DNA条形码技术研究进展及其在植物检疫中的应用展望.pdf

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1、·······专题·DNA条形码技术研究进展及其在····综述····植物检疫中的应用展望张裕君,刘跃庭,廖芳,郭京泽(天津出入境检验检疫局,天津300461)摘要:DNA条形码是一种新的生物分类学方法,它通过特有的一段DNA序列来识别每种生物。与传统鉴定技术相比,利用该技术进行生物物种鉴定具有快速、准确、简便、易行等优点。该技术在出入境植物检疫中将得到广泛应用。关键词:DNA条形码;线粒体细胞色素氧化酶I亚基;内转录间隔区;植物检疫中图分类号:Q19;S41文献标识码:A文章编号:1672-6820(2010)04-0015-03Researchprogress

2、ofDNAbarcodetechnologyandprospectofitsapplicationinplantquarantineZHANGYu-jun,LIUYue-ting,LIAOFang,GUOJing-ze(Entry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Tianjin300461,China)Abstract:DNAbarcode,anewbiologicalclassificationmethod,isusedtoidentifyeachorganismbasedonitsspecificDNAsequences.C

3、omparingwithtraditionalidentificationmethod,thetechnologywillbewidelyappliedinfieldofentry-exitinspectionandquarantineduetoitscharacteristicsofquickness,preciseandeasy-operation.Keywords:DNAbarcode;COI;ITS;plantquarantine大部分生物学家认为地球上的物种有1500万为DNA条形码之父。生物条形编码协会于2004年种左右。自林奈创立双命名法以来,超过1

4、70万种生成立,目前会员超过50个国家的200个以上组织。物已经被分类及命名。按照目前常规的分类方法,要该协会的最终目标是建立标识地球上每1个物种的[4]完成地球上所有生物的鉴定工作,可能在以后的几唯一的DNA条形码。2007年5月10日,世界上第[1]百年内都无法完成。随着分子生物学和生物信息1个DNAbarcoding鉴定中心在加拿大Universityof学的飞速发展,DNA条形码技术成了生物分类学中Guelph成立,从而大大推动了DNA条形码技术的新的研究热点。所谓DNA条形码是通过一段DNA研究及应用。序列来识别某一生物物种。这一概念认为像在超市1DNA

5、条形码原理里用扫描仪读取条形码一样,通过快速分析DNA中DNA是生物的遗传信息载体。遗传基础的不的一小段可识别地球上的每种植物或动物。生物分同,决定了生物的多样性。由于每种生物物种的类是人类认识自然的第1步。正确地识别和区分物DNA序列都是唯一的,就给DNA条形码提供了物种对于生产、科研具有十分重要的意义。因此,生物质基础,每个位点上都有A、T、G、C4种选择,理论[2]的分类鉴定是一项十分重要的工作。Tautz于2002上讲,45个碱基长度的DNA序列通过不同排列组年首先提出以DNA序列信息作为分类学系统的平合就可以获得10亿种可选择的编码。但是,由于部[3]台

6、。Hebert于2003年提出用线粒体细胞色素C氧分碱基的保守性,几十个碱基的长度不能提供足够化酶亚基I这一特定基因的片段作为DNA条形码的编码信息,而现代分子生物学的发展,扩增几百个的基础,给所有生物进行编码,因此Hebert也被称碱基长度的序列已经很容易了。所以,目前的DNA收稿日期:2010-02-03;修回日期:2010-03-26作者简介:张裕君(1977-),男,江苏宜兴人,博士。E-mail:zhangyj1@tjciq.gov.cn。·15·条形码分析都是基于几百个碱基长度的DNA序列。果山姜。中国医学科学院药用植物研究所和香港大2DNA条形码技术

7、研究进展学联合开展应用DNA条形码技术对贝母属中药进[12]Hebert等选取COI(线粒体细胞色素氧化酶I亚行鉴定,相关研究正在进行之中。基,下同)基因的一段序列对动物中的7个门8个目作为真菌的DNA条形码的潜在对象有核糖体[13]的不同种群及鳞翅目昆虫的200个种进行种类鉴基因间隔序列(ITS)。Kroon等比较了48种疫霉属定,发现COI不但能区分门、目,甚至可以区分近缘真菌细胞色素氧化酶亚基I(CoxI)、细胞色素氧化酶[5]种,并且准确率达99.9999%。Hebert等对北美洲亚基II(CoxII)、翻译延伸因子(EF-1α)、β微管蛋白260种鸟类进

8、行DNA条

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