阴道细菌群落多样性及外阴阴道念珠菌病相关白念珠菌基因多态性研究

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1、博士学位论文学校代码：10023学号：B2010017001阴道细菌群落多样性及外阴阴道念珠菌病相关白念珠菌基因多态性研究所院：皮肤病研究所姓名：李彩霞指导教师：刘维达导师小组：龚向东李岷王洪生吕桂霞学科专业：皮肤病与性病学研究方向：医学真菌学完成日期：2013年5月DoctoralDissertationStudyonthebacterialcommunitiesinvaginaandgeneticpolymorphismsofCandidaalbicansassociatedwithvulvovagin

2、alcandidiasisByLiCaixiaUnderthesupervisionofProf．WeidaLiuInstituteofdermatologyPeakingUnionMedicalCollege&ChineseAcademyofMedicalScienceMay,2013北京协和医学院博士学位论文目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．1英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．3前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．5第一部分454焦磷酸测序研究健康女性阴道菌群多样性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一9第二部分南京地区妇女外阴阴道念珠菌病的分子流行病学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯．27第三部分妊娠期外阴阴道念珠菌病相关白念珠菌基因多态性的研究⋯⋯⋯⋯．40全文小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．7l全文参考文献一览⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．73综述1阴道菌群多样性研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯79综述2白念珠菌基因分型方法的研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯．89综述3RespiratoryinfectionscausedbyTrichosporonspecies⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯98附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯109学位论文原创性声明和授权使用说明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11l参加学术会议⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯113在读期间发表论文⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯115致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯117北京协和医学院博士学

5、位论文中文摘要第一部分454焦磷酸测序研究健康女性阴道细菌群落多样性目的了解正常女性阴道微环境中各种细菌的种类和丰度。方法采集20例健康志愿者的阴道分泌物标本，直接提取基因组DNA，使用细菌16SrRNA通用引物扩增V1．V3区，产物进行焦磷酸测序。对测序数据进行有效数据统计，评估样本中的菌群的丰度和多样性，对菌群进行门、纲、目、科、属、种六个水平的分类学比较。结果20个样本中共检测到有效序列115329条，平均每个样本5766条，序列平均长度477bp。经聚类比对，共生成2363个操作分类单元。在门的水平

6、共检测到了6个门，其中以硬壁菌门为最多。在60个属中，乳杆菌属占绝大多数，平均含量在90％以上。而种的水平上，L．crispatus是最常见的菌种，其他种的乳杆菌少见。结论健康女性阴道菌群以乳杆菌为主，且L．crisputs是最常见的组成部分。第二部分南京地区妇女外阴阴道念珠菌病的分子流行病学研究目的了解南京地区引起外阴阴道念珠菌病的白念珠茵的优势基因型，比较不同年龄、不同生理状态下白念珠菌基因型分布是否存在差异。方法收集2011年12月至2012年04月在南京市妇幼保健医院就诊的外阴阴道念珠菌病病例，获取

7、患者的临床资料和阴道分泌物标本。分泌物均经镜检、培养纯化及分子生物学鉴定。对鉴定为白念珠菌的菌株基因组DNA使用CAI微卫星标记进行扩增，产物经毛细管电泳后用ABI3700测序仪扫板后分析。结果共收集外阴阴道念珠菌病例246例，微卫星标记成功扩增了208株白念珠菌DNA，共检测到了51种基因型。其中占前三位的基因型分别是30：45，21：21和32：46，分别占所检测样本的29．3％、13．0％和12．O％。妊娠人群中主要的基因型是46：46、32：46和21：21，妊娠人群白念珠菌基因型与非妊娠人群分布存

8、在差异。各年龄组间白念珠菌基因型分布未见明显差异。结论南京地区外阴阴道念珠菌病相关的白念珠菌基因型分布有着独特的分布特征。妊娠人群的基因型分布与非妊娠人群相比具有显著性差异。而年龄与基因型分布无关。第三部分妊娠期外阴阴道念珠菌病相关的白念珠菌基因多态性的研究目的了解引起妊娠妇女外阴阴道念珠菌病的白念珠菌基因型分布情况。方法收集中后期妊娠外阴阴道念珠菌病患者的阴道分泌物样本，经培养鉴定为白念珠菌后提取基因组DNA。