长牡蛎遗传结构分析及高糖原含量新品系的甲基化调控机理初探.pdf

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1、学校代码：10264研究生学号：M150150255上海海洋大学硕士学位论文长牡蛎遗传结构分析及高糖原含量题目：新品系的甲基化调控机理初探Geneticstructureanalysisandprimary英文题目：explorationofmethylationmechanismregulationofhighglycogencontentnewstrainonPacificoyster,Crassostreagigas渔业专业：长牡蛎遗传育种研究方向：任晶莹姓名：杨建敏、王卫军指导教师：上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注孙卫明烟台大学教授主席刘

2、永胜烟台市水产研究所研究员委员王晓通鲁东大学教授委员张超山东省海洋资源与环境研究院秘书山东省海洋资源与环境研究院答辩地点答辩日期2018-5-18二楼会议室上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用

3、学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文长牡蛎遗传结构分析及高糖原含量新品系的甲基化调控机理初探摘要长牡蛎(Crassostreagigas)，又称太平洋牡蛎(Pacificoyster)，是我国重要海水养殖品种，也成为相关研究者的研究热点。本研究主要研究结

4、果如下所示：1.长牡蛎多代近交与自交遗传差异及生长性状比较分析大多数长牡蛎是雌雄异体，雌雄同体的长牡蛎比较少见，但雌雄同体后代能正常存活。为了解长牡蛎多代近交和自交家系的遗传多样性、遗传结构和生长情况，本研究选用长牡蛎近交4代(F4代)、近交5代(F5代)家系和雌性同体自交1代(自交1代)家系，采用8对多态性高的微卫星序列进行分析，同时对其成体的三个时间点生长数据进行了显著性差异分析。实验结果表明，8对微卫星位点在野生对照组中表现出较高的多态性，F4代、F5代和自交1代3个家系的遗传多样性明显下降，平均等位基因数(Na)由17.00下降到2.00，平均观测杂合度(Ho)由0.

5、538下降到0.449，平均多态信息含量(PIC)由0.826下降到0.297；哈迪-温伯格平衡(HWE)检验结果显示，8个位点在三个家系和野生对照组中均不同程度偏离HWE平衡(P<0.062)。F4代、F5代、自交1代和野生对照的生长性状指标分析表明，和野生对照相比，三个家系生长指标明显提高，对于自交一代而言，与自交实验组亲本选择的偶然性有关。同时，三个家系三个时间点的壳长、壳宽生长性状没有显著性差异(330日龄壳宽和630日龄壳长除外)，F5代生长性状指标壳高和湿重均大于F4代和自交1代，且差异显著；但F4代和自交1代之间没有显著性差异。通过本研究发现，F5代可以继续用来

6、进行生长性状新品系的选育，自交1代尽管多样性降低，但对成体的生长性状影响不明显，因此雌雄同体牡蛎可以用做实验材料进行相关性状的选育。2.基于MethyRAD技术的长牡蛎糖原含量性状的全基因组甲基化分析随着牡蛎基因组的组装成功，牡蛎基因、功能、表型的研究将进入一个新的阶段。长牡蛎糖原含量是重要的经济性状，它不仅影响牡蛎的品质风味，而且对I上海海洋大学硕士学位论文牡蛎的抗逆性、存活率等都有一定的影响。本研究以分别养于崆峒岛海域(KTD)和乳山海域(RS)两个海域的四个家系牡蛎为研究对象，对养于两个海域的同一家系间糖原含量进行分析，发现之间有显著性的差异。本研究对长牡蛎性腺全基因组

7、甲基化水平进行分析，从表观遗传学的角度初步探讨了可能与牡蛎糖原含量相关的调控机制。研究结果发现，(1)长牡蛎甲基化主要以CpG二核苷酸甲基化形式为主。甲基化位点主要发生在外显子和内含子功能元件上，基因间区和基因上游2000bp甲基化水平次之，3’、5’非翻译甲基化水平较低；不同海域相同家系的甲基化位点一致性较好，一定程度上证明了甲基化是可以遗传的。(2)四个家系共同差异甲基化位点涉及的基因主要集中在牡蛎的免疫、能量代谢和信号传导的基础性活动，推测环境可能通过影响牡蛎的基础性活动从而造成个体间的生理特征差