水稻不育系系谱抗稻瘟病基因同源序列的克隆与序列分析

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1、亚热带农业研究第6卷第3期SubtropicalAgricultureResearch2010年8月水稻不育系系谱抗稻瘟病基因同源序列的克隆与序列分析黄姗，林晶，吴志源，黄利兴，游年顺，梁康迳(1．福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室，福建福州350002；2．福建省农业科学院水稻研究所，福建福州365509)摘要：根据已知NBS-LRR类抗病基因结构中氨基酸的保守区域设计简并引物，对水稻不育系系谱NBS．LRR类抗病基因同源序列进行克隆、测序和聚类。同源序列克隆与分析表明，7个水稻不育系系谱亲本中共获得14个阳性克隆，其中11个含有NB

2、S—LRR类抗病基因所特有的保守氨基酸结构域KinaseI、KinaseⅡ、KinaseII及跨膜区域。这些片段间同源性最高达98．3％，最低仅为29．7％；11个氨基酸片段与抗病基因Xa／(AB002266)的同源性较高，42％一45％的氨基酸序列相同，59％一64％的氨基酸序列相似，且与水稻其他NBS—LRR类抗性蛋白相似性很高。通过聚类分析，可以将其分为3类，分别记为Gl、G2、G3，并发现抗源谷农l3所含有的G3类基因，通过天谷、福伊传给后代谷丰、全丰。关键词：水稻；不育系系谱；抗稻瘟病；NBS—LRR类同源克隆中图分类号：Q943．2文献标识

3、码：A文章编号：1673-0925(2010)03-0199-O6CloningandsequencesanalyzingofresistancegenesfromriceblaststerilelinelineageHUANGShan，LINJing，WUZhi—yuan，HUANGLi—xing，YOUNian．shun，LIANGKang-jing(1．KeyLaboratoryofCropGeneticsandBreedingandComprehensiveUtilization，MinistryofEducation，FujianAgricu

4、ltureandForestryUniversity，Fuzhou，Fujian350002，China；2．RiceResearchInstitute，FujianAcademyofAgricuhuralSciences，Fuzhou，Fujian365509，China)Abstract：AccordingtotheknownconserveddomainoftheaminoacidintheNBS—LRRstructuregeneswecoulddesignthedegen．，erateprimerandclone，sequenceandclus

5、tertheresistancegeneanalogs(RGAs)byPCRinordertostudythepassingrulesofre．sistaneegenesandanalyzethecomparabilityofblastphenotypeandRGAs，oferingthescientificreferenceforutilityandcloneofriceblastgenes．Thecloningandanalysisofthehomologoussequenceofresistantgenesofthericesterialline

6、lineageshowedthat14masculinecloneshadbeenobtainedfrom7ricesteriallinelineage．Andtherewereonly11NBS—LRRresistantgeneswhichhadparticularconservativedomain，KinaseI，KinaselI，KinaseⅢandtransmembrancedomain．IntlleaminoacidsegmentsoftheNBS·LRRtype，themaximalhomologousqualitywas98．3％，th

7、eminimumWas29．7％．These11NBS—LRRtypesequenceswerehighlyhomologictoresistantgeneXal(AB002266)，whichhad42％一45％identicalaminoacidsand59％一64％similaraminoacidsbytheBLASTinNCBI．TheseNBS·LRRtyperesistantsequenceshadbeenseparatedintothreetypes，whichwerenamedG1，G2．G3byclusteringanalysis．A

8、nditshowedthattheG3typegenesofGunongl3hadbeenpa