基于染色体片段置换系的野生稻粒长QTL qGL12的精细定位

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1、分类号密级.UDC单位代码104355硕士学位论文基于染色体片段置换系的野生稻粒长QTLqGL12的精细定位FineMappingofGrainLengthAssociatedQTL,qGL12inWildRice(OryzasativaL.)UsingaChromosomeSegmentSubstitutionLine研究生姓名.丁膺宾宾指导教师.兰进好副教授授.乔卫华副研究员员学科专业.作物遗传育种种研究方向.水稻粒型QTL定位位中国.青岛二0一八年六月FineMappingofGrainLengthA

2、ssociatedQTL,qGL12inWildRice(OryzasativaL.)UsingaChromosomeSegmentSubstitutionLineThesissubmittedtoQingdaoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeofMasterofAgronomyDingYingbin（DepartmentofAgriculture）Supervisor:Prof.LanJinhaoProf.Qia

3、oWeihuaQingdao.ChinaJune,2018独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得青岛农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间：年月日关于论文使用授权的说明本人完全了解青岛农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留送交论文的复印件

4、和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意青岛农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名：时间：年月日导师签名：时间：年月日青岛农业大学硕士学位论文摘要基于染色体片段置换系的野生稻粒长QTLqGL12的精细定位摘要水稻产量主要由三个因素构成，即水稻的单株穗数、每穗粒数和水稻粒重。粒重指标由粒长、粒宽、长宽比和粒厚来综合评价，这四个性状与千粒重成正相关，因此籽粒形状是水稻首选的育种目标之一

5、。水稻粒长是受多基因控制的数量性状，它不但影响水稻的产量，还影响加工品质与外观品质。对粒长相关数量性状位点（QTL）的鉴定以及新基因的发掘是水稻育种与遗传研究的重要目标。野生稻是水稻品种改良重要的基因资源。但是普通野生稻遗传背景复杂，因此构建合适的遗传作图群体，消除野生稻复杂的遗传背景，是野生稻种质资源研究与利用的关键。本实验室利用已构建的染色体片段置换系(CSSL)群体初步定位到12号染色体的一个与粒长相关的QTLqGL12。本研究在此基础上，选择粒长与受体亲本9311差异显著，且携带qGL12的置换系C

6、SSL141与9311回交构建次级群体进行精细定位。结合测序结果和颖壳的细胞学观察，寻找野生稻中影响粒长的新基因。主要结果如下：1.CSSL141携带4个野生稻导入片段，分别位于2号、12号染色体。多年多点的田间试验检测发现，CSSL141籽粒的粒长、粒宽和千粒重与9311相比有明显的差异，株高、穗长、有效穗数等其他农艺性状与9311相比差异不显著。2.利用构建的CSSL141/9311F2群体将qGL12定位于12号染色体标记RM5479～RM28621之间，影响粒长、粒宽以及粒重。对粒长的LOD值为16

7、.78，贡献率为44.61%；对粒宽的LOD值为3.60，贡献率为11.30%；对粒重的LOD值为7.35，贡献率为24.08%，对粒长的贡献率最高。3.从F2群体中选择目标区间基因型杂合的植株，在三亚种植400株F3群体进行精细定位。通过筛选交换单株，结合交换单株基因型与表型，将qGL12定位到50-kb的区间。为进一步缩短定位区间，从F3群体中选择目标区间基因型杂合的植株，在北京和南京分别种植2400株和1200株F4群体。设计4对区间内多态性分子标记引物，筛选交换单株，结合基因型与表型数据，将qGL1

8、2所在区间缩小到15.69-kb的范围，左右两侧标记分别为DYB9.1和RM28586，在该区间内有3个候选基因，分别为Os12g39650、Os12g39660、Os12g39670。其中Os12g39650编码一种微管蛋白，Os12g39660编码一种质膜钙转运ATP酶，Os12g39670尚未有明确功能，通过测序分析发现，Os12g39650、Os12g39660在编码区内存在变异。1青岛农业大学硕士学位论