四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析

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1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),2015,29(3):327-334http://www.ricesci.cnDOI:10.3969/ji.ssn.1001G7216.2015.03.013327四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析王玲1,2左示敏1张亚芳1陈宗祥1潘学彪1,∗黄世文2,∗(1扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏扬州225009;2中国水稻研究所,杭州310006;∗通讯联系人,EGmail:shuidao@yzu.edu.cn;huangsh

2、iwen@caas.cn)GeneticStructureofRiceBlastPathogenMagnaportheoryzaeinSichuanProvinceWANGLing1,2,ZUOShiGmin1,ZHANGYaGfang1,CHENZongGxiang1,PANXueGbiao1,∗,HUANGShiGwen2,∗(1KeyLaboratoryofCropGeneticsandPhysiologyofJiangsuProvince/KeyLaboratoryofPlantFunction

3、alGenomicsofMinistryofEducation,YangzhouUniversity,Yangzhou225009,China;2ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou310006,China;∗Correspondingauthor,EGmail:shuidao@yzue.duc.n;Huangshiwen@caasc.n)WANGLing,ZUOShimin,ZHANGYafang,etal.Geneticstructureofrice

4、blastpathogenMagnaportheoryzaeinSichuanProvince.ChinJRiceSci,2015,29(3):327G334.Abstract:Riceblast,causedbyMagnaportheoryzae,isoneofthemostdestructivediseaseworldwide.ThegeneticstructureoffivepopulationsofM.oryzae,collectedfromMianyang,Yingshan,Ya’an,Bei

5、chuanandWushengofSichuanProvince,wereanalyzedusingsixfluorescentlabeledSSRmarkers.Atotalof43polymorphicalleleswereproducedin124isolatesofM.oryzae.Themeannumberofobservedalleles(Na)andeffectivealleles(Ne)perlocuswere7.2and3.1,respectively,andalllociexhibi

6、tedsignificantdeviationsfromHardyGWeinbergequilibrium.Themeanobservedheterozygosity(Ho=0.374)waslowerthanexpected(He=0.502),indicatingthedeficitofheterozygotesresultingfromtheaccumulationofinbreedingwithinpopulations.Analysisofmolecularvarianceshowedthat

7、themajority(81.17%)ofgeneticvariationwasattributedtothedifferencesamongisolateswithinpopulation,withonly18.83%ofthevariationresultingfromdifferencesamongpopulations.Highlevelsofgeneticdifferentiation(Fst,0.057-0.528)existedamongallfivegeographicalpopulat

8、ions.Manteltestrevealednosignificantcorrelationbetweenthegeneticandgeographicaldistancesforallpopulations(r=-0.201,P=0.587),indicatingthatthegeneticvariationofM.oryzaepopulationswasrandomlydistributedingeographicspace.Diff

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