ASIP与MC1R基因多态性与山羊毛色相关研究

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1、分类号密级UDC单位代码10435硕士专业学位论文ASIP与MC1R基因多态性与山羊毛色相关研究CorrelationbetweenASIPandMC1RgenePolymorphismsandgoatwoolcolor研究生姓名张连凯指导教师柳楠教授贺建宁讲师第二导师程明高级畜牧师学位种类农业硕士专业领域养殖2018年6月QingdaoAgriculturalUniversityTheThesisofProfessionalMasterCorrelationbetweenASIPandMC1Rg

2、enepolymorphismsandgoatwoolcolorGraduatewithProfessionalMasterDegree:ZhangLiankaiMentor:Prof.LiuNanPhD.HeJianningSecondMentor:ChengMingTypeofProfessionalDegree:MasterofAgriculturalAcademicfield:Cultivation独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,

3、除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得青岛农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间:年月日关于论文使用授权的说明本人完全了解青岛农业大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意青岛农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位

4、论文的全部或部分内容。研究生签名:时间:年月日导师签名:时间:年月日青岛农业大学硕士专业学位论文摘要ASIP与MC1R基因多态性与山羊毛色相关研究摘要为探讨ASIP、MC1R基因与山羊毛色的关系,本试验对ASIP和MC1R基因的CDS区进行测序鉴定,采用PCR-SSCP的方法分析两个基因在不同毛色的牙山黑绒山羊、内蒙古白绒山羊、济宁青山羊的序列多态性,并统计分析各位点与山羊毛色的关系。结果表明:(1)引物扩增片段ASIP-2在(g.146bp-150bp)处存在5碱基(g.TGAGG)缺失,氨基酸

5、发生移码突变。BB突变纯合型在牙山黑绒山羊和济宁青山羊中是优势基因型,AA野生纯合型在内蒙古白绒山羊中是优势基因型。牙山黑绒山羊B的基因频率较大,为优势等位基因,内蒙古白绒山羊A的基因频率较大,为优势等位基因。引物扩增片段ASIP-3在(g.194bp)存在碱基突变C→A(C194A),导致原有氨基酸苏氨酸变为天冬酰胺。AC杂合型在内蒙古白绒山羊中是优势基因型,CC野生纯合型在济宁青山羊中是优势基因型。牙山黑绒山羊和济宁青山羊C的基因频率较大,为优势等位基因,内蒙古白绒山羊不存在优势等位基因。卡方

6、检测结果表明:ASIP基因在(g.146bp-150bp)处的5碱基丢失(g.TGAGG)与山羊毛色极显著相关(P<0.01)。ASIP基因的C194A突变与山羊毛色显著相关(P<0.05)。(2)引物扩增片段MC1R-1A在(g.124bp)存在碱基突变G→C(G124C),导致原有氨基酸天冬酰胺变为组氨酸。三种不同毛色山羊的AB杂合型为优势基因型;GG野生纯合型在牙山黑绒山羊中较少;CC突变纯合型在济宁青山羊中较少。内蒙古白绒山羊G的基因频率较大,为优势等位基因,牙山黑绒山羊和内蒙古白绒山羊不

7、存在优势等位基因。引物扩增片段MC1R-1B在(g.436bp)存在碱基突变A→G(A436G),导致原有氨基酸异亮氨酸变为缬氨酸。内蒙古白绒山羊中只存在GG突变纯合型;AG杂合型在牙山黑绒山羊中是优势基因型。内蒙古白绒山羊G的基因频率是1,为优势等位基因。卡方检测结果表明:MC1R基因的G124C突变与山羊毛色不相关(P>0.05),MC1R基因的A436G突变与山羊毛色极显著相关(P<0.01)。综上所述,ASIP和MC1R基因可能是影响山羊毛色的候选基因,且ASIP基因CDS区的(g.146

8、bp-150bp)处的5碱基(g.TGAGG)缺失和C194A突变位点可能是山羊毛色候选基因的分子标记;MC1R基因CDS区的A436G突变位点可能是山羊毛色候选基因的分子标记。关键词:山羊;ASIP;MC1R;SNPS;毛色;PCR-SSCP青岛农业大学硕士专业学位论文AbstractCorrelationbetweenASIPandMC1RgenepolymorphismsandgoatwoolcolorAbstractToinvestigatetherelationshipb

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