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多态性与生长和屠宰性状的相关性研究ＳｅｕｅｎｃｅａｎａｌｓｉｓｏｆＶＬＤＬＲｅｎｅａｎｄｓｔｕｄｏｎｉｆｓｑｙｇｙｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓａｎｄａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｗｉｔｈｇｒｏｗｔｈａｎｄｃａｒｃａｓｓｔｒａｉｔｓｉｎＧａｏｏｕｄｕｃｋｙ本研究由江苏高校优势学科建设工程资助项目江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中也资助研究生；赵南南导师；张汤杰教授扬州大学兽医学院二零一五年六月赵南南

3、：高邮鸭ＶＬＤＬ民基因的序列分析及其多态性与生长和屠宰性状的相关性研巧１高邮鸭ＶＬＤＬＲ基因的序列分析及其多态性与生长和屠宰性状的相关性研究中文摘要极低密度脂蛋白受体（Ｖｅｒｙｌｏｗｄｅｎｓｉｔｙｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｒｅｃｅｐｔｏｒ，ＶＬＤＬＲ）是低密度脂蛋白一受体（Ｌｏｗｄｅｎｓｉｔｙｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｒｅｃｅｐｔｏｒ，ＬＤＬＲ）家族的员，能高亲和为结合富含ＡｐｏＥ的脂蛋白参与甘油王脂的代谢。ＶＬＤＬＲ广泛分布在也脏、骨骼肌、脂肪组织和脑等机体组织，但是在肝脏中表达较少。本

4、实验首先对高邮鸭ＶＬＤＬＲ基因进行了克隆测序，并利用生物信息学方法对该基因的分子特征和结构进行了分析和预测；然后对ＶＬＤＬＲ基因序列进行多态性与生长及屠宰性状的相关性分析，为高邮鸭的分子育种奠定理论和实践基础。１高邮鸭ＶＬＤＬＲ基因的克隆及序列分析－为探讨高邮鸭ＶＬＤＬＲ基因的生物信息学功能，本研巧采用ＲＴＰＣＲ方法克隆高邮鸭肌肉组织中ＶＬＤＬＲ基因的编码区序列，并对其核巧酸序列和推导的氨基酸序列进行了分析。结果表明；高邮鸭ＶＬＤＬ民基因的编码区含有２２４４个核巧酸，编码７４７个氨基酸，Ｇｅｎｂａｎ

5、ｋ登录号为ＫＰ３３５１４９；高邮鸭与杂交鸭、鸡、牛、人、小鼠、家兔、大鼠、野猪、斑马鱼的ＶＬＤＬＲ基因编码区核巧酸序列的同源性分别为９０．９％、８４．５％、７１．３％、７３．３％、７１．８％、７２．１％、７２．１％、７１．７％、６３．２％，高邮鸭ＶＬＤＵＩ基因编码的氨基酸序列与杂交鸭、鸡、牛、人、小鼠、家兔、大鼠、野猪、斑马鱼的同源性分别为９３．７％、９２．５％、７７．９％、〇■７８一．１％、７８．７％、７８．１％、７７．９／〇、７８．５％、６５．９％。高邮鸭ＶＬＤＬＲ蛋白质是个亲水１生跨膜蛋白二Ｎ－，在３

6、，其级结构由ａ螺旋、Ｐ转角和无规则卷曲构成其胞外区有个糖基化位点－和８个０糖基化位点。信号化分析表明，ＶＬＤＬＲ蛋白为分泌性蛋白，最有可能的切割位一点位于第％位和３７位氨基酸之间。本研究为进步研究鸭ＶＬＤＬ民基因表达、生物学活性和应用奠定基础。２高邮鸭ＶＬＤＬＲ基因的多态性及其与生长和屠宰性巧的关联分析为研究ＶＬＤＬＲ基因多态性对高邮鸭生长发育和屠宰性状的遗传效应，本实验Ｗ２８０只高邮鸭为实验材料，采用ＤＮＡ测序技术对ＶＬＤＬＲ基因进行多态性检测，共筛选出８＞Ａ＞Ｔ＞Ａ－＞Ｔ个ＳＮＰｓ位点．ｌ６７

7、Ｇ，．２３１Ｃ，．２４３Ｇ，．３％３＾ｉｎｓＣＴ，．３５９ｄｅｌＴ．４９８Ｃ，，ｇｇｇｇｇｇ２扬州大学硕±学位论文－＞＞Ａｇ．５６３５６４ｉｎｓＧＡ和ｇ．６３１ＧＡ，其中ｇ．２３１ＯＴ和ｇ．２４３Ｇ位点位于编码区内，为同义突－变：．２３１Ｃ＞、．３５ｉｎｓＣＴ，不引起氨基酸的改变。遗传多态性分析结果表明公鸭的ｇＴｇ６３５７＞（及母鸭的ｇ．６３１ＧＡ位点为低度多态ＰＩＣ＜０．２５），其余位点均表现为中度多态２（０．２５＜ＰＩＣ＜０．５）；义适合性检验显示，ｇ．４９８Ｃ＞Ｔ和．６３１Ｇ＞Ａ显著偏离了

8、Ｈａｒｄ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇｙｇ＾＞ａｒｄ－Ｗｅｎｂｅｒ平衡（ＰＯ．０５），而其它ＳＮＰ位点服从Ｈｙｉｇ平衡（Ｐ０．０５）。基于这８个ＳＮＰｓ８位点，采用Ｐｈａｓｅ软件共组建了个单倍型，其中ＨＩ单倍型在公母两个群体中所占比例二？最高