生物信息学93709new

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1、附录常用基本词汇表ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWA英文名词中文名词解释A（Adenine）腺嘌呤作为碱基的两种嘌呤中的一种。activesite活化位点蛋白质三维表面催化作用发生的区域。为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差异而alignment比对进行的配对称为比对。alignmentof比对的比对即比对的对象不是简单的序列，而是序列的比对。alignmentsalleles等位基因一个基因的不同版本。alphacarbonα碳在氨基酸中与侧链（R-基团）相连的中心碳原子。alternative从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA分可变剪接splicin

2、g子的过程。aminoterminus在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，对应于基氨基端（N端）(N-terminal)因的5'-端。表示相反的方向；在双链DNA中，这意味着如果一anti-parallel反向平行条链是5'到3'的，则其互补链方向是3'到5'的。B（1）在双链DNA中嘌呤和嘧啶之间的相互作用（特basepair碱基对别指A和T之间，G和C之间）；（2）双链DNA序列长度的基本单位。在反向平行的β折叠片中，当β链反转方向的时候蛋betaturnsβ转角白质内部形成的U型结构应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和Bioinformatics生物信息学利用生物分子

3、数据。本书中特指用计算机技术分析和处理生物分子数Biocomputing生物计算据。BasicLocal基本的局部比对AlignmentSearch一种常用的序列数据库搜索工具。搜索工具（Blast）Tool(Blast)将分子（通常是核酸分子）从凝胶转移到膜上，接blottingand印迹和杂交着用绑定有特定感兴趣的分子的标记探针进行洗脱hybridization的过程。bootstraptest自举检验对置信程度进行量化的检验。branchand一种空间搜索方法，通过约束条件减少搜索空间，分支约束法boundmethod提高搜索效率。branches分支在系统发生树中，通过分支

4、连接两个节点。CC(Cytosine)胞嘧啶作为碱基的两种嘧啶中的一种。大多数真核启动子具有的一段短序列，其片段模式CAATboxCAAT盒为C-A-A-T，通常出现在转录起始位点上游80个核苷酸的地方。许多因子可以与CAAT盒结合。在多肽链中，含有羧酸基团(—COOH)的分子端，carboxyterminus羧基端对应于基因的3'-端。cDNAcDNA(互补（Complementary通过逆转录酶从RNA模板合成的DNA。DNA)DNA）从mRNA序列中产生的所有DNA序列的集合。cDNAlibrarycDNA文库这种类型的文库只包含编码蛋白质的DNA（基因）。从基因的核酸序列中

5、提取信息并以此合成蛋白质的centraldogma中心法则过程（DNA?RNA?protein）。character特征在系统发生树中，具有有限状态数的特征。chargedamino带电氨基酸在一定的生物pH值下，带有正电或负电的氨基酸。acid在真核生物细胞核内部由大量DNA以及与此相关chromatin染色质的组蛋白组成的近似均匀混合物。在原核生物，包含一个细胞基因组的DNA分子称为chromosome染色体染色体。在真核生物中，与蛋白质复合在一起、包含大量遗传信息的线型DNA分子。clone克隆无性繁殖，如生物体克隆、基因克隆等。在类染色体载体中插入特定的DNA一段，使得它c

6、loning克隆们可以在活细胞中得以保存并复制。Codingsequence编码序列DNA序列中为蛋白质编码的部分。基因编码部分的三核苷酸组合，对应于一个特定的Codon密码子氨基酸。（1）通过氢键连接的核苷酸对（G和C;A和T;Complementary互补的A和U）；（2）核苷酸链的反向平行对。Computational主要研究分子生物学数据的分析方法，开发分析工Molecular计算分子生物学具。Biologyconformation构象蛋白质的空间构象。consensus在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的一致序列sequence核苷酸或氨基酸组成的序列conser

7、ved在进化过程中基本保持不变的核酸与蛋白质序列，保守序列sequence它们往往与特定的功能相对应。Contig连续交叠群基因组测序过程中将许多短的序列片段链接成很长的连续片段。指相似基因型或表型性状的独立进化。例如，眼convergent趋同进化睛在各种生物体（如哺乳动物、软体动物以及昆evolution虫）中独立进化，结构各异。corefold核心折叠构成蛋白质空间形状的基本模式。在哺乳类动物基因组中的一个500bp到3000bp的区域，该区域中的二核苷酸CpG