新型分子标记trap应用研究进展

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1、万方数据第13巷第4期生命科学研究V01．13No．42009年8月LifeScienceResearchAug．2009·综述·新型分子标记TRAP应用研究进展郭长奎，于静，罗淑萍4(新疆农业大学，中国新疆乌鲁木齐830052)摘要：靶位区域扩增多态性(TargetRegionAmplifiedPolymorphism，TRAP)是基于PCR的新型分子标记，并已广泛应用于动植物的研究中，主要在种质资源的鉴定评价、遗传图谱的构建、绘制基因组转录图谱、重要的性状标记、比较基因组学、亲缘关系和遗传多样性等方面取得了进展．现就TRAP的原理以及在动植

2、物中的应用研究做一综述．关键词：TRAP；种质鉴定：遗传图谱：比较基因组学中图分类号：Q78文献标识码：A文章编号：1007—7847(2009)04—0366．04ExploratoryDevelopmentofaNovelMarkerTRAPGUOChang—kui，YUJing，LUOShu—ping+(XinjiangAgriculturalUniversity，Urumqi830052，xmjiang，China)Abstract：TRAP(TargetRegionAmplifiedPolymorphism)isanovelmarke

3、r，whichhasgenerallybeenappliedinplantandanimal．TRAPmarkerisusedinidentifyinggermplasmresource，constructinggeneticmap，drawingtranscriptionmap，traitmarker，comparativegenomicsandgeneticrelationship．TheprincipleofTRAPandtheexploratorydevelopmentinplantandanimalarediscussed．Keywo

4、rds：TRAP；germplasmidentification；geneticmap；comparativegenomics(t／feScienceResearch，2009，13(4)：366～369)分子标记技术是20世纪80年代发展起来的一类遗传标记技术．至今已经发展了20多种基于DNA多态性的分子标记技术．这些DNA标记技术可综合为4大类：一是以Southern杂交为基础的标记技术，主要是RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)及VNTR(VariableNumberTandemRepea

5、t)；二是以PCR为基础的标记技术，如RAPD(RandomAmplifiedPolymor-phieDNA)、SCAR(SequenceCharacterizedAmpli—fledRegions)、STS(SequenceTaggedSite)、SSR(SimpleSequenceRepeat)、1SSR(Inter—simpleSequenceRepeat)、SRAP(Sequence—relatedAmp·lifiedPolymorphism)、TRAP(TargetRegionAmpli—fledPolymorphism)等；i是酶切

6、和PCR相结合的标记技术，主要有AFLP(AmplifieFragmentLengthPolymorphism)和CAPS(CleavedAmplifiedPolymorphicSequence)；四是其他DNA分子标记，如SNP(SimpleNucleotidePolymorphism)、RIAP(InverseRetrotransposonAmplifiedPolymor-phism)、RBIP(Retrotransposon—basedInsertionPolymorphism)[‘等．目前分子标记主要应用于构建分子标记图谱、比较基因组、

7、主效基因定位和全基因组QTL分析、图位克隆、分子标记辅助选择、DNA指纹分析、杂种优势遗传成因分析、资源评估和物种进化等领域‘2J．靶位区域扩增多态性(TRAP)是一种新型的基于PCR的分子标记，由美围农业部北方作物科学实验窒Hu与Vick于2003年提出L3j．本文就新型的分子标记TRAP的原理和在动植物中的应用研究进行综述．1TRAP原理与优势1．1TRAP的原理2003年美国农业部北方作物科学实验室Hu与Vick提出一种新型的基于PCR分子标记靶位区域扩增多态性TRAP．与SRAP、RAPD和收稿日期：2008—12．23；修回日期：20

8、09．05．27基金项目：旧家自然科学基金资助项目(30760205)；国家科技支撑项日资助(2007BAD36801)作者简介：郭长奎(1981一)