应用selex技术体外筛选prrsv核衣壳蛋白的dna适配子

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1、华中农业大学硕士学位论文应用SELEX技术体外筛选PRRSV核衣壳蛋白的DNA适配子InVitroSelectionofDNAAptamerstoPRRSVNucleocapsidProteinbySELEX硕士研究生:李枫学号:2010302110171指导教师:方六荣教授指导小组:方六荣教授肖少波教授江云波副教授罗锐副教授专业:预防兽医学研究方向:动物病毒学获得学位名称:农学硕士获得学位时间:2013年6月华中农业大学动物科技学院动物医学院二O一三年六月lIIIIIIIIIIIIIIfIIlY2394081蘩巾袭鬣震擎掌髓懑塞獠剩浚黟甥

2、灏镶绷鬟穰◇篓篓篓主l覆

3、翔簿缣簿,熬渗辫麟穗嚣壤鬻;9移l矧瓣鼢鞲’瓣蹶嘲9雒猿辅馕鬻攀豢轰雾鹾搿鬃黧魏纛囊薰巍夸焱霪鬻舞辫黪葶纛籍鳞磷巍麓箨筑馥襻耪鳜筏蕊繁。黪髭鬻黪。簿?震势褥熬麓貔黪缝辫纛鬻耱獯霪辩,褥囊誓攀彀辔羹魏犬悉缝黧漾纛豢攀浚瓣矮黧痣鬈。穗零穗务纛蕤簿黪彰羲囊震謦纛羹魏慧冀爨懿黪攀缀鬟蘧黪黎襞嚣穗熟鞣黪。瓣簿熬黪瓣魏罐麓墨攀鬟。簿纛t一鬻豢霉稳饕戆黪缀骥黧藕簸戆黪魏鬟糕壤貔鬟褥蕊穆赣善睡舔魏魏矮,黪纛蒸霉瓣褰。璜囊簿,鬟瀵:《机礤{越秘:洲i每雾糍露辇黎德谂变壤瓣嫒援攀黎天溅毫攀鬃攀褰豢纛轰攀鬟掌攥黪。魏趱攀撵穗囊鹳瓣震,鬻

4、攀熬罐缓羧嚣攀犍蘩漾蕤瓷掌缝谶凌冁鬻骥露势舷挚鹱攀;譬嫒赣缎蒜瓣鬟囊渗囊魏箨骥鹱鹈壤謦罐,豢爨糕蘩黎撩黎势麓篱黎参,霉瓣滚簿彰擎。镶鹭嫒黪黛篱囊稠挚覆撩黪。裁蠢警缀羲囊。壤舂瓣蒸寮誓黎潦蹩譬霉缮凄誉瓣霪纛纛攀瓣瓣壤纛纛蘩。簧纛攀臻缱麓戆豢聱纛蘩黪翔器,霪囊魏赣黪参雾麓蒸黪黧謦纛糗熬势壤壤囊虢蕤穗黪囊壤壤雾*鬻瓣露天蕊攀囊篱簸簇稼纛豢谶鬟镌彀蠹;蘸:爨瓣零穰镳黧《攀渗豢羲纛鬟寮。蕤囊黎赣疯擎德鑫穆零灏羲豢黛蔫囊鬓鬻臻穗鬟》凌豢罄媾壤嬲誓番覆辍豢,雾鼗瓷黧雾瀵鏊壤:篱孝乱壹隧。登囊i鎏蒯,夔量型趣一,+渗;瓣壤攀纛囊瓣麓箨攫攀黪瓣鬻熬鬻蘩豢豢兹

5、l‰_渗1嚣蒸赣鍪囊i鍪矍照。整⋯《叠.堡篓一一⋯一⋯鬟黪疆辘邃熬应用SELEx技术体外筛选PRRSv核衣壳蛋白的DNA适配子目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯iAbstract................................⋯......⋯⋯...........................⋯..........⋯.................⋯....⋯.⋯......iii缩略语表(ABBREⅥATl0N)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯V第一章文献综述⋯⋯⋯

6、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11.1PRRSV目前研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一11.2SELEX技术和适配子⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21.2.1SELEX基本原理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.31.2.2初始随机核苷酸文库⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一41.2.3靶物质⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一61.2.4筛选过程⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一71.2.5次级文库生成⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

7、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..81.2.6克隆和序列分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一81.2.7特异性和亲和性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..91.2.8适配子修饰⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一91.2.9SELEX技术和适配子的优缺点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯101.2.10适配子应用及前景⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..1l第二章研究目的和意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..14第三章材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..15

8、3.1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..153j1.1载体与质粒⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯153.1.2工具酶与主要试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯163.1.3主要缓冲液与相关试剂及其配制⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯163.2实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一193.2.1PRRSV核衣壳蛋白的表达与纯化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..193.2.2初始随机文库的构建及引物合成⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l93.2.3初始文库通过PCR扩

9、增成双链库⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.203.2.4琼脂糖凝胶电泳⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯203.2.5双链文库的回收⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

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