蒙古马肠道细菌多样性的研究

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1、－、－■．．‘．－．＇Ｓ８２１…脚分类巧学校代码ＵＤＣ５９９７２２０１２２０１０１３．学号硕±学位论文蒙古马肠道细菌多样性的研究ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＩｎ化ｓｔｉｎａｌＢａｃｋｒｉａＤｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎＭｏｎｏｌｉａｎＨｏｒｓｅｇ申请人：伊如格勒图学科口类；农学学科专业：动物遗传育种与繁殖研究方向：分子数量遗传与马的育种指导教师：芒来教授－论文提交日期：二〇五年六月内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文

2、是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加Ｗ标注都致谢的地方外，，论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果也不包一括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。一切相关责任申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担。’论文作者签名ｉｔｉ韦：种聲杂ｉ诏日期：八巧内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定，即；研究

3、生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学，且导师为通讯作者，通巧作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文档，允许论文被查阅和借阅。学校可Ｗ公布学位论文的全部或部分内容（保密内容除外），采用影印、缩印或其他手段保存论文。。训论文作者签名：兮１气指导教师签名：炎日親某。巧、＜＇８備要蒙古马是我国著名的地方品种，有着优秀的品种遗传资源。己被录入

4、我国保，抓瞩迅速种名录中，掉願缓慢。这也是蒙。比其它马种蒙古马具有耐粗饲特性古马长期在恶劣环境条件下进化出来的生存能力。蒙古马的麻粗饲特性除了遗传因素，必然与其特殊的肠道微生物区系相关。为了了解其中微生物作用关系，本实验对蒙古马和纯血马肠道细茜多样性初步研究。也为功能细菌的巧掘和利用提供基础。本实验纯血马和不同饲养条件下的蒙古马新鲜粪便为实验样品，用生物试剂盒直接从粪样中提取细菌基因组ＤＮＡ，使用ＰＣＲ技术从细菌总ＤＮＡ中扩增出１６ＳｒＤＮＡＶ３区序列并采用变性梯度凝胶电泳分离不同细菌的基

5、因序列。用如ａｎｔｉ巧化ｅ软件对胶图进行分析，同时切胶回收优势条带进行克隆测序。将得到的测序在基因库数据里进行Ｂｌａｓｔ比对判断菌种属性。实验主要结果ｙ；［下：一第、蒙古马和纯血马肠道细菌群落结构比较中，ＤＧＧ目胶图显示不同位置的条带有巧个。选择４１个优势条带回收测序鉴定中与ＮＣＢＩ数据库细菌１化ｒＤＮＡＶ３区序列相似性９６％Ｗ上的仅有１６个克隆。在蒙古马两种不同饲养条件下的肠，ＤＧ地胶图中显示共有加个条带４０个优势条带道细菌结构变化的研究中，选１回收测序，结果９６％＾上有７个序列相似性１克隆

6、。因此同源性较低。两次实验中分剤未报道的优势细菌占总细菌的约６１％和５８％。第二、利用Ｑｕａｎｔｉ巧化ｅ软件分析出的ＤＧＧＥ图谱识别的条带数目和群落多样性指标来看，纯血马肠道优势菌比蒙古马肠道优势菌更丰富多样。聚类分析结一果蒙古马和纯血马各自聚成支，品种之间肠道优势菌相似性仅为０．３３。品种内相似性都大于品种间相似性。蒙古马７月份草原上放牧时的厮道优势菌比３月份圈养时的肠道优势菌更丰富多样。聚类分析后蒙古马３月份和７月份各自聚成一。支，之间相似性为０．５４蒙古马吃干草情况下的种内相似性大于吃青

7、草时的。第三、蒙古马和纯血马肠道内共有的优势菌有栖瘤胃普雷沃氏菌、溶纤维下酸弧菌、微黄棒状杆茜、黄化瘤胃球菌和枯草芽抱杆菌，Ｗ上菌种中除了枯草芽拖杆茜都具有降解纤维功能。枯草芽拖杆茜是多功能益生菌。蒙古马肠道内特有的优势菌有瘤胃球菌属、解纤维梭菌、化糖梭状芽胞杆苗。其中前两者是较强的纤维降解菌。纯血马肠道内特有的优势菌有巴氏梭状芽胞杆菌、嗜胺梭菌、氧化还原真杆菌、活泼瘤胃球菌、共生梭菌、现酸双歧杆菌、牛链球苗、炭痕芽抱杆菌。蒙古马７月份草原上放牧比３月份圈养条件，肠道内新增优势菌有解纤维醋

8、一弧菌、直肠真杆茜、梭状梭菌、致粪球菌、短真杆菌。相反微黄棒状杆菌和枯草芽拖杆菌在蒙古马放牧吃青草情况下变成不是优势条带。蒙古马两种不同饲养条件下肠道主要纤维菌的种类变化不大。－关键词：１６ＳｒＤＮＡＶ３ＤＧＧＥ；肠道细菌区；ＰＣＲ蒙古马；多样化ＡｎａｌｓｉｓｏｆＩ打１；ｅｓｔｉｎａｌＢａｃ