健康和腹泻成年川金丝猴粪样菌群比较分析

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1、分类号Ｓ８３１．７学号Ｓ２０１３６３巧＿四川农业大学专业硕壬学位论文健康和腹泻成年川金丝猴粪样菌群比较分析王剑指导教师倪学勤教授校外导师王强研巧员学位类别专业学位领域名称轉戾硕女研巧方向动物微生态２０１５年６月四川农业大学专业硕±学位论文ＳｉｃｈｉｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＭａｓｔｅｒＤｅｇｒｅｅＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎＣｏｍｐａｒａｔｉｖｅｔｈｅｆｅｃａｌｆｌｏｒａｏｆｈｅａｌｔｈａ田ｄｄｉａｒｒｉｉｅａａｄｕｌｔｊＲＡ献巧ｗＹＡｅｃｗ／ｍｅ化

2、ＷａｎｇＪｉａｎＤｔ－ｎｉｒｅｃｅｄｂＮｉＸｕｅｑｉｙＣｏｌｌｅｅｏｆＶｅｔｅｒｉｎａｒＭｅｄｉｃｉｎｅＳｉｃｈｕａｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔ（ｇｙ，ｇｙ，Ｃｈｅｎｇｄｕ，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ，６１１１３０）Ｊｕｎｅ，２０１５四川农业大学专业硕±学位论文论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研巧工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研巧成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使

3、用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在。与我论文中作了明确的说明并表示了谢意。研巧生签名：主签、年（月巧日９吃＼关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可Ｗ采用影印、缩巧或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可抖用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名：（年月日运Ｉａ〇（５＾化、＇导师签名；年＾月日受巧四川农业大学专业硕±学位论文摘要为探究腹泻川金丝猴与健康

4、川金丝猴肠道菌群差异，，进而更好保护川金丝猴于－丝猴粪样２０１４年３５月在成都动物园采集健康成年川金１５份、腹泻粪样１５份（其－、）３０中３月采集健康粪样７份腹泻粪样７份，进行ＰＣＲＤＧＧＥ初步比较分析。对Ｄｕｍ－份样本应用Ｉｉｎａ平台进行１６ｓｒＲＮＡ窝通量测序，Ｗ及ＲｅａｌｔｉｍｅＰＣ民技术对细、、、、菌总数，梭茜ｃｌｕｓｔｅｒＩＶ梭菌ｃｌｕｓｔｅｒＸＰ／ａ普霄沃氏菌乳杆菌肠巧菌科进行定。量测定结果如下；－１．ＰＣＲＤＧＧＥ指纹图谱显示，腹泻組与健康組相比（，微生物多样性指数健康组３．８７±０．０２、腹泻沮３．８７±０．０１）、丰富度（健康组４８±

5、２．１６、腹湾组４８±２．４５）无显著，７８性差异；健康组与腹泻细在聚类图谱上明湿分为两簇相似性为０．，健康样本间相似性在０．別至０．８６么间，腹復样本间相似性在０．８３至０．９２之间。２．１６ｓｒＲＮＡ髙通量测序结果：所有样品平均每份样品检测到１８９１２１６５２７ｔａｇｓ数，其中健康姐１９１７２＋６８０６和腹泻组巧６５２＋６４６３差异不显著。利巧Ｍｏｔｈｕｒ计算＋在９７％的相似水平上样品的ＯＴＵ数量，健康组ＯＴＵ数量为２５％９７１个，与腹泻组（２３６７＋８２５个）差异不显著。健康成年川金丝猴粪样菌群在口分类水平臥Ｆｉｍ皮ｕｔｅｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｋｌｅｔ

6、ｅｓ为主。腹損组与健康组相比共有５种菌口、７种菌纲、８种菌目、１９种Ｘ－０４菌科、２８种茜属有显著性变化。Ｆｌｅｘｉｓｉａ在属分类水平平均占３．４３１Ｏｐ，总检出〇率９０／〇（健康组１３／１５、腹泻组１４／１５）。１１３．民６３地１１６？（：民结果：健康川金丝猴粪便菌群中细菌总数达５．１４叫〇〇￡１也梭Ｖｘｉｉ菌ｃｌｕｓｔｅｒＸＩａ、梭菌ｄｕｓｔｅｒｌＶ合计数量达２．１１ｌ〇她／ｇ，占细菌总数４１％。腹餐组与健康沮相比，细菌总数、梭菌ｃｌｕｓｔｅｒＩＶ、横菌ｃｌｕｓｔｅｒＸｌＶａ无差异；普氏菌属有，而乳杆菌属显著性降低所降低，但差异不显著；肠杆菌科显著性升高

7、。结论：健康成年川金丝猴粪样菌群数量较多，种类丰富，厚壁菌口和拟杆菌口为主，梭杆菌属较为丰富。腹泻组与健康组相比，粪样菌群总数及多样性上没有显著性变化，，腹泻组相比于健康组相比但在部分菌群沮成上有显著性差异，有益菌（乳一些病原菌费克蓝姆菌属杆菌属）显著性降低，而、丹毒丝菌属、不动杆茜属等定植量盈著性升高，危害川金丝猴胃肠道健康。－关難罔：川金丝猴、粪样菌群、腹湾、ＰＣ民ＤＧＧＥ、１化ｒＲＮＡ高通量