基于高通量测序的芥菜结构变异（sv）标记开发及应用

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1、基于高通量测序的芥菜结构变异标记开发及应用研究生姓名：指导教师：杨景华副教授张明方专业名称：阔艺学所在学院：农业与生物扣术学院论文提交日期年月分类号：单位代码：学号：硕士学位论文基于高通量测序的芥菜结构变异标记开发及应用研究生姓名：宋全指导教师：杨景华副教授张明方专业名称：阔艺學所在学院：皮业与生物拮太学院论文提交曰期年月StructuralVariationDevelopmentandApplicationBasedonHigh-throughputSequencinginMustardBySongNingSupervisor:AssociateprofessorJinghuaYangA

2、DissertationSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterCollegeofAgricultureandBiotechnologyZhejiangUniversityJan,2015Hangzhou,China基于高通量测序的苏菜标记开发及应用论文答辩日期：年月曰答辩委员会主席：嗥莩答辩委员成员：张明方教授浙江大学研究生学位论文独性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不

3、包含为获得浙江大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字曰期：年》月上日学位论文版权使用授权书水学位论文作者完全了解浙江大学有权保留并向国家有关部门或机构送交本论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授叔浙江大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播，可以釆用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签导师签名：签字曰期：年签字曰期：如丨、年月致谢本论文是在导师杨景华副教授的悉心指导和耐心帮助下完成的，从论文的

4、选题、实验设计及论文撰写及修改等方面，无一不凝聚了老师的心血和汗水，老师渊博的学识、严谨的治学态度、求是创新的精神以及宽厚待人的品格，使我终身受益。在此，谨向我的导师杨景华副教授表示最诚挚的感谢和最崇高的敬意。在两年半的学习与实验研究期间，得到了张明方老师及胡仲远老师的耐心帮助和指导，在此表示衷心的感谢。同时感谢涂巨铭老师对遗传谱图构建的指导以及张朗朗师姐对我实验的帮助。整个研究生期间，我经历了从懵懂无知到目标明确的过程。实验室的师兄师姐师弟师妹以及同级的小伙伴们都给了我巨大的帮助。感谢吕文慧、徐宝晨、李鹌及赵挪师姐对我基础实验的指导，让我对实验仪器操作、基础实验方法有了清晰的认识和掌握。

5、感谢丁长庆师兄为我提供丰富的实验材料和资源，让许多我本以为不可能的试验成为可能。感谢时丕彪、刘国栋、吕小龙、牟海鹏等师弟师妹们在实验上的协助，让我更高效地完成实验，同时给我带来欢乐。感谢陈翠婷、马伟伟、徐新月、方炳生等同级的小伙伴们，在实验遇到困难时帮我出谋划策，挫败时给我激励，我们一起探讨实验，一起犯二傻笑的屌丝生活将是我弥足珍贵的回忆。最最要感谢的是林琳同学，感谢你在我实验受挫时无条件提供的多次帮助，更感谢你在我内心消沉时给我带来灿烂阳光。最后，我要感谢我的家人，给我足够的自由去追求自己所认同的事情。你们让我懂得，毅力、克制和信仰！感谢你们像灯塔一样指引着我做人做事的正确方向！两年半的

6、时间可长可短。感谢这两年半无私守候、默默熏陶我的浙大；感谢无所不谈，凤雨共济的朋友；感谢给我带来酸甜苦辣的实验；感谢对我赋予重望，包容我的老师⋯⋯感谢这一切让我成长，成熟，收获！我会不断探索，不懈努力先善其身，后济天下！宋宁浙江大学农业与生物技术学院年月于浙大紫金港浙江大学硕士学位论文缩写词缩写词缩写英文全名中文全名基因组结构变异内含子多态性扩增片段长度多态性随机扩增片段长度多态性随机分子标记限制性酶切片段长度多态性序列特异性扩增区单核苷酸位点多态性简单重复序列编码非同义编码碱基对单链毛细管电泳技术双蒸水直接类型功能性分子标记脱氧核糖核酸乙二胺四乙酸功能性分子标记间接类型功能性分子标记分子

7、辅助选择聚合酶链式反应微升分钟标准差浙江大学硕士学位论文缩写词数量性状位点回交群体集合分离分析厘摩尔插入缺失位点拷贝数变异序列相关扩增多态性变异系数双单倍体迭代期望及条件极大算法间隔简单重复序列连锁群毫升近等基因系开放阅读框亲本或子代或子代聚丙烯酰胺凝胶电泳重组自交系每分钟转速酶切扩增多态性序列基因分型测序阈值非加权组平均法纳克邻接法最小进化法大规模平行测序浙江大学硕士学位论文缩写词寡核苷酸连接检测电荷耦合器件边合成边测