基于越橘转录组测序的pdr转运蛋白基因的发掘及其表达分析

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1、分类号：S663.4单位代码：10193密级：公开学号：2012045硕士学位论文基于越橘转录组测序的PDR转运蛋白基因的发掘及其表达分析GeneDiscoveryandExpressionAnalysisofPDRTransportersBasedonBlueberryTranscriptomeAnalysis作者姓名：刘红弟学位类别：农学硕士专业名称：果树学研究方向：果树遗传育种与生物技术指导教师：张志东教授所在学院：园艺学院年月独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是本人在导师指导下，独立

2、进行研究所取得的成果。尽我所知，除文中特别加以标注和致谢所列内容外，论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得吉林农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文所有内容若有不实之处，本人愿意承担一切相关法律责任和后果。学位论文作者签名：签字日期：年月日关于学位论文使用授权的声明1、本人完全了解吉林农业大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生在校攻读学位期间所完成的论文及相关成

3、果的知识产权属吉林农业大学所有，并同意将本论文的版权授权给吉林农业大学，学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。2、本人（同意/不同意，务必打印后填写）吉林农业大学将本论文版权授权给不同媒体进行电子出版、多媒体出版、网络出版以及其他形式出版（涉密学位论文解密后应遵守此协议）。3、本人声明毕业后若发表在攻读研究生学位期间完成的论文及相关的学术成果，必须以吉林农业大学作为第一署名单位。学位论文作者签名：签字日期：年月日指导教师签名

4、：签字日期：年月日摘要越橘（Vaccinium）是目前广阔开发前景最好的果树树种之一。它不仅具有独特的营养保健功效，还具有治疗及预防癌症等疾病的效果。越橘中富含的花色素苷等大量次生代谢物质在其中发挥着重要作用。植物PDR转运蛋白在次生代谢物质转运与积累过程中扮演重要角色。了解越橘PDR转运蛋白基因对进一步揭示越橘次生代谢物质形成的分子调控机制、植物防御反应机制及培养越橘新品种具有重要意义。但由于越橘生物信息的匮乏，导致无法对越橘中重要次生代谢物质的形成及转运进行深入的研究及探讨。因此，本研究基于越

5、橘转录组测序文库，借助生物信息学方法筛选越橘ABC转运蛋白基因，进而对越橘PDR转运蛋白进行鉴定，并利用实时荧光定量PCR技术对PDR转运蛋白基因在越橘不同器官和组织中的表达量进行实时检测。获得的主要结果如下：1.基于越橘果实转录组测序文库及基本测序数据，初步筛选出越橘ABC转运蛋白基因165个。根据注释将这165个基因中大多数划分为6个亚族，即ABCA亚族（14个）、ABCB亚族（32个）、ABCC亚族（30个）、ABCD亚族（2个）、ABCF亚族（8个）和ABCG亚族（57个）。其余22个基因

6、未找到其所属亚族。2.越橘ABCG亚族是ABC转运蛋白家族中数量最多的亚族，包括30个PDR转运蛋白基因和21个WBC转运蛋白基因。在PDR转运蛋白基因中有21个基因在越橘果皮和果肉两个文库中的表达量存在差异。这21个基因都是在越橘果皮中上调表达的基因，并在越橘转录组测序的COG数据库中找到13个PDR转运蛋白基因被注释为参与防御机制。3.实时荧光定量PCR结果显示，21个PDR转运蛋白基因在越橘的各个器官和组织中都有表达，且表达量具有组织特异性。在21个PDR转运蛋白基因中有16个基因都在越橘根

7、中表达量最高。关键词：越橘，多向耐药性基因，基因发掘，表达分析IAbstractBlueberry(Vacciniumspp.)isoneofthebestdevelopmentprospectsfruitstrees.Itnotonlyhasuniquenutritionalhealthbenefits,butalsohastheeffectoftreatmentandpreventionofcancerandotherdiseases.Abundantsecondarymetabolismpr

8、oductsinblueberry,especiallyanthocyanins,playanimportantroleonthem.PlantPDRtransportersplayanimportantroleinthetransporterandaccumulationprocessofsecondarymetabolites.SolearningPDRtransportergenesofblueberryhasanimportantsignificanceforfuthere