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《真菌dna条形码研究进展_张宇》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、菌物学报jwxt@im.ac.cn15November2012,31(6):809-820Http://journals.im.ac.cnMycosystemaISSN1672-6472CN11-5180/Q©2012IMCAS,allrightsreserved.真菌DNA条形码研究进展1,22*张宇郭良栋1齐齐哈尔大学生命科学与工程学院黑龙江齐齐哈尔1610062中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101摘要:DNA条形码(DNAbarcode)是通过一段短的标准DNA片段实现物种的快速、准确和标准化鉴定。线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因作为动物的DNA
2、条形码已广泛应用于物种鉴定中,在植物上已选定叶绿体rbcL和matK基因作为基本的DNA条形码。目前世界各国真菌学家正对不同的真菌类群进行不同基因片段的筛选与评价,并在第四届国际生命条形码大会上正式推荐了ITS作为真菌的首选DNA条形码。对国内外真菌DNA条形码的研究进展进行总结与分析,并展望真菌DNA条形码的应用前景。关键词:真菌鉴定,DNA条形码,基因,评价,ITSProgressoffungalDNAbarcode1,22*ZHANGYuGUOLiang-Dong1CollegeofLifeScienceandEngineering,QiqiharUniversity,Qiqi
3、har,Heilongjiang161006,China2StateKeyLaboratoryofMycology,InstituteofMicrobiology,ChineseAcademyofSciences,Beijing100101,ChinaAbstract:DNAbarcodeusesashortgenesequencetakenfromstandardizedportionsofthegenometoidentifyspecies.CytochromeoxidaseI(COI),asananimalDNAbarcode,hasbeensuccessfullyemploy
4、edinthespeciesidentification.InplantsacombinationofchloroplastrbcLandmatKgeneshasbeenacceptedasbasicDNAbarcode.Infungimoregeneshavebeingscreenedandevaluatedinallmajorlineagesoffungibymycologistsallovertheworld.Recently,theinternaltranscribedspacer(ITS)hasbeenrecommendedasprimaryDNAbarcodeoffung
5、iintheFourthInternationalBarcodeofLifeConference.ThisreviewsummarizedtherecentprogressoffungalDNAbarcode,andpointedouttheprospectofDNAbarcodeinfuturefungalstudies.Keywords:fungalidentification,DNAbarcode,gene,evaluation,ITS基金项目:中国科学院重要方向性项目(No.KSCX2-YW-G-068);国家自然科学基金(No.30930005)*Corresponding
6、author.E-mail:guold@im.ac.cn收稿日期:2011-11-25,接受日期:2011-12-20810ISSN1672-6472CN11-5180/QMycosystemaNovember15,2012Vol.31No.6DNA条形码(DNAbarcode)概念是由加DNA条形码技术在动物分类研究中所采拿大动物分类学家Hebertetal.(2003)首次提用的标准片段是COI基因的一段长约600bp的出,即利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基IDNA序列(Hebertetal.2003)。在该片段中,(COI)基因(约600bp)碱基序列作为物种的物种之间的变异要远
7、大于物种内不同个体之间标记,对动物物种进行快速鉴定,实现物种名的差异。目前DNA条形码技术已经成功应用到称和生物实体之间的一一对应。DNA条形码概不同动物类群的物种鉴定中(Chase&Fay念一经提出,立即引起了全球生物多样性及相2009),如鸟类(Hebertetal.2004)、鱼类(Ward关领域科学家的关注与响应,国际科学界随即etal.2005)、节肢动物(Hajibabaeietal.2006)开展了大量的研究和组织工作,使DNA条形码和软体动