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《拟南芥cbf4 基因位点的单核苷酸多态性(snp)变化 与抗旱表型的相应性》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2004,12(2):122~131·研究论文·拟南芥基因位点的单核苷酸多态性(SNP)变化与抗旱表型的相应性*1，221，2233郝岗平吴忠义陈茂盛曹鸣庆DominiqueBrunnelGeorgesPelletier黄丛林2**杨清1**(1.南京农业大学生命科学学院,南京210095;2.北京农业生物技术研究中心,北京100089;3.GénétiqueetAmélionrationdesPlantes,INRA,78026,France.)摘要：以生长于不同生态气候条件
2、下的17个拟南芥()核心生态型为材料，分析了它们的相对抗旱性和抗旱转录因子基因的单核苷酸多态性(SNP)。结果表明，不同的拟南芥生态型具有差异明显的抗旱性。与拟南芥Columbia生态型相比，25av、203av和244av生态型的基因位点具有高密度的SNP和插入/缺失(Indel)，多态性的频率为每35.8bp1个SNP，每143bp1个Indel。Tajima'SD统计学检验结果显示各区域都不显著，说明该区域核苷酸变化符合中性突变假说，较高的核苷酸多样性是净化选择的结果。基因非编码区的多态性是编码区的4倍，表明编码区承受着更大的选择压力。在编码区，SNP的
3、频率为每96.4bp1个SNP，其中1034位(以GenBankNo.AB015478序列第19696位的核苷酸为1)碱基变化：G圮T，引起第205位氨基酸变化：gly圮val。而203av形成的haplotype6具有4个特异的SNP变化，其中5′端非编码区3个：27位的A圮G，129位的A圮C，171位的G圮A；3'端非编码区1个：1106位的A圮C。抗旱性鉴定结果表明203av拟南芥是抗旱性最强的一个生态型,研究认为haplotype6与它较强的抗旱性表型相应。关键词：基因；单核苷酸多态性；抗旱性状SingleNucleotidePolymorphism
4、sofLocusRegionofCorrespondtoDroughtToleranceHAOGang-Ping1,2WUZhong-Yi2CHENMao-Sheng1,2CAOMing-Qing2DominiqueBrunnel3321GeorgesPelletierHUANGCong-Lin**YANG-Qing**(1.CollegeofLifeScience,NanjingAgricuturalUniversity,Nanjing210095,China;2.BeijingAgro-biotechnologyResearchCenter,Beijing
5、100089,China;3.GénétiqueetAmélionrationdesPlantes,INRA,78026,France)Thelevelsofdroughttoleranceandnucleotidepolymorphismatlocusinaworldwidesampleof17coreaccessionsofwereexamined.Theresultsshowedthatdifferentaccessionshadquitedifferenceinadaptationtodroughtstress.ComparedwithColumbia
6、,thefrequencyofnucleotidepolymorphismatthelocusof25av、203avand244avof,includingsinglenucleotidepolymorphism(SNP)andinsertion/deletion(Indel),washigh,onaverage1SNPper35.8bpand1Indelper143bp.NS(nosignificance)inallregionsofTajima′Dresultindicatedthattheneutralmutationhypothesiscouldex
7、plainthenucleotidepolymorphisminthisgeneregion.Thehigherpolymorphismwastheresultofpurificationselection.Nucleotidepolymorphisminnon-codingregionwasthreetimeshigherthanthatincodingregion.Thisresultmightindicatearecentrelaxationoftheselectionpressuresonnoncodingregionofgene.Incodingre
8、gionof,SNPfrequency
