我国生物信息学研究现状与展望

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1、中国科技信息2006年第8期CHINASCIENCEANDTECHNOLOGYINFORMATIONApr.2006健康与生物医药我国生物信息学研究现状与展望程现昆大连医科大学社会与管理科学学院116027TheOutlookofBioinformaticsDevelopmentCHENGXian-kunSchoolofSociety&AdministrationSciences,DalianMedicalUniversity116027摘要（Bioinformatics）这一称谓。然而，那究和开发新的治疗性药物，将是21世纪对于复杂的生命系统，生物信息学以一种综时

2、人们对生物信息学的认识只是特殊含义生物医药发展的总的趋势。传统的药物合、全面、系统的观点来研究生命现象及上的片面的生物信息学，随着测序技术研究，从发现新药到该药物的临床应其规律，打破了以往的研究模式，即将成的日臻完善和现代科学技术革命中信息革用，大约需要10年左右的时间，其研发为生命科学研究的强有力的工具。随着生物命以及计算机产业的蓬勃发展，生物信费用更是高达几亿甚至十几亿美元。生信息学的出现及其研究的发展，生命科学研息学在1995年经历了里程碑式的发展。物信息学应用基因序列比对、蛋白质结究的思维方式也将出现彻底的变革。那一年，第一个细菌的全基因组序列—构预测等方法

3、对获得的这些基因和蛋白质关键词—流感嗜血杆菌全基因组测定研究成果在的数据进行分析和计算，从中发现能够生物信息学；基因组学；人类基因组计划《科学》发表，人类第一次有了一个物与药物相结合的关键的蛋白质结构或功能AbstractIncomplexlifesystem，Bioinformaticsisatechnology种完整的全基因组信息，生物信息学从性基因，即药物的作用靶点，到目前为ofstudyingbiologicalphenomenonanditsregulations此开始进入了名副其实的发展时期。止，根据人类基因组研究结果预测的药withsynthesis,

4、completeness,system．Itbreaks一、生物信息学的研究内容物靶标可达5000-10000个。在此基础downtheusualresearchmodelandwillsoonbecome生物信息学是伴随着基因组研究而发上，药物研发人员一方面可以利用计算apowerfulresearchtoolinlifescience．Withthe展的。它以人类基因组计划完成为标志，机模拟的方式，将所获得的蛋白质结构riseandresearchofBioinformaticstechnology，the经历了两个历史时代，即测序基因组时代或功能性基因信息直接

5、用于新药物的筛manneroflifescienceresearchwillundergoesa和功能基因组时代。其研究重点主要体现选，如磷脂酶A2抑制药物的筛选；另一profoundswitch．在基因组学（Genomics）和蛋白组学方面，也可以将所获得的蛋白质结构或功Keywords（Proteomics）两方面。具体说，是从核酸能性基因信息加以分析，直接涉及出可能Bioinformatics；genomics；HumanGenomeProject和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结的药物，最后经人工合成或其它方法获得（HGP）构与功能的生物信息。其研究内容主

6、要包实际药物，这一方法已应用于反义寡核苷括：（1）新基因的发现与鉴定；（2）完整酸药物的研制。显而易见，正是由于生物生物信息学是在生命科学的研究中以基因组的比较研究；（3）大规模基因功能信息学的介入，使得药物研究在药物靶点计算机为工具对生物信息进行储存、检索表达谱的分析；（4）生物大分子的结构模发现、药物筛选和药物设计等方面产生了和分析的一门新兴的交叉学科。它是当今拟与药物设计；（5）非编码区信息结构分巨大的变革，不仅减少了前期研究和开发生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，析；（6）遗传密码起源和生物进化的研究。的盲目性，更有效缩短了药物研发周期，同时也将是21世

7、纪自然科学的核心领域之目前，基因组学的研究出现了几个重节约了大量的人力、物力。一。心的转移：将已知基因的序列与功能联系就人类基因组来说，得到序列仅仅是生物信息学萌生于计算机初创期。随在一起的功能基因组学研究；从作图为基第一步，后一步的工作是所谓后基因组时着人类基因组计划的实施，有关核酸、蛋础的基因分离转向以序列为基础的基因分代的任务，即收集、整理、检索和分析序白质的序列和结构数据呈指数增长。面对离；从研究疾病的起因转向探索发病机列中表达的蛋白质结构与功能的信息，找巨大而复杂的数据，运用计算机管理数据、理；从疾病诊断转向疾病易感性研究。生出规律。目前一般意义上的生