高原高血压相关基因的生物信息学分析

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1、＇Ｉ分类号ＴＰ３９９密级公巧Ｕ口Ｃ学号２０１２０６１３００６＿＿＿＿＿青海师苑大学硕古學化伦文离原离血压相关基因的生馈信患学分祈硏究生姓名李适导师姓名（职祿）来长新，教授审塘学位类别硕±学科专业名称计算机应用技术研究方向名称数据挖掘与生物信息论文提受日期２０巧年４月论丈答辩日期２０１５年５丹学位授予单位青海师范大学学化授予日期２０巧年６月＇．？－，．答辩垂员会主席．孙綺龙Ｉ．评滅人谢孟荣，张虎勤青海师范

2、大学学位论文独创幢声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别＾人己经发表或加１乂标注和致谢的地方外，论文中不包含其他撰写过的研究成果，化不包含為获得青海师范大学或其它教一育机构的学位或证书而使用过的材料。与我同工作的同志対本研究所做的任何贡献均己在论文中做了明确的说明并表示了谢意。曰：．研究生签省：期如／Ｓ．Ｃ冬斗＾Ｐ＾青海师范大学学位论文使用授权声明青海师范大学、中国科学技术信息研究所、国家图书馆有权保幫本人所送

3、交学位论文的复巧件和电子文档，可於采用影印。本人电子文档的内、缩印或其他复制手段保存论文一容和纸。密论文，论文的相除在保密期巧的保外质内容致Ｌ，义公（）论文的全部许论文被查和借阅可布包括刊登允阅或部分（包刊）授范大内容。论文的公布括登权由青海师学生部。研究办理、生签：曰究養导师签為期乂研芝高原高血压相关基因的生物信息学分析摘要生物信息学，是作为80年代兴起的交叉学科，可破译隐藏在DNA序列中的遗传语言。如今，随着生物信息学与计算机科学的高速发展，国际国内的相关研究越来越多，各种生物数据呈爆炸式

4、增长，各种数据库也相继建立并日益完善，更加激起了研究者的热情也使得一些研究工作更加便捷、高效。近年来，随着社会经济和科技的发展，生活在高原地区的人民、守护在祖国边疆的边防战士、为科研奋斗在高原的学者等人群的高原病越来越收到国家的重视，其中高原高血压是常见的高原病之一。长期生活在高原或是第一次来高原的很多人都会有不同反应，因此对高原高血压的研究具有重要的意义。本文以生物信息学为基础，在阅读大量的高血压相关文献以及结合其他研究生的相关研究基础上，通过对基因的差异性表达及其SNP注释等方面来对高原低氧环境下影响高血压的相关基因

5、进行研究，通过查找、搜集可靠地数据来源，通过对比多个数据库，对所获取的数据进行整理、分析，使数据来源更加可靠，为后续的分析提供有力基础保障。本文也充分利用计算机技术，使用比较便捷的工具进行研究，如通过NCBI所提供的GEO2R实现对相关基因表达谱预处理，方便快捷的获取相关结果。为了实现对基因表达差异性分析的结果更加直观，采用了比较流行的可视化工具Cytoscape，它提供了丰富的插件接口，使结果展示更加直观、有针对性。在科学工作流程化分析方面，使用了目前比较热门的BioKepler工具，它在大量数据处理和分析集成等方面非

6、常突出，并且集成了R、MatlAB等通用的分析以及可视化软件，使得本文的流程分析快捷、高效。总之，本文结合数据挖掘技术和生物信息学，充分利用计算机资源，对高原高血压的相关基因做了分析，得到了目前已知的影响高原高血压的基因，并对这些基因的SNP注释得到在高原环境下针对高血压症状中比较重要功能的基因突变，将这些分析结果以图形、图像等直观的展现出来。这为其他研究者高血压相关的差异表达基因的分析以及重要突变位点等的研究提供了一些借鉴。关键词：数据挖掘，生物信息学，差异性表达，cytoscape，biokeplerIBioinfo

7、rmaticsanalysisplateauhypertension-relatedgenesAbstractBioinformatics,theriseinthe1980sasacross-disciplinary,candecipherthegeneticlanguagehiddenintheDNAsequence.Today,withtherapiddevelopmentofbioinformaticsandcomputerscience,Internationalanddomesticresearchbecome

8、moreandmore,Varietyofbiologicaldatahasalotofgrowth.Variousdatabaseshavealsoestablishedandincreasinglysophisticated,arousedtheenthusiasmofresearchersalsomakesso