伯氏肩孔南极鱼的种群遗传分析和南极鱼亚目的系统进化.pdf

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1、学校代码：10264研究生学号：M150110174上海海洋大学硕士学位论文题目：伯氏肩孔南极鱼的种群遗传分析和南极鱼亚目的系统进化英文题目：StudyonphylogeneticofNotothenioideiandgeneticdiversityofTrematomusbernacchiipopulations专业：生物学研究方向：种质资源与种群遗传姓名：赵娜指导教师：马凌波二O一八年五月二八日上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指

2、导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印

3、或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注赵金良上海海洋大学教授主席宋炜水科院东海所副研究员委员蒋科技水科院东海所副研究员委员研究实习赵明水科院东海所秘书员水科院东海所6号楼三楼会答辩答辩地点2018.5.19议室日期上海海洋大学硕士学位论文伯氏肩孔南极鱼的种群遗传分析和南极鱼亚目鱼类的系统进化摘要南极鱼亚目鱼类是南极鱼类中物种最为丰富的的

4、类群，属于鲈形目（Perciformes），是用于研究的良好材料，由温带地区营底栖生活的的鱼类祖先进化而来。伯氏肩孔南极鱼(Trematomusbernacchii)属于鲈形目(Perciformes)、南极鱼亚目(Notothenioidei)、南极鱼科(Nototheniidae)，是一种广泛分布于南极附近的适应寒冷环境的鱼类，尽管个体较小，数量有限，但因其在寒冷机制的适应性和自适应辐射研究中具有重要的科学研究意义和经济价值为全球所关注。本文采用线粒体细胞色素b基因和细胞色素氧化酶I基因联配分析了5个

5、群体(罗斯海LSH、凯西站KXZ、长城站CCZ、戴维斯站DWSZ和中山站ZZZ)，探讨其遗传多样性、种群结构，以及种群的演化历史，以期为伯氏肩孔南极鱼的有效管理和合理开发利用提供基础的数据支撑；同时也将现有的经过形态鉴定的南极鱼亚目鱼类COI基因集合分析了南极鱼科和鳄冰鱼科尾形码的适用性，以及将较为全面的南极鱼亚目的南极鱼科与鳄冰鱼科鱼类进行了系统进化关系分析。主要内容如下：1.伯氏肩孔南极鱼的遗传多样性及演化历史研究：COI和Cytb分析选择mt-DNA的COI和Cytb基因序列联配分析的方法，标记分析

6、I上海海洋大学硕士学位论文了伯氏肩孔南极鱼(Trematomusbernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性，遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体序列中共检测到42种单倍型。与其它分布于南大洋的鱼类相比，伯氏肩孔南极鱼有着相似的遗传多样性特征，即较高的单倍型多样性(Haplotypediversity，H=0.8660.030)和较低的核苷酸多样性(Nucleotidediversity，Pi=0.002530.00054)，A+T碱基含

7、量为53%，G+C碱基含量为47%。伯氏肩孔南极鱼种群间的平均遗传距离为0.3%，分子变异分析(AMOVA)结果显示，组群间的变异为4.65%(P<0.05)，群体内的为95.35%(P<0.05)，基于单倍型构建的进化树的结果均表明伯氏肩孔南极鱼群体不具有明显的地理谱系结构。中性进化分析表明伯氏肩孔南极鱼群体在192.61万年前（大约更新世时期）经历过快速扩张时期。分子方差分析和Fst表明伯氏肩孔南极鱼的遗传变异主要来自种群内的个体之间，极少数遗传变异来自于群体之间。研究结果显示了南极地区的5个采样点之

8、间具有一定的基因交流，是一个随机交配的群体。2.基于线粒体COI基因序列对南极鱼亚目系统进化的研究本文采用COI基因简并引物对25种63尾南极鱼类DNA进行扩增测序，并结合GenBank已有序列进行联配分析，对南极鱼2科16属23种共58尾COI基因片段（539bp）进行序列比较和系统发生关系研究，探索了DNA尾形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性与可行性以及各个物种之间的系统进化关系。结果分析表明，25种南极鱼科和鳄冰