巴西橡胶树磷脂酰肌醇转移蛋白cdna的克隆及其序列分析

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1、基因组学与应用生物学，2010年，第29卷，第1期，第164—169页GenomicsandAppliedBiology，2010，go1．29，No．1，164—169数据分析AnAnalysis巴西橡胶树磷脂酰肌醇转移蛋白eDNA的克隆及其序列分析罗明武邓柳红1海南大学材料与化工学院，海口，570228；2中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海口，5711O1通讯作者，dengliuhong168@163．com摘要本文从巴西橡胶树Heveabrasiliensis)差减eDNA文库中筛选到一个与磷脂酰肌醇转移蛋(~(phos．phatidylinositoltransferprot

2、ein)同源性较高的基因片段，并根据该基因片段序列信息，设计特异性引物，采用eDNA末端快速扩增技术RACE(rapidamplificationofeDNAends)进行差异片段的5’和3’端的扩增，并获得长度为1081bp的全长eDNA克隆R291(GenBank登陆号：AY589690)。序列分析表明，该基因包含702bp的开放阅读框，编码234个氨基酸，推测其蛋白质的分子量为26．8kD，等电点为6．51，有一个的跨膜螺旋区(氨基酸位点为83-103)。R291基因含有一个脂质结合保守区(Secl4p．1ikelipid—bindingdomain)，具有CRAL—TRIO脂质结合

3、结构域，推测该基因是一个磷脂酰肌醇转移蛋白基因。该基因的克隆将为橡胶树磷脂酰肌醇代谢的研究奠定了基础，将有助于进一步了解磷脂酰肌醇代谢与胶乳再生之间的关系。关键词巴西橡胶树，胶乳，磷脂酰肌醇转移蛋白，RACE，序列分析CloningandSequenceAnalysisofPhosphatidylinositolTransferProteincD—NAfromHeyeabrasilensisLuoMingwuDengLiuhonglCollegeofMaterialsScienceandChemicalEngineering，HainanUniversity，Haikou，570228；2

4、InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnologyChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences，Haikou，571101Correspondingauthor，dengliuhong168@163．comDOI：10．3969／gab．029．000164AbstractInthispaper，aeDNAclonewasisolatedrelatedtolipidtransportationandmetabolismbyscreeningofasubtractedlatexeDNAlibraryofHev

5、eabrasiliensis．Accordingtoitssequencesinformation，anovelfull—lengtheDNAtermedR291(GenBanknumber：AY589690)wasobtainedbyusingrapidamplificationofeDNAends(RACE)．R291was1081bplongcontaininga702bpORF，encoding234aminoacidswithatheoreticalmolecularweightof26．8kDandanisoelectricpointof6．51．Inaddition,hydr

6、opathyandtransmembranemotifanalysisofde—ducedaminoacidsequencesindicatedthatR291possessedatransmembranespanningdomain(fromtheaminoacidsitefrom83to103)．TheresultoftheconserveddomainsanalysisdemonstratedthatR291hadaSecl4p—likelipid—bindingdomainandaCRAL／TRIOregion．MultialignmentpresumedthatR291might

7、beaphosphatidylinos—itoltransferproteingene．ThecloningofthisgenewouldestablishthebasicformetabolisimofHeveabrasiliensisphosphatidylinositol，andwouldhelptofurtherunderstandrelationbetweenmetabolisimofphosphatidyli