尿道下裂的分子病因学研究

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1、上海交通大学硕士学位论文尿道下裂的分子病因学研究作者姓名：钱晨导师姓名：耿红全副主任医师学科专业：儿科学学号：1107229373研究方向：儿童泌尿外科学申请学位：医学硕士培养单位：上海交通大学医学院附属新华医院二零一三年四月I万方数据DissertationSubmittedtoShanghaiJiaoTongUniversityfortheDegreeofMasterThemolecularetiologyresearchofhypospadiasCandidate:ChenQianStudentID：1107229373Superviso

2、r：Prof.HongquanGengSpeciality：PediatricResearchOrientation：PediatricUrologyAcademicDegreeAppliedfor：MasterofMedicineDateofDefence：April,2013Affiliation：SchoolofMedicineII万方数据上海交通大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对

3、本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：2012年05月09日III万方数据上海交通大学学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权上海交通大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密。（请在以上方框内打“√”）学

4、位论文作者签名：指导教师签名：日期：2012年05月09日日期：2012年05月10日IV万方数据上海交通大学硕士学位论文尿道下裂的分子病因学研究目的：利用全外显子测序技术结合尿道下裂家系，寻找尿道下裂新的可疑易感基因，分析可疑易感基因的相关功能和作用途径，得到优选新致病基因,为后续开展新致病基因的生物信息学和功能小鼠模型研究提供依据，从而进一步阐明尿道下裂的分子发病机制。方法：本课题组收集了一个珍贵的尿道下裂家系，对家系中所有患者利用PCR、毛细管电泳技术进行已报道易感基因的筛查，排除已知易感基因在该家系中的影响。在此研究结果上，利用全外显子

5、测序技术对该家系开展研究，将得到的外显子数据结合大量公共数据库提供的外显子数据开展分析，解释研究结果，发现可疑新致病基因。同时将可疑新致病的突变位点在家系正常男性中进行筛查，排除非致病基因突变后，得到优选新致病基因，收集、分析高度可疑新致病基因的功能后得到优选新致病基因。结果：本课题组排除了已报道易感基因对该尿道下裂家系样本的影响，后对该家系中3名患者开展全外显子测序，将获得的数据利用公共数据库提供的外显子数据进行比对和分析，找出3位患者共有的异常位点，发现了分布于17个不同基因的12个位点插入/缺失和7个位点改变，将这些异常位点在家系正常男性

6、中进行筛查，共得到分布于6个可疑致病基因的6个位点改变，收集、分析可疑新致病基因的功能，在这些可疑V万方数据上海交通大学硕士学位论文基因中包含着一些值得深入研究的基因，SRA1基因与性激素受体信号通路有关，NOTCH2NL基因可能介导多种细胞的细胞间的相互作用。结论：本课题组的研究通过全外显子测序技术在尿道下裂家系中发现的可疑基因符合我们初期对可疑基因数目的估计，其中包含着一些涉及性激素受体信号通路和多种细胞间相互作用的值得深入研究的基因。全外显子测序技术给家系研究提供了新的思路，使得发现明确致病基因的过程更加简便、经济、高效。关键词：尿道下裂

7、家系研究全外显子测序分子病因VI万方数据上海交通大学硕士学位论文ThemolecularetiologyresearchofhypospadiasABSTRACTObjective：Tofindoutnewsuspicionscausativegeneswithhypospadiaspedigreestudy;thentoscreenoutpreferredcandidategeneswithfunctionsofthesegenes.Ourresearchabovewillhelpustofurtherfindoutthemoleculare

8、tiologyofhypospadias.Methods:Wehavecollectedprecioushypospadiasresources-on