广东星湖湿地放线菌多样性及其活性研究

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1、缩写词表英文缩写英文名称中文全称DenaturingGradientGelDGGE变性梯度凝胶电泳ElecrophoresisCTABCetyltrimethylAmmoniμmBromide溴化十六烷三甲基铵TrisTrihydroxymethylaminomethane三羟甲基氨基甲烷EDTAEthylenediaminetetra-aceticacid乙二胺四乙酸TAETris-acetateElectrophoresisbufferTris-乙酸电泳缓冲液dNTPsDeoxyribonucleotidetriphosphates脱氧

2、核糖核苷酸PEGPolyethyleneglycol聚乙二醇TETris.Cl-EDTATE缓冲液APSAmmoniumpersulphate过硫酸铵SDSSodiμmdodecylsulfate十二烷基磺酸钠5-Bromo-4-chloro-3-indolyl5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖X-galβ-D-galactopyranoside苷异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖IPTGIsopropylβ-D-Thiogalactoside苷V万方数据目录中文摘要„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„IAbstr

3、act„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„III缩写词表„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„Ⅴ目录„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„Ⅵ文献综述„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„11引言„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„71.1本研究的目的和意义„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„71.2研究内容„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„72材料与方法„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„

4、„„„„92.1实验材料与试剂„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„92.1.1样品采集„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„92.1.2主要试剂及其配制„„„„„„„„„„„„„„„„„„92.1.3主要仪器„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„112.1.4培养基„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„112.1.5活性实验菌株„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„122.1.6指示菌株„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„122.1.7功能基因引物„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„122.2

5、实验方法„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„132.2.1样品理化性质测定„„„„„„„„„„„„„„„„„132.2.2样品DNA提取与纯化„„„„„„„„„„„„„„„„132.2.3PCR扩增„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„132.2.4DGGE分析„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„142.2.5切胶回收及序列分析„„„„„„„„„„„„„„„„„152.2.6克隆„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„162.2.7DGGE图谱的分析及CCA分析„„„„„„„„„„„„172.2.8湿地放

6、线菌分离、保存及初步鉴定„„„„„„„„„„172.2.9基因组DNA提取及16SrRNA基因扩增„„„„„„„172.2.10放线菌系统分类树状图构建„„„„„„„„„„„„„182.2.11放线菌抗菌活性筛选„„„„„„„„„„„„„„„„182.2.12发酵液提取物制备„„„„„„„„„„„„„„„„„192.2.13HPLC分析„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„192.2.14五类活性物质合成基因筛选„„„„„„„„„„„„„19V万方数据3结果与分析„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„203.1样品理化

7、性质„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„203.2放线菌特异性基因扩增„„„„„„„„„„„„„„„„„„213.3样品DGGE图谱分析„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„223.4克隆基因序列多样性及系统发育分析„„„„„„„„„„„223.5底泥放线菌群落多样性分析„„„„„„„„„„„„„„„„253.6放线菌群落结构与环境因子关系分析„„„„„„„„„„„263.7五种培养基分离放线菌的效果„„„„„„„„„„„„„„„273.8湿地放线菌多样性„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„283.9比较免培养与纯培养放线

8、菌的多样性„„„„„„„„„„„„303.10湿地放线菌抗菌活性„„„„„„„„„„„„„„„„„„„303.11发酵产物HPLC分析„„„„„„„„„„„„„„„„„„„„33