肌脂蛋白单体和多聚体氯离子通透性的分子模拟研究

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1、万方数据中图分类号：UDC：学校代码：10055密级：公开蛊越犬港硕士学位论文肌脂蛋白单体和多聚体氯离子通透性的分子模拟研究TheMolecularSimulationStudyoftheChlorideAnionPermeabilityfortheSarcolipinMonomerAndPolymer论文作者萱二蹬指导教师昱雪副塾拯申请学位理堂亟±培养单位物理科堂堂院学科专业趟鐾查研究方向生金信：垦堑堡堂．答辩委员会主席奎刖勇评阅人奎刖勇王堑主南开大学研究生院二。一四年五月万方数据IlllllllllllllllllHUllllllllqlllllll南开大学学位论文使用

2、授权书Y2700．019根据‘南开大学关于研究生学位论文收藏和利用管理办法》，我校的博士、硕士学位获得者均须向南开大学提交本人的学位论文纸质本及相应电子版。本人完全了解南开大学有关研究生学位论文收藏和利用的管理规定。南开大学拥有在《著作权法》规定范围内的学位论文使用权，即：(1)学位获得者必须按规定提交学位论文(包括纸质印刷本及电子版)，学校可以采用影印、缩印或其他复制手段保存研究生学位论文，并编入《南开大学博硕士学位论文全文数据库》；(2)为教学和科研目的，学校可以将公开的学位论文作为资料在图书馆等场所提供校内师生阅读，在校园网上提供论文目录检索、文摘以及论文全文浏览、下

3、载等免费信息服务；(3)根据教育部有关规定，南开大学向教育部指定单位提交公开的学位论文；(4)学位论文作者授权学校向中国科技信息研究所及其万方数据电子出版社和中国学术期刊(光盘)电子出版社提交规定范围的学位论文及其电子版并收入相应学位论文数据库，通过其相关网站对外进行信息服务。同时本人保留在其他媒体发表论文的权利。非公开学位论文，保密期限内不向外提交和提供服务，解密后提交和服务同公开论文。论文电子版提交至校图书馆网站：http：／／202．113．20．161：8001／index．htm。本人承诺：本人的学位论文是在南开大学学习期间创作完成的作品，并已通过论文答辩；提交的

4、学位论文电子版与纸质本论文的内容一致，如因不同造成不良后果由本人自负。本人同意遵守上述规定。本授权书签署一式两份，由研究生院和图书馆留存。作者暨授权人签字：堕二照2014年6月4日南开大学研究生学位论文作者信息论文题目肌脂蛋白单体和多聚体氯离子通透性的分子模拟研究姓名曹一鹏学号2120110166答辩日期2014年5月27日论文类别博士口学历硕士■硕士专业学位口高校教师口同等学力硕士口院／系，所物理学院专业凝聚态联系电话23501491EmailVgsplayerl@163．corn通信地址(邮编)：天津南开大学物理学院300000备注：是否批准为非公开论文否注：本授权书适

5、用我校授予的所有博士、硕士的学位论文。由作者填写(一式两份)签宇后交校图书馆，非公开学位论文须附《南开大学研究生申请非公开学位论文审批表》。万方数据南开大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师指导下进行研究工作所取得的研究成果。除文中已经注明引用的内容外，本学位论文的研究成果不包含任何他人创作的、已公开发表或者没有公开发表的作品的内容。对本论文所涉及的研究工作做出贡献的其他个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本学位论文原创性声明的法律责任由本人承担。学位论文作者签名：萱二鸱2014年5月27日非公开学位论文标注说明(本页表中填写内容须打印)根据南

6、开大学有关规定，非公开学位论文须经指导教师同意、作者本人申请和相关部门批准方能标注。未经批准的均为公开学位论文，公开学位论文本说明为空白。论文题目申请密级口限制(≤2年)口秘密(≤10年)口机密(≤20年)保密期限20年月日至20年月日审批表编号批准日期20年月日南开大学学位评定委员会办公室盖章(有效)万方数据注：限制★2年(可少于2年)：秘密★10年(可少于10年)：机密★20年(可少于20年)万方数据摘要Sarcolipin(SLN)是一种位于肌浆网中的小分子膜蛋白，它可以与肌浆网钙泵(SERCA)结合并调节其活性。同时，SLN本身可以在肌浆网膜中自组装形成五聚体并实现

7、一定的功能。有研究认为SLN的五聚体具有离子通道的作用。本文通过分子动力学模拟的方法探索了SLN在肌浆网膜中对氯离子的通透作用。首先基于PLB的三维结构，通过同源建模的方法建立了嵌入肌浆网膜中的单体和五聚体SLN的三维结构，随后各对两种结构进行了15ns的分子动力学模拟来优化模型结构。本文通过平均力势和加权直方图的方法分别计算了氯离子通过在膜上的SLN单体以及SLN五聚体自由能的变化，讨论了SLN单体和五聚体在肌浆网膜上的Cl一通透性的问题。模拟研究发现，当cl一通过单体SLN在膜形成的孔道时，需要克服约130kJ