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《欧洲黑杨基因资源材性关联基因的snp分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、HEREDITAS(Beijing)2008年6月,30(6):795―800ISSN0253-9772www.chinagene.cn研究报告DOI:10.3724/SP.J.1005.2008.00795欧洲黑杨基因资源材性关联基因的SNP分析122丁明明,黄秦军,苏晓华1.国家林业局国有林场和林木种苗工作总站,北京100714;2.中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室,北京100091摘要:以115个欧洲黑杨(PopulusnigraL.)无性系为材料,利用TaqMan技术分析了欧洲黑杨基因资源参与木质素和纤维素合成的酶(4CL、P
2、AL和CesA2)的单核苷酸多态性,并对分型的SNPs与木材材性性状(物理性状：基本密度、纤维长、纤维宽、微纤丝角;化学性状:木质素含量、纤维素含量、α纤维素含量等)进行了相关分析。结果如下:(1)在对4CL、PAL和CesA2等3个基因进行检测时,共获得27个SNPs标记,对其中转换(A-G,C-T)有17个位点,颠换(A-C,G-C,G-T,A-T等)有10个位点;(2)对其中的3个SNPs进行了分型,分别记作SNP1、SNP2和SNP3;(2)对已经分型SNPs位点与材性性状进行方差分析,结果显示,3个SNPs中只有SNP1与4年生欧洲黑杨综纤维素含量
3、显著相关,表现为负效应,贡献率为11.11%;(3)对欧洲黑杨4CL基因的SNP1标记的不同基因型所对应的材性性状进行方差分析,结果显示基因型为CC和CT的欧洲黑杨相对于基因型为TT的欧洲黑杨有较高的纤维素含量。关键词:欧洲黑杨;材性;单核苷酸多态性AnalysisonSNPslinkedwithwoodpropertiesofPopulusnigraL.generesources122DINGMing-Ming,HUANGQin-Jun,SUXiao-Hua1.GeneralAdministrationofStateForestFarms,Treeseed
4、sandseedlings,SFA,Beijing100714,China;2.TheResearchInstituteofForestry,CAFLaboratoryofTreeBreedingandCultivation,SFA,Beijing100091,ChinaAbstract:Inthisstudy,115PopulusnigraL.collectedfromEuropewereusedasmaterials.TheyweredetectedforSNPsofgeneslinkedwithligninandholocellulose(4CL,PA
5、LandCesA2)byTaqMantechnologyandcorrelationsbetweenSNPsandwoodproperties(thewoodspecielygravity,fiberlength,fiberwidth,microfibreangle,lignin,holocellulosecontentandα-Cellulosecontent)werealsostudied.resultsshowedthat(1)27SNPswereobtainedinthegenes,suchas4CL,PALandCesA2associatedwit
6、hligninsynthesis.Amongthem,17SNPsweretransition(A-G,C-T),10SNPsweretransversion(A-C,G-C,G-T,andA-T).(2)ThreeoftheSNPswerediscriminated,asignificantnegativecorrelationbetweenholocellulosecontentoffour-yearoldP.nigraandSNP1wasdetected,andcontributionratiowas11.11%.SNP2andSNP3hadnosig
7、-nificantcorrelationwithwoodproperties.(3)WoodpropertiesofvariousgenotypesofSNP1weresignificantlydifferent.CCandCTgenotyperelativetoTTgenotypehadlargerholocellulosecontent.SNP1wouldbeanefficientmarkertochoose收稿日期:2007−11−23;修回日期:2008−01−23基金项目:国家“十一五”科技支撑计划课题(编号:2006BAD01A15)和国家高技术
8、研究发展“863”计划课题(编号:2006AA100
