异性传播hiv的准种传播和进化规律研究

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1、I1.-,,,1?‘I:;84501单化代码:学号:S8450112025g硕女緣像化义I書I泣异性传播HIV的准种传播和进化^SmX规律硏究I;IW心/JmffS控1y.|5^、^研究生:温玉洁作I中培养单位:中国疾控中也性艾中也I心导师:邱茂锋研究员副导师:蒋岩研究员潘品良主任技师^六专业:病原生物学Cf2015年,学位论文原创性、真实性声明本人郑重声明;《异性传播HIV的准种传播和进化规律研究》是本人在中国

2、疾病预防控制中也《病原生物学》专业攻读硕±学位期间,在导师指导下完成的硕±学位论文。我承诺:本论文中所涉及的所有数据、试验记录化及研究结果均真实可信,引用资料已注明出处,无11窃、篡改、抄袭么行为。如本论文原创性方面出现问题,我愿负法律责任。本课题的研究成果归中国疾病预防控制中心所有,发表文章的单位署名为中国疾病预防控制中也。特此声明!学位论文作者(签名);研究生导师(签名);旅心^U為峻2015年各月/巧20ir击月/>曰^'缩写词表 ̄m英文全称中文名称HIVHuman

3、ImmunodeficiencyVirus人类免疫缺略病毒AIDSAcuiredImmuneDefndqiciencySyrome获得性免疫缺焰综合症IDUInjectionDrugUser往射吸毒者ARTAntiretroviralTherapy抗病毒治疗PC民PolymeraseChainReaction聚合酶链式反应-RTPCRReverseTranon-PCR遮转录scripti聚合酶链式反应--EPLD-PCREndotR终点有限PC艮pinlimiti

4、ngdilutionPC稀释DNADeoxyriboNucleicAcid脱氧横糖核酸cDNAComlementarDeoxriboNucleicAcid互补链脱氧核糖核酸pyyRNARibonucleicAcid核糖核酸NTPD-deoxribonucleosidetrihoshate脱氧核糖核昔Hypp磯酸一NGSNextGenerationSequencing新代测序DEPCDiethylpyrocarbonate焦碳酸二玄醋DTTDL-Dtithiohr

5、eitol二硫苏糖醇EDTAEthyleneDiamineTetraaceticAcid乙二胺四乙酸rpm良evolutionsperminu化每分钟转數RNaseOUT—核糖核酸酶抑制剂RNaseH—核糖核酸酶TBETrisBoricEDTATris欄酸'目录1摘要ABSTRACT5前胃1013研究对象主要设备、试剂及耗材15实验方法1730结果#43论结46参考文献47附录1已发表论著50附录2综述

6、55致谢6365个人简介异性传播机V的准种传播和进化规律硏究中文摘要异性传播阻V的准科传播和进化规律研究专业;病原生物学硕±研巧生:温玉洁导师:邱茂锋研究员副导师:蒋岩研究员潘品良主任技师摘要背景HIV感染溯源研巧对于了解HIV的传播和进化规律、开展HIV职业暴露感染鉴定、医源性感染调查和司法调查等具有重要价值。国外文献报道的实验室方法主要有PCR产物直接测序、巢式PCR产物克隆测序、终点有限稀释PCR产物测序,用于在HIV基因亚型或准种水平上推断HIV的传播关系甚至传播方向

7、。但这堅方法要么所获得的信息量小、要么操作繁琐。本课题组赵埼等将Miseq高通量测序下简称Mis巧测序)成功地用于一起疑似经性传播HIV的感染溯源调查,通过提取血浆中民NA、反转录、巢C民一ise式P扩增后进行M测序,q,可W推断HIV的传播关系和传播方向提供了种操作较简便、成本较化、实用价值较高的HIV感染溯源调查技术。本研究对前期建立的HIVMis巧测序分析技术进行了优化,选择传播关系和传播时间明确的7对婚内传播HIV夫妻作为研巧对象,研究异性传播HIV的准种传播和进化规律。目的1、研巧异性传播m

8、v的准种群传播规律。2、探讨样本类型(全血、血浆)及抗病毒治疗对结果分析的潜在影响。3、探讨婚内性传播曲V感染者的个体内及夫妻间HIV准种随感染时间的进化规律。材料和方法1、研

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