西南地区稻瘟病菌群体遗传多样性分析及其毒性相关基因分布频率初步预测

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1、分类号Ｓ３３６学号Ｓ２０１２２０３６四川巧化大学硕王学位论文西巧地区稻窥巧苗群休造传多巧性分巧及其毒性巧芙基因分布頻率初步预巧颜学海，？＇指导巧师朱军勘研究员＿巧巧巧副研究员学科专业化化巧佑窗种巧究方向分子巧衡巧巧２０１５年６月Ａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙａｍｏｎｇｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓａｎｄｔｈｅｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｙｆｏｒｅｃａｓｔｉｎｇｏｆｔｈｅｖｉｒｕｌｅ打ｃｅｅｎｅｄｉｓ

2、ｔｒｉｂｕｔｉｏｎｆｒｅｕｅｎｃｆｏｒｇｑｙｔｈｅｒｉｃｅｂｌａｓｔｆｕｎｇｕｓＭａｇｎａｐｏｒｔｈｅｏｒｙｚａｅｉｎｓｏｕｔｈｗｅｓｔｒｅｉｏｎｏｆＣｈｉｎａｇＢｙ－ＨａＹａｎＸｕｅｉＤｉｒｅｃｔｅｄｂｙ乂ｓｓｏｓｃｉａ化Ｐｒｏｆ．ＺｈｕＪｉｍａｎｄＤｅｎｇｑｉｍｉｎｇ＊ＡＤｉｓｓｅｉｔａｔｉｏｎＳｕｂｍｉｔｔｅｄｉｎＰａｒｔｉａｌＦｕｌｆｉｌｌｍｅｎｔｏｆＲｅｑｕｉｒｅｍｅｎｔｓｆｏｒｔｈｅＤｅｒｅｅｏｆＭａ

3、ｓｔｅｒｇＩｎＳｉｃｈｕａｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒｅＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＣｈｅｎｇＤｕＳｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ６１１１３０Ｊｕｎｅ２０１５，Ｉ论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知？，学位论文，除了文中特别加ｙ标注和致谢的地方外中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它一教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文

4、中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名；年月／曰／关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留，：、使用学位论文的规定即学校有权保留并向国家ｉ，，可ｌ有关部口或机构送交论文的复印件和电子版允许论文彼查阅和借阅ｌｉ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。论文不保密。□本论文保密，在年解密后适用本授权。＾＿＂＂（请在Ｗ上□内划Ｖ）研究生签名：＾年女月曰Ｊ／支ｊ＾导师签

5、名：年月／日摘要＝由稻媪病菌（Ｍａｇｎｗｏ诚ｅｗｙｚａｅ）引起的稻痘病是世界水稻生产中大毁灭性病一一一害之，也是西南地区季稻常见的流行性病害之。该病害在贵州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地发生率非常高。因此，致力于稻痘病菌群体遗传结构及其多样性的研究、掌握其毒性相关基因的出现频率，对于品种选育、合理布局和延长抗病品种的使用寿命等方面都具有重要的意义。本研究通过对西南地区８个县（市）所采集到的穗颈窗标样进行病菌分离，选用１３对ＳＳ民引物和１６对毒性相关基因特异性引物对病

6、原菌基因组ＤＮＡ进行ＰＣ民扩增。一－立基于ＳＳ民序列和毒性相关基因序列的０１根据反应的结果，建数据库，通过系列软件对病原菌群体遗传结构及遗传多样性进行分析，并根据扩增结果初步预测毒性相关基因的分布频率；，得到如下结论１、通过分离得到２００个单跑分离菌株。其中四川雅安口株，温江巧板南充３３株，自贡６株；重庆永川２５株，垫江２４株，梁平１５株；贵州媚潭８株。２、８对ＳＳ民引物都能扩增出特异性条带，扩增频率较高，大部分在９５．００％＾上；１６对毒性相关基因特异性引物均能扩増出目的条带，

7、扩増频率差异较大。３、西南地区稻瘋病菌群体遗传结构复杂，层次丰富。２００个供试菌株可Ｗ归为９０个不同的单元型，包括１个绝对优势单元型，２２个次要单元型，６７个稀有单元型。００２４个遗１在．９遗传相似水平下划分为传宗谱，包括个绝对优势宗谱、５个亚优势宗谱、７个次要宗谱和１１个小宗谱。８个区域稻痘病茵的单元型和遗传宗谱都非常丰一富。相同来源的菌株能够构成不同的单元型和遗传宗谱，同单元型和遗传宗谱的菌一株来源也不尽相同，各区域内的菌株在群体遗传结构上反映出定的特异性和明显的多样性。

8、４、通过遗传参数分析显示西南地区稲痘病菌的遗传多样性比较丰富。在群体平均水平上ｅ＇，有效等位基因数目Ａｋ为１．４４６６，Ｎｉｓ基因多样性指数（好）为０．２７５３，（）Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数（／）为０．４２９１，多态性位点数（Ａ巧为２８个，多态位点百分率（巧为一９６．５０％。不同区域之间，各群体的遗传多样性水平具有定差异。来源于南充的Ｉ稲痘病菌群体具有较高的遗传多样性，其次是自贡、永川、雅安相对