人工驯养七彩山鸡种群的遗传多样性及其快速建立的独特遗传背景分析

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1、分类号____________密级_________UDC____________单位代码10733甘肃农业大学硕士学位论文人工驯养“七彩山鸡”种群的遗传多样性及其快速建立的独特遗传背景分析TheAnalysisofGeneticDiversityandRapidEstablishmentofUniqueGeneticLineagesintheSemi-domesticatedRainbowPheasants(Phasianuscolchicusspp.)潘建飞指导教师姓名成述儒副教授（甘肃农业大学兰州730070）韩建林

2、教授（中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193）学科专业名称动物遗传育种与繁殖研究方向动物育种理论与技术论文答辩日期2015年5月24日学位授予日期2015年6月答辩委员会主席史兆国教授评阅人刘哲教授梁春年副研究员2015年6月Secrecy:No.TheAnalysisofGeneticDiversityandRapidEstablishmentofUniqueGeneticLineagesintheSemi-domesticatedRainbowPheasants(Phasianuscolchicusspp.)

3、ByPANJian-FeiAThesisSubmittedToGansuAgriculturalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsForMasterDegreeSupervisor:Prof.CHENGShu-RuProf.HANJian-LinCollegeofAnimalScience&TechnologyGansuAgriculturalUniversity,Lanzhou,P.RChina730070CommencementinJune,2015甘肃农业大

4、学2015届硕士学位论文摘要近年来中国从美国引进的“七彩山鸡”（Phasianuscolchicusspp.）种群是18世纪后期到19世纪早期利用几个野生雉鸡亚种杂交培育而成的，目前仍处于半驯化的人工养殖状态。为了了解“七彩山鸡”的起源和在短期人工驯养条件下形成的特异遗传背景，本研究通过PCR-DNA测序的方法，对2个“七彩山鸡”种群和2个野生雉鸡群体共计111个个体mtDNAD-loop的遗传多样性进行了比较分析。研究结果表明：4个群体线粒体D-loop区域873bp序列中的T、C、A和G4种脱氧核糖核苷酸的平均比例分别

5、为33.0%、27.8%、22.2%和17.0%，A+T含量（55.2%）高于G+C含量（44.8%），符合禽类mtDNA碱基组成偏倚性的特点；4个群体、111个个体mtDNAD-loop873bp区域内共有46个多态位点，占所测核苷酸的5.30%，其中有13个单一多态位点、32个简约信息位点和1个插入/缺失位点；这46个多态位点界定了44个单倍型，其中“七彩山鸡”的QC和SJ种群分别各拥有11和12个单倍型，二者之间存在5个共享的单倍型，这说明来源于美国的人工驯养“七彩山鸡”种群的母系遗传多样性相对比较丰富；野生雉鸡甘肃

6、亚种镇原群体的21个单倍型和莎车亚种的5个单倍型都分别为各自所特有；人工驯养“七彩山鸡”和野生雉鸡群体之间没有共享的单倍型，所以它们之间的遗传距离最远，而2个“七彩山鸡”群体间没有遗传分化，表明现在国内引进并饲养的“七彩山鸡”群体来源于美国同一个育种原始种群。利用44个单倍型构建的NJ系统发育树和Network网络关系都将它们聚类为a、b、c和d4个进化支系，单倍型在各个支系的分布数量并不均匀；其中a支系为雉鸡甘肃亚种镇原群体所特有，c支系为雉鸡莎车亚种所特有；而b和d支系为“七彩山鸡”QC和SJ种群共享的进化支系，说明美

7、国的“七彩山鸡”拥有至少2个母系起源的遗传背景，并在近期经历了快速的群体扩张。进一步从GenBank下载了274条来源于欧亚大陆野生雉鸡72群体、569个个体的mtDNAD-loop的同源序列（411bp），与本实验获得的“七彩山鸡”的相应数据进行了全面地比较分析，共获得了131个单倍型，系统发育分析将它们聚类为A、B、C、D、E和d6个进化支系，其中支系A和B是最优势的，分别分布拥有66（D1-66）和55（D67-121）个单倍型，分别占单倍型总数的50.4%和42.0%；支系C为四川威远群体所特有，仅有4个单倍型（D

8、122-125），占单倍型总数的3.1%；支系D为新疆昭苏群体所特有，单倍型数目最少，只有1个（D131），占单倍型总数的0.8%；支系E为新疆喀什群体所特有，也只有2个单倍型（D126和D127），占单倍型总数的1.5%；支系d为“七彩山鸡”种群I甘肃农业大学2015届硕士学位论文所特有的进化支系，其