甘蔗热带种、割手密bac文库序列与高粱同源序列的初步比较学分析

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3、嘗气括裳足－指导教师．：陈由强教授！々｜ｒ．誇补技；’±／苗申请学位级别：ｍ，±Ｍ摩茲裏＂－’貧类－，．．ｉ哉；，啼私、：、：Ｔ：２０１５年月日．；．＼论文提交日期罕４．’论文评巧人：、，．證，＇＇声；＇拿／二％／／＼／特抗论文答辩曰期：２０巧年月日满：．Ｖ答辩委员会主巧：跨；妍為咬心冶！义疋，’＇；‘媒、诚巧学位授予单位．Ｖ品茄：福建师范大学＿海／／＞為兵躬片１＇学位授予日期：．释年Ｊ：辦享辩带’巧脚！巧＂＇；敬本．ｒｆ藻氏Ｉ、．省

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5、割手密细茜人工染色体文库的建立为甘谎种质育种与基因发现提供了基因组学上的便利。本研究Ｗ两文库作为研究素材，通过对筛选出来的ＢＡＣｓ序列与高梁序列的同源比较Ｗ及热带种与割手密间的同源一比较来初步揭示两亲本种的基因组信息Ｗ进步丰富对甘旗基因组的认识。首先－，利用比较学在高梁基因绝数据库中捜寻ＦＴｌｉｋｅ基因（ＦｌｏｗｅｒｉｎＬｏｃｕｓＴ）ｇ１－ｌｉｋｅ并Ｗ１１条高梁序列设计探针引物，探针共筛选出个热带种与３个割手密含ＦＴｓ５４－克隆，注释到４个甘荒ＦＴｅ。基因ＢＡＣ，经过４测序和序列拼装后

6、ｌｉｋ家族成员通过ＢＡＣｓ序列与高梁、水稻同源区的比较反映微观共线性的存在也同时揭示了割－ｉｋｅ手密中染色体重排序现象的发生。另外，我们还发现ＦＴｌ基因周边存有较多的调一。控基因随后将比较的规模扩大，通过先前实验室利用批基因探针所钓取的甘庶ＢＡＣ一糖代谢ｓ库来进行进步的比较。完成４５４测序Ｗ及８７个ＢＡＣｓ序列的缺口。填补，Ｗ高梁基因组为媒介，比较热带种与割手密的同源序列发现热带种相对高。梁在基本基因组上的扩展趋势，而割手密却比较稳定在重复元件上，热带种Ｗ突。ＬＴＲ反出的Ｇｙｐ巧反转座子高比

7、例为特征，而割手密含有相对较少的重复序列对转座子的调查反映了甘庶转座元件的活跃，并观察到其对新等位基因的促生与基因假基因化的作用。此外对ＢＡＣｓ上注释到的ＦＲＫ果糖激酶家族成员进行选择压力估一ＦＲＫ算，基因受偏向正向的选择作用。最后我们将高梁与甘薦的进化分支时间定？位为５．４７．０５百万年前，热带种与割手密的分支时间为１．７百万年。本研究基于两甘旗亲本种与髙梁间的同源序列的比较学分析，在通过比较学获取目的基因的同时一，也初步地揭示了热带种与割手密的基因组信息，进步丰富对甘藏基因组的认识。关

8、键词：同源比较；Ｆ村ｉｋｅ基因；热带种：割手密；Ｉ．？ＡｂｓｔｒａｃｔＡｂｓｈａｃｒｔＲｏｕｎｄｓｏｆＩｎｔｅｒｓｐｅｃ姐ｃｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎａｎｄｂａｃｋｃｒｏ化ｂｅｔｗｅｅｎ说ｃｃ片ａｒｗｗｏｆｉｃｉｍｒｕｍａｎｄＳａｃｃｈａｒｕｍｓｐｏｎｔａｎｅｕｍｐｒｏｄｕｃｅｄ