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1、微生物学通报Aug.20,2013,40(8):14681477MicrobiologyChina©2013byInstituteofMicrobiology,CAStongbao@im.ac.cn专论与综述真菌DNA条形码技术研究进展*周均亮赵瑞琳(西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南省森林保护重点学科云南昆明650224)摘要:DNA条形码(DNAbarcoding)技术作为一门新兴的物种鉴定方法以其灵敏、精确、方便和客观的优势,在动植物和微生物的分类鉴定中已经得到广泛应用。真菌鉴定中常用作标准条形码的是核核糖体DNA内转录间隔区(Interna
2、ltranscribedspacer,ITS),如今也有一些新型条形码被发现和应用到实际操作中,如微条形码、ND6、EF3。本文对DNA条形码技术的产生和发展做出了总结,通过研究其在真菌中应用的实际案例分析了DNA条形码技术的优缺点及发展趋势,并指出DNA条形码技术将以全新的视角来弥补传统分类学的不足,最终实现生物自身的序列变异信息与现有形态分类学的结合。关键词:真菌,DNA条形码技术,COⅠ,ITSAdvancesonDNAbarcodinginfungi*ZHOUJun-LiangZHAORui-Lin(KeyLaboratoryofForestDisasterWar
3、ningandControlinYunnanProvince,KeySubjectofForestryProtectioninYunnanProvince,CollegeofForestry,SouthwestForestryUniversity,Kunming,Yunnan650224,China)Abstract:Asanemergingorganismidentificationmethod,DNAbarcodinghasbeenwidelyusedinplants,animalsandmicroorganismsforitsadvantageofhighersen
4、sitivity,accuracy,andobjectivity.Eventhenuclearribosomalinternaltranscribedspacer(ITS)isusedasastandardbarcodeinfungalidentificationfrequently,nowadays,therearemoreandmorenew基金项目：国家自然科学基金青年项目(No.31000013);中科院“西部之光”人才培养计划项目;云南省中青年科学技术带头人后备人才培养项目*通讯作者：Tel:86-871-3863145;:zhaoruilin@gmail.co
5、m收稿日期：2012-10-17;接受日期：2012-12-10周均亮等:真菌DNA条形码技术研究进展1469barcodes,suchasthemicrocoding,ND6andEF3.InthisarticlewesummarizedthegenerationanddevelopinghistoryofDNAbarcoding,alsowepresenttheadvantage,shortcomingsandthedevelopmenttrendbasedonfungalbarcodingcasestudies.WeindicatedthatDNAbar-codin
6、gtechniquewillbeagoodsupplementarytothetraditionalmorphology-basedtaxonomy,andtowardsacombinationofnaturalevolutionalrelationshipsandmorphologicaltaxonomyinfungi.Keywords:Fungi,DNAbarcoding,COⅠ,ITS[3]1735−1753年,瑞典植物学家林奈陆续出版业人士应用。通过该技术,我们可以将一些不了《自然体系》、《植物种志》等著作,建立了宜用形态鉴定方法做出结论的生物在任一发育[4]以生
7、殖器官为分类依据的分类法,由此创立了阶段做出准确的鉴定。“双名法”,开创了人类对生物系统命名的先河。1.1DNA条形码技术的产生及发展[5]此后的二百五十多年中,真菌学家利用以形态比1993年,Arnot等根据数字条形码在商品中较学为基础的经典分类学方法,发现并描述了大的应用最先提出了DNA条形码的概念,但是这篇量新物种。但随着人们对更加精确和客观分类研文章在当时并未引起人们过多的关注。2002年,[6]究结果的要求增强,传统的形态分类方法因为所Tautz等提出以DNA序列为基础建立物种识别需时间较长、精确度相对较差、依赖于繁
