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《16srrna在海洋微生物系统分子分类鉴定及分子检测中的应用》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、第23卷第1期海洋水产研究Vol.23,No.12002年3月MARINEFISHERIESRESEARCHMar.,2002文章编号:1000-7075(2002)01-0058-06·综述·16SrRNA在海洋微生物系统分子分类鉴定及分子检测中的应用洪义国孙谧张云波李勃生(中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071)摘要16SrRNA序列分析作为微生物系统分类的主要依据已得到广泛认同,随着微生物核糖体RNA数据库的日臻完善,该技术成为细菌分类和鉴定的一个有力工具。本文总结了16SrRNA作为海洋微生物系统分子分类鉴定的理论基础和具
2、体方法,分析了用16SrRNA研究海洋微生物的进化关系,并且对16SrRNA在海洋微生物分子检测中的应用作一评述。关键词16SrRNA海洋微生物分子分类鉴定分子检测+中图分类号:Q939;Q522.3文献识别码:ATheapplicationof16SrRNAinmolecularclassification,identificationandmolecularexaminationinmarinemicrobicsystemHONGYi-guoSUNMiZHANGYun-boLIBo-sheng(YellowSeaFisheriesRese
3、archInstitute,Qingdao266071)ABSTRACTThetheoreticalbaseanddetailedmethodof16SrRNAapplicationinmolecularclassification,identificationandexaminationinmarinemicrobicsystemweresummarized.Theevolutionalrelationshipofmarinebacteriastudiedwith16SrRNAwasanalyzed,theapplicationof16Sr
4、RNAtomolecularexaminationofmarinemicrobewasreviewed.KEYWORDS16SrRNAMarinemicrobeMolecularclassificationandidentificationMolecularexamination随着分子生物学和分子遗传学的飞速发展,16SrRNA在海洋微生物学的研究中起到越来越重要的作用,作为海洋微生物系统分类和有害海洋微生物的分子检测的主要依据已得到广泛认同。随着微生物核糖体RNA数据库的日臻完善,该技术成为海洋细菌分类和鉴定的一个有力工具。本文对16Sr
5、RNA在海洋微生物系统分子分类鉴定及分子检测中的应用作一评述,同时分析该技术在应用中存在的问题。116SrRNA同源性分析对海洋微生物进行系统分子分类鉴定国家“863”项目(863-819-06-01)资助收稿日期:2001-10-19;接受日期:2001-12-20第1期洪义国等:16SrRNA在海洋微生物系统分子分类鉴定及分子检测中的应用591.116SrRNA同源性分析作为海洋微生物系统分子分类鉴定的理论依据目前从陆地微生物分离到的生物活性产物大部分是结构已知的化合物,而海洋微生物作为药物和酶制剂等的新来源正受到越来越多的关注。但对大量
6、菌种的分类鉴定是一项繁琐、费时的工作,而且由于海洋独特的环境,包括高盐、高压、低营养、低温等,造就了海洋微生物有别于陆地微生物的诸多特异性(如不易培养,形态多变且在保藏和移种过程中很容易死亡等)而导致对它们种类区分的困难(Robina1968),有碍于海洋微生物研究和开发的深入,因此迫切需要建立一种简单、方便、易于操作的分类鉴定方法对海洋微生物进行分析,使人们在一定程度上更科学、更精确、更快速地找到海洋微生物的分类地位,为海洋微生物资源的开发利用奠定基础。传统的细菌系统分类的主要依据是形态特征和生理生化性状,采取的主要方法是对细菌进行纯培养分
7、离,然后从形态学、生理生化反应特征以及免疫学特性加以鉴定。本世纪60年代开始,分子遗传学和分子生物学技术的迅速发展使细菌分类学进入了分子生物学时代,许多新技术和方法在细菌分类学中得到广泛应用。目前,rRNA分子己成为一个分子指标(Delong1982),广泛地用于各种微生物的遗传特征和分子差异的研究,加上大量已知微生物的DNA都被测定并输入国际基因数据库,成为对微生物鉴定分类非常有用的参照系统,从而可以通过对未知微生物DNA序列的测定和比较分析,达到对其进行快速、有效的鉴定分类的目的。核糖体的RNA含有3种类型:23S、16S和5SrRNA,
8、它们分别含有的核苷酸约2900、1540和120个。60年代末,Woese开始采用寡核苷酸编目法对生物进行分类,他通过比较各类生物细胞的核糖体RNA(rRNA)特征
