缢蛏选育系生长参数估计和α-淀粉酶基因外显子区域SNPs筛选及生长关联分析.pdf

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1、学校代码:10264研究生号:M150150317上海海洋大学硕士学位论文缢蛏选育系生长参数估计和α-淀粉酶基因外显子区题目:域SNPs筛选及生长关联分析HeritabilityestimatesandSNPsdetectionofalphaamylaseexonregionanditsassociationwithgrowth英文题目:traitsaboutselectedlineofSinonovaculaconstricta专业:渔业研究方向:贝类遗传育种姓名:李浩指导教师:沈和定二O一八年五月上海海洋大学学

2、位论文原创性声明本人郑重声明:我恪守学术道德,崇尚严谨学风。所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写,我对所写的内容负责,并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅或借阅。本人授权上

3、海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□,在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名:指导教师签名:日期:年月日日期:年月日上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注杨云锋清华大学教授主席周树学复旦大学教授委员来琦芳东海水产研究所研究员委员杨金龙上海海洋大学教授委员梁萧上海海洋大学讲师秘书答辩水产与生命学院答辩2018-5-20地点A211日期上海海洋大学硕士学位论文缢蛏选育系生长参数估计

4、和α-淀粉酶基因外显子区域SNPs筛选及生长关联分析摘要缢蛏(Sinonovaculaconstricta)广泛分布于我国沿海地区,是我国四大海产贝类之一,随着种质资源的退化以及海区环境的恶化,本实验室从2008年起一直以选择强度2.063、壳长为选择指标的条件下对浙江乐清群体进行选择育种,经过连续数代的选育工作获得缢蛏快长选育系群体。为了评估选择指标稳定遗传的能力,采用平衡巢氏设计方法,按照1雄配2雌的方式,构建缢蛏7个半同胞家系和14个全同胞家系,分别测定各个家系60日龄、90日龄及150日龄的壳长、壳高。雄内

5、雌间半同胞个体间具有较大的变异程度,存在显著的母性效应,故以父系半同胞组内相关法计算的狭义遗传力为缢蛏快长选育系生长性状遗传力的无偏估计值。60日龄、90日龄和150日龄壳长的狭义遗传力分别为0.298、0.541、0.574;60日龄、90日龄和150日龄壳高的狭义遗传力分别为0.139、0.519、0.518。壳长和壳高在3个日龄的遗传力属于中等遗传力水平,显示出较高的选择育种潜力。缢蛏幼贝壳长、壳高两个指标间的遗传相关和表型相关均为正相关(P<0.05)。60日龄、90日龄和150日龄壳长-壳高性状间遗传相关

6、系数分别为0.980、0.755、0.942,表型相关系数分别为0.910、0.882、0.912。表明缢蛏幼贝期以壳长或者壳高作为选育参数进行选择育种,可达到改良缢蛏快长选育系生长性状的效果。α-淀粉酶(Alphaamylase)是广泛存在于生物体内的消化酶,主要参与生物体内碳水化合物的代谢,为生物体提供维持生命、生长发育和繁殖所需的能量。为研究α-淀粉酶基因外显子与缢蛏(Sinonovaculaconstricta)生长性状的相关性,实验采用PCR产物直接测序比对获得18个候选SNPs位点,分别为:Rs-1:4

7、8G/C、Rs-2:247C/A、Rs-3:420A/G、Rs-4:441C/T、Rs-5:537G/T、Rs-6:837G/T、Rs-7:936A/G、I上海海洋大学硕士学位论文Rs-8:952A/C、Rs-9:1047T/G、Rs-10:1062C/T、Rs-11:1287C/T、Rs-12:1350A/C、Rs-13:1362C/T、Rs-14:1371C/T、Rs-15:1503T/C、Rs-16:1536T/C、Rs-17:1737T/C、Rs-18:1788C/T。随机选取同批繁殖、同塘养殖的缢蛏选育系

8、群体,运用MassARRAY质谱检测方法进行SNPs位点的分型。结果显示:除Rs-13位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),Hardy-Weinberg平均值为0.581;多态信息含量平均值为0.237。基因型与生长性状的关联性分析结果表明:Rs-5:537G/T与Rs-10:1062C/T位点各个基因型个体之间部分性状存在

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