生物信息学现状及我国海洋生物信息学应用展望

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1、!研究综述研究综述"#$"%&!"#$"%&生物信息学现状及我国海洋生物信息学应用展望!"#"$%&’()&)*’&+,#")-%#*.)"%#//0)-#")&*"&,#+)*1()&0&23&("&董波，相建海（&)中国科学院海洋研究所，青岛"**#+&；")中国科学院研究生院，北京&###,-）中图分类号：.,,"；.&+%)’,文献标识码：/文章编号：&###0,#-*1"##$2#&0##’"0#’&生物信息学的产生背景人。另外，生物学数据的积累并不仅仅表现在GH/序列方面，与其同步的还有蛋白质的一级结构，即氨基"&世纪是

2、生命科学的世纪，人类在对客观世界酸序列的增长。截止"##,年,月，蛋白质序列数据库改造的同时，对自身的认识和改造的愿望越来越迫OQ8AA0RS

3、。这些海量数据的急速积累，在人构———脱氧核糖核酸的一个结构模型”I&J。GH/双螺类科学研究历史中是空前的。然而，数据并不等于信旋结构模型的建立，标志着人类在揭示生命遗传奥秘息和知识，数据的积累也不等于知识的增长，但它却方面迈出了具有里程碑意义的一步(并为人类认识是信息和知识的源泉，关键在于如何从中挖掘它们。自身提供了可能。&-%*年GK9?LCC

4、年*月"*日，被誉为生命“阿波罗登信息科学、数学和具有强大数据处理功能的计算机技月计划”的人类基因组计划，经过美、英、日、法、德和术。目前随着计算机储存数量和数字处理速度飞速增中国科学家的艰苦努力，约,#亿碱基对的测序已经长，使处理“海量”的基因组和蛋白组研究产出的数据完成，这是人类科学史上一个里程碑式的事件。"##,及相关的大量生物信息成为可能，并在此基础上直接年$月&$日，人类基因组计划项目负责人弗朗西斯推动了生物学向深度、广度和整体系统发展和延伸，·柯林斯博士宣布，人类基因组序列图绘制成功，人这样就诞生了一门崭新的学科———生

5、命科学和信息类基因组计划的目标全部实现。这一计划的成功实施处理科学的重大交叉前沿学科：生物信息学。极大地鼓舞了世界各国的生物学家，并为其它生物的研究工作提供了强大的技术支持。到目前为止，其它模式生物基因组的测序工作进展也极为迅速，约&&’种生物的基因组测序工作已经完成，其中包括&*种古细菌，%$种细菌和&’种真核生物。正在进行的基因组测序包括"+&种原核生物，&’"种真核生物。基因组收稿日期："##,0#%0#’；修回日期："##,0&&0&’测序工作获得了大量核酸数据，存储在美国4L=M7=N基金项目：国家重点基金项目1,#",#

6、"%#23国家重点基础研的核酸碱基数目以指数形式增长，大概每&$个月就究发展规划-+,项目（4&---#&"##+）翻一番。截止"##,年,月，登录在4L=M7=N数据库中作者简介：董波1&-+,02，男，辽宁东沟人，助理研究员，博的GH/序列总量已超过"##亿碱基对。基于CGH/测士生，研究方向：海洋生物技术，电话：#’,"0"%-%’*%，50序所建立起来的5OP数据库其纪录已达&’%-万条。6789:;<=>?<@6A)B;8<)7C)C=；相建海，通讯作者，506789:并且可以预计，今后GH/序列数据的增长将更为惊DEF8

7、7=>@6A)B;8<)7C)C=。万方数据’"海洋科学!"##$年!第"%卷!第&期!研究综述"#$"%&/生物信息学的定义和主要研究内容来一直非常重视生物信息学的发展，各种专业研究机构和服务公司如雨后春笋般涌现出来，生物科技公司早在3869年美国田纳西州盖特林堡召开的首次和制药工业内部的生物信息学部门的数量也与日俱“生物学中的信息理论研讨会”上便产生了生物信息增。美国洛斯阿拉莫斯国家实验室38:8年就已经建学的雏形。在随后的/4余年间始终没有得到足够的立起?&%;"%D数据库，于3800年成立了国家生物技重视和发展，到了八九十年

8、代伴随着计算机技术的迅术信息中心即2E;F，进行生物信息学的研发。3888猛发展，生物信息学才获得了突破性进展。380:年，年，在国家卫生研究院（2FG）的建议下，美国又建立了被誉为“生物信息学之父”的林华安博士首先使用/4个生物计算